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      技術(shù)革新:聚焦翌圣生物熱啟動Taq酶雙封閉抗體

       

      非特異擴(kuò)增是PCR實(shí)驗(yàn)中的常見問題,非特異擴(kuò)增直接影響檢測結(jié)果的判讀并且會導(dǎo)致擴(kuò)增靈敏度下降,甚至目標(biāo)片段的得率下降等。此外,檢測試劑的穩(wěn)定性也是核酸檢測行業(yè)人格外關(guān)注的問題,不管是長期儲存穩(wěn)定性還是短期偏離正常保存條件的穩(wěn)定性,都直接影響檢測結(jié)果的有效性。

       

      翌圣生物科技(上海)股份有限公司(以下簡稱“翌圣生物”)匠心開發(fā)熱啟動Taq酶雙封閉抗體,通過同時(shí)封閉Taq酶的聚合酶活性及外切酶活性來有效提高擴(kuò)增的特異性及試劑的穩(wěn)定性。

      PART 01

      Taq酶雙封閉抗體封閉原理

       

      傳統(tǒng)的Taq DNA聚合酶抗體可以有效抑制Taq酶的聚合酶活性,從而避免錯(cuò)配或引物二聚體引起的非特異性擴(kuò)增。然而Taq酶除了具有5'→3'聚合酶活性,還有5'→3'核酸外切酶活性,這部分外切酶活性可能會在低溫時(shí)導(dǎo)致錯(cuò)配探針或其它物料降解,造成非特異信號。翌圣生物開發(fā)的熱啟動Taq酶雙封閉抗體不僅可以封閉Taq酶的有5'→3'聚合酶活性,還能同時(shí)封閉Taq酶的5'→3'外切酶活性,雙管齊下,既能有效防止錯(cuò)配或引物二聚體引起的非特異性擴(kuò)增,又能防止物料降解產(chǎn)生非特異信號,雙重提升試劑穩(wěn)定性。

      圖片1.jpg

      圖1. 翌圣雙封閉抗體封閉原理示意圖

      圖中高亮部分為Taq DNA聚合酶5'→3'聚合酶活性結(jié)構(gòu)域和5'→3'核酸外切酶活性結(jié)構(gòu)域,翌圣雙封閉抗體含兩種抗體,可同時(shí)封閉Taq DNA聚合酶的5'→3'聚合酶活性和5'→3'核酸外切酶活性

       

      PART 02

      Taq酶雙封閉抗體使用方案

       

      翌圣生物Taq酶雙封閉抗體不僅可封閉野生型Taq酶,對于多種突變體Taq酶亦可適用,封閉之后的熱啟動Taq酶可以正常保存至-20℃。

      1 µL抗體(5 mg/mL)可封閉20-50 U Taq DNA聚合酶:

       小樣室溫(25℃)旋轉(zhuǎn)混勻孵育30 min

        大樣室溫(25℃)旋轉(zhuǎn)混勻孵育2~3 h

      PART 03

      Taq酶雙封閉抗體性能展示

       

       1  雙封閉抗體有效封閉Taq DNA聚合酶外切酶活性

      將合成的引物探針分別配于未封閉以及雙封閉抗體封閉的Taq DNA聚合酶的反應(yīng)液中,40℃反應(yīng),檢測兩者熒光信號。

      圖片2.jpg

      圖2. 雙封閉抗體外切酶活性封閉效率檢測

      黃色:未封閉的Taq DNA聚合酶組;紫色:雙封閉抗體封閉的Taq DNA聚合酶組

       

      由圖2可以看出雙封閉抗體可有效封閉Taq DNA聚合酶的外切酶活性。

       

       2   使用雙封閉抗體分型準(zhǔn)確,靈敏度更高

      分別用翌圣生物雙封閉抗體以及T公司抗體對Taq酶封閉后通過ARMS-PCR技術(shù)檢測陽性樣本。

       

      圖片3.jpg

      圖3. ARMS-PCR擴(kuò)增曲線圖

      藍(lán)色:T公司封閉抗體封閉;紅色:翌圣雙封閉抗體封閉

       

