酶是一類重要的生物催化劑,在科研、診斷、醫(yī)藥、食品、化工等領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用價值。但由于大多數(shù)天然的酶存在性能局限性,大大限制了實際的生產(chǎn)應(yīng)用。為滿足實際應(yīng)用對酶的需要,酶的各種改造技術(shù)應(yīng)運而生。
酶改造技術(shù)是通過改變酶的基因序列,實現(xiàn)對生物化學反應(yīng)的調(diào)控和優(yōu)化,使其更適用于特定的應(yīng)用場景。酶改造包括理性設(shè)計,定向進化,機器學習等技術(shù),其中定向進化技術(shù)是最重要的酶改造技術(shù)之一,美國加州理工學院的Frances Arnold教授也因此獲得了2018年的諾貝爾化學獎。
圖1 .2018年諾貝爾化學獎獲得者
翌圣生物進化團隊傳承Frances Arnold教授的定向進化技術(shù),并在此基礎(chǔ)上將理性設(shè)計、定向進化與機器學習有機結(jié)合、交互篩選,構(gòu)建了一個高效、系統(tǒng)、創(chuàng)新型的酶改造平臺——ZymeEditor™。目前該平臺已完成130余種酶的改造,具備扎實的開發(fā)酶的技術(shù)基礎(chǔ)。此外,翌圣生物專注于工具酶研發(fā)生產(chǎn)近10年,在發(fā)酵及純化工藝開發(fā),規(guī)?;a(chǎn)等方面有豐富的經(jīng)驗,可以提供新酶改造,發(fā)酵及純化工藝優(yōu)化、規(guī)?;a(chǎn)的全套定制解決方案。
圖2.翌圣ZymeEditor™酶改造全套定制解決方案
新酶改造
翌圣ZymeEditor™酶改造平臺是通過酶的理性設(shè)計和定向進化雙策略來提高改造的成功率。理性設(shè)計技術(shù)基于酶的結(jié)構(gòu)-功能關(guān)系,借助多種計算和虛擬分析快速設(shè)計“小而精”的突變體庫,提升酶的性能;定向進化則依托液滴微流控分選和高通量自動化孔板篩選技術(shù)實現(xiàn)酶的超大突變文庫(108-1012)的快速篩選和功能驗證,提高了篩選成功率,縮短了進化周期并大幅度降低了篩選成本。平臺正在借助理性設(shè)計和定向進化輸出的海量濕實驗數(shù)據(jù)開展機器學習,借助AI技術(shù)建立酶改造相關(guān)的算法和模型,進一步提升酶改造的準確度。
圖3.翌圣ZymeEditor™創(chuàng)新酶改造平臺
發(fā)酵及純化工藝優(yōu)化
ZymeEditor™平臺輸出的突變體想要高質(zhì)量的生產(chǎn)出來,這需要開發(fā)發(fā)酵和純化工藝。為此,翌圣自主搭建了蛋白高密度發(fā)酵與UCF.ME®超潔凈純化平臺,該平臺涵蓋多宿主高效表達技術(shù)、高密度發(fā)酵技術(shù)、一體式高通量蛋白純化工藝篩選技術(shù)、UCF.ME®超潔凈分子酶生產(chǎn)技術(shù)等核心技術(shù),這為酶的規(guī)?;头€(wěn)定化生產(chǎn)制備提供了技術(shù)保障。
圖4.高通量蛋白純化工藝篩選技術(shù)
規(guī)?;a(chǎn)
為滿足高品質(zhì)酶量產(chǎn)的需求,翌圣特別在武漢建立2個GMP級別生產(chǎn)基地(近1萬平米),2套1500L的全自動發(fā)酵系統(tǒng),也匹配了專業(yè)的酶生產(chǎn)與質(zhì)檢團隊,為高品質(zhì)酶的規(guī)模化生產(chǎn)提供保障。
圖5:UCF.ME®超潔凈酶生產(chǎn)工廠
1.通過酶改造提高M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶的cDNA產(chǎn)量
圖6.通過改造M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶的RNA和DNA依賴的DNA聚合酶活性,cDNA產(chǎn)量比母本提高2倍以上。
2.通過酶改造提高Bst DNA聚合酶的熱穩(wěn)定性
圖7.通過改造Bst DNA 聚合酶的熱穩(wěn)定性,相比母本,突變體M22的Tm值提高了2.9℃,能耐受70℃
ZymeEditor™作為一個創(chuàng)新型底層酶改造技術(shù)平臺,它通過將超高通量定向進化、理性設(shè)計與AI技術(shù)有機結(jié)合、交互篩選,為創(chuàng)新開發(fā)高端酶奠定了技術(shù)基礎(chǔ)。基于翌圣生物多年在分子酶改造領(lǐng)域中的技術(shù)積累與知識拓展,ZymeEditor™平臺已具備對多種酶的多種需求(如活性,穩(wěn)定性,選擇性等)進行定向改造的能力,可通過提供全套酶改造服務(wù)助力酶相關(guān)產(chǎn)業(yè)(如合成生物學,醫(yī)藥、診斷,食品,化工等)升級。
圖8.ZymeEditor™酶改造定制服務(wù)
服務(wù)流程
圖9.ZymeEditor™酶改造定制服務(wù)流程
聯(lián)系方式