逆轉(zhuǎn)錄酶是逆轉(zhuǎn)錄的核心酶原料,被廣泛應(yīng)用于RT-PCR/qPCR、RNA-seq、單細(xì)胞測(cè)序等場(chǎng)景,但不同應(yīng)用場(chǎng)景對(duì)逆轉(zhuǎn)錄酶有不同的性能要求,如RT-qPCR,需要逆轉(zhuǎn)錄酶具有高靈敏度、高cDNA產(chǎn)量、可兼容復(fù)雜結(jié)構(gòu)模板等;在主流單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)中,還需要具有末端轉(zhuǎn)移酶活性;用于cDNA克隆則需要可以合成全長(zhǎng)的cDNA。目前市售的逆轉(zhuǎn)錄酶很難實(shí)現(xiàn)一酶兼具多種應(yīng)用場(chǎng)景,不同的應(yīng)用場(chǎng)景往往需要篩選不同的逆轉(zhuǎn)錄酶。
為實(shí)現(xiàn)一個(gè)逆轉(zhuǎn)錄酶可兼具多個(gè)應(yīng)用,翌圣ZymeEditor™酶改造平臺(tái)通過(guò)對(duì)M-MLV進(jìn)行定向改造獲得了性能全方面提升的全能型逆轉(zhuǎn)錄酶:Hifair® Ultra Reverse Transcriptase(Cat#14604ES),可兼具RT-PCR/qPCR、RNA-seq、單細(xì)胞測(cè)序、cDNA克隆和文庫(kù)構(gòu)建等多個(gè)應(yīng)用場(chǎng)景。
超高靈敏度:可對(duì)1pg Total RNA有效逆轉(zhuǎn)錄
快速逆轉(zhuǎn)錄:5 min即可完成cDNA合成
持續(xù)合成能力強(qiáng):無(wú)RNase H活性,最大合成長(zhǎng)度可達(dá)20 kb
高熱穩(wěn)定性:最高反應(yīng)溫度可達(dá)65℃,提升復(fù)雜結(jié)構(gòu)模板兼容性
TdT活性:可向合成的DNA 3′ 末端非模板特異性地添加核苷酸
RT-qPCR:優(yōu)異的靈敏度及批次間穩(wěn)定性
圖1. RT-qPCR檢測(cè)數(shù)據(jù),紅,藍(lán),綠分別表示14604ES的3個(gè)不同批次
分別投入5、50、500 ng的293T RNA,使用3個(gè)批次的14604ES在55℃逆轉(zhuǎn)錄5 min,逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物進(jìn)行qPCR檢測(cè),結(jié)果顯示14604ES的3個(gè)批次在各個(gè)投入量下,△Ct值均< 0.5,表明14604ES具有優(yōu)異的靈敏度及批次間穩(wěn)定性。
RNA-seq:高建庫(kù)產(chǎn)量,低低宿主DNA 殘留
圖2. 14604ES應(yīng)用于RNA-seq建庫(kù)產(chǎn)量
圖3.14604ES應(yīng)用于 RNA-seq測(cè)序質(zhì)量
應(yīng)用于RNA建庫(kù),14604ES的建庫(kù)產(chǎn)量高于進(jìn)口品牌,測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量相當(dāng)且宿主DNA殘留更低。
逆轉(zhuǎn)錄酶選擇指南
定位 |
產(chǎn)品名稱 |
產(chǎn)品貨號(hào) |
應(yīng)用于RT-LAMP |
Hifair® Ⅲ Reverse Transcriptase |
11111ES |
應(yīng)用于RNA-seq |
Hifair® IV Reverse Transcriptase |
11112ES |
應(yīng)用于RT-PCR/qPCR |
Hifair® V Reverse Transcriptase |
11300ES |
應(yīng)用通用型:RNA-seq、RT-PCR、單細(xì)胞測(cè)序等 |
Hifair® Ultra Reverse Transcriptase |
14604ES |
適用于10x Genomics及國(guó)產(chǎn)單細(xì)胞儀器平臺(tái) |
YeaCell™ 1st Strand Synthesis kit for Single Cell 3?RNA-seq |
13594ES |
注:翌圣逆轉(zhuǎn)酶系列均可提供高低濃度、無(wú)甘油等不同產(chǎn)品形式。