      由圖3可以看到翌圣生物雙封閉抗體封閉的Taq酶在ARMS-PCR擴(kuò)增中分型準(zhǔn)確,靈敏度更高。

       

       3   雙封閉抗體有效提升檢測試劑穩(wěn)定性

      用傳統(tǒng)封閉抗體與雙封閉抗體分別封閉Taq DNA聚合酶,配置成含引物探針的全預(yù)混液,在4℃放置10天或在37℃放置1、3、5天,擴(kuò)增10000拷貝ASFV質(zhì)粒,觀察擴(kuò)增曲線和Ct值變化,對比傳統(tǒng)封閉抗體和雙封閉抗體對全預(yù)混反應(yīng)液穩(wěn)定性的作用。

      圖片44.jpg

      圖4. 傳統(tǒng)封閉抗體(A)、雙封閉抗體(B)封閉反應(yīng)液擴(kuò)增10000拷貝ASFV質(zhì)粒擴(kuò)增曲線圖

      藍(lán)色:4℃放置10天;紅色:4℃放置0天(對照)

      由圖4可以看出,雙封閉抗體比傳統(tǒng)封閉抗體更能保持反應(yīng)液穩(wěn)定,有效提升檢測試劑穩(wěn)定性。雙封閉抗體封閉含引物探針全預(yù)混液4℃放置10天擴(kuò)增曲線和Ct值無明顯變化。

       

      圖55.jpg

      圖5. 傳統(tǒng)封閉抗體(A)、雙封閉抗體(B)封閉反應(yīng)液擴(kuò)增10000拷貝ASFV質(zhì)粒擴(kuò)增曲線圖

      藍(lán)色:37℃放置5天 ;綠色:37℃放置3天;黃色:37℃放置1天 ; 紅色:37℃放置0天(對照)

      由圖5可以看出,雙封閉抗體比傳統(tǒng)封閉抗體更能保持反應(yīng)液穩(wěn)定,有效提升檢測試劑穩(wěn)定性。雙封閉抗體封閉含引物探針全預(yù)混液37℃放置1、3、5天Ct值差小于0.2。

       

       4   雙封閉抗體幫助解決基線上漂問題

      某些引物配合特定buffer和儀器時(shí),會出現(xiàn)基線上漂的情況。翌圣生物嘗試多種方法改善基線問題,發(fā)現(xiàn)雙封閉抗體更有利于基線平穩(wěn)。

      圖66.jpg

      圖6. N基因(A)、ACT基因(B)擴(kuò)增曲線圖

      紅色:傳統(tǒng)封閉抗體封閉;綠色:雙封閉抗體封閉

      由圖6可以看出特定引物和buffer下,使用雙封閉抗體可幫助解決基線上漂問題。

       

       5   使用雙封閉抗體獲得良好線性

      用雙封閉抗體封閉的反應(yīng)液擴(kuò)增100000、10000、1000、100拷貝ASFV/ACT雙質(zhì)粒,制作標(biāo)準(zhǔn)曲線。
       

       

      圖77.jpg

      圖7. 雙封閉反應(yīng)液制作ASFV基因(A)、ACT基因(B)標(biāo)準(zhǔn)曲線圖

      由圖7可以看到,ASFV基因標(biāo)準(zhǔn)曲線R2為0.998,擴(kuò)增效率為98.848%;ACT基因標(biāo)準(zhǔn)曲線R2為0.998,擴(kuò)增效率為98.113%,兩者線性均良好,且均無非特異性擴(kuò)增。

       

       6   雙封閉抗體可快速釋放酶活

      分別用進(jìn)口T公司抗體和翌圣生物雙封閉抗體封閉Taq酶,并在95℃下熱激20 s,檢測酶活??梢钥吹?5℃熱激 20 s后,翌圣生物雙封閉抗體可釋放95%以上的酶活,與T公司抗體相當(dāng)。

       

      原酶

      翌圣生物雙封閉抗體(95℃,20 s)

      T公司抗體(95℃,20 s)

      酶活-U/μL

      2.15

      2.1

      2.2

       

       7   雙封閉抗體可封閉多種類型Taq

      用翌圣生物雙封閉抗體(Cat#31303)分別封閉三種類型Taq酶(野生型+2種突變型),封閉比例為1μg:5U,測量熒光值以及封閉效率。可以看到,對于不同類型的Taq酶,翌圣生物雙封閉抗體(Cat#31303)封閉效果均較好。

       

      熒光值

      封閉效率

      空白

      6461.74

       

      原酶-Taq000

      56221.33

       

      原酶-Taq019E

      50819.64

       

      原酶-Taq019H

      56466.33

       

      31303-Taq000

      7949.68

      97.01%

      31303-Taq019E

      8267.35

      95.93%

      31303-Taq019H

      8015.47

      96.90%


       8   Yeasen雙封閉抗體無小鼠基因組殘留

      以水為模板作為陰性對照,小鼠基因組為模板作為陽性對照,擴(kuò)增不同批次的31303,觀察條帶,發(fā)現(xiàn)樣品未擴(kuò)增出目的片段,說明抗體不存在小鼠基因組殘留。


      圖片8.jpg

      圖8. 小鼠基因組殘留檢測圖

      注:-為陰性對照,+為陽性對照,1-5為31303不同批次樣品

      PART 04

      翌圣生物Taq酶抗體庫,滿足您的多樣化需求

       
      市面上Taq酶突變體種類較多,往往很難找到適配且能高效封閉的抗體,而選擇其他的修飾方式,可能存在修飾效果不佳、熱啟動時(shí)間過長等問題。
      翌圣生物擁有多種Taq酶抗體組成的抗體庫,除常用的聚合酶活性封閉抗體、5'→3'外切酶活性封閉抗體和雙封閉抗體以外,抗體庫中還有40余株抗體,后續(xù)可快速開發(fā)實(shí)現(xiàn)超過200余株抗體,可針對各種商業(yè)化Taq酶進(jìn)行定制化篩選適配封閉抗體,幫助IVD企業(yè)快速適配原料縮短研發(fā)進(jìn)程。
      抗體庫定制篩選案例展示:
      2020年6月12日,客戶C反饋使用翌圣生物通用版Taq酶抗體封閉某Taq酶突變體,封閉效率可達(dá)95%,但希望37℃穩(wěn)定性測試能突破7天,嘗試優(yōu)化封閉比例未能解決該問題,遂安排寄送客戶的Taq酶至翌圣生物IVD RDC。同年7月20日,翌圣生物從其Taq酶抗體庫里進(jìn)行篩選,篩選到#301號聚合酶封閉抗體與#2號外切酶封閉抗體對客戶Taq酶有良好的封閉性,混合使用兩種抗體可使Taq酶37℃穩(wěn)定性測試延長至14天。

      創(chuàng)新合作模式下的定制化封閉抗體篩選,翌圣生物Taq酶抗體庫給您多種選擇!

      目前翌圣生物為IVD企業(yè)已提供的定制化服務(wù)除了Taq酶封閉抗體篩選外,其他分子診斷原料包括:免提取、快速程序、自動化儀器適配、小體積反應(yīng)體系、酶定向改造、防污染體系、凍干試劑等,幫助數(shù)百個(gè)分子診斷試劑開發(fā)項(xiàng)目順利進(jìn)行,快速推向臨床實(shí)驗(yàn)階段。

       

      如果您對創(chuàng)新合作模式感興趣,歡迎聯(lián)系我們(聯(lián)系電話:18930337563)探討交流,我們期待與您的合作!

       

      PART 05

      產(chǎn)品信息

       

      產(chǎn)品名稱

      貨號

      規(guī)格

      Hieff® Double-Block anti-Taq DNA Polymerase Antibody 

       

      31303ES60

      100 μg

      31303ES80

      1 mg

      31303ES90

      5 mg

      31303ES92

      10 mg

      31303ES93

      100 mg

      31303ES94

      1000 mg

       

      400-6111-883