幾乎每個實(shí)驗(yàn)小白剛進(jìn)實(shí)驗(yàn)室的時候都會做到PAGE實(shí)驗(yàn),但是PAGE實(shí)驗(yàn)中用到的膠,你們真的了解嗎?它分離蛋白的原理是什么?PAGE膠里有哪些組分,這些組分的作用是什么?平常實(shí)驗(yàn)室手工配出來的膠跟在公司購買的膠有什么差別?帶著這些疑問跟著小翌一起學(xué)習(xí)蛋白電泳中的PAGE膠吧!
1.什么是PAGE?它的原理是什么?
PAGE(聚丙烯酰胺凝膠電泳,polyacrylamide gel electrophoresis)是以聚丙烯酰胺凝膠作為支持介質(zhì)的一種常用電泳技術(shù),主要用于蛋白質(zhì)分離。聚丙烯酰胺凝膠(polyacrylamide gel)是由單體丙烯酰胺(scrylamide,Acr)和交聯(lián)劑N,N,-亞甲基雙丙烯酰胺(N,N’-methylenebisacylamide,Bis)在催化劑和加速劑作用下聚合交聯(lián)而成的三維網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)的凝膠,這里的催化劑指的是過硫酸鈉(AP),加速劑指的是四甲基乙二胺(TEMED)利用PAGE膠進(jìn)行蛋白分離的依據(jù)是電泳遷移率和PAGE膠的分子篩作用。
PAGE膠一般由不連續(xù)的緩沖系統(tǒng)組成,包括濃縮膠和分離膠,濃縮膠的濃度較小,孔徑較大,可以將樣品濃縮至一個狹窄的區(qū)帶,之后樣品到達(dá)濃度較高的分離膠,實(shí)現(xiàn)蛋白的分離。根據(jù)分離蛋白質(zhì)的類型PAGE可分為Native PAGE和SDS PAGE。
Native PAGE是指在不加入SDS和巰基乙醇等變性劑的情況下,對保持活性的蛋白質(zhì)進(jìn)行電泳,可使蛋白質(zhì)保持天然的形狀和電荷,蛋白分離的依據(jù)是電泳遷移率和PAGE膠的分子篩作用,其分離狀況跟蛋白質(zhì)的分子量大小、形狀和攜帶電荷量相關(guān)。Native PAGE電泳之后仍能保持蛋白質(zhì)酶等生物大分子的生物活性,對其鑒定具有重要意義。
SDS PAGE一般是指在PAGE膠的配制、電泳樣本、電泳緩沖溶液中加入陰離子去垢劑SDS的電泳技術(shù),SDS可斷裂分子內(nèi)和分子間的氫鍵,使蛋白分子去折疊,破壞蛋白的二、三級結(jié)構(gòu)。在蛋白樣品中加入SDS,分子被解聚成多肽鏈,解聚后的氨基酸側(cè)鏈和SDS結(jié)合形成蛋白-SDS膠束,其所帶的負(fù)電荷大大超過了蛋白原有的電荷量,大大消除了不同分子間的電荷差異和結(jié)構(gòu)差異,基本只跟蛋白質(zhì)分子量有關(guān)。
2.PAGE膠是如何配制的?
(1)配膠
PAGE膠的配制包括配膠和灌膠兩個步驟。要配制聚丙烯酰胺凝膠,首先就是要拿到具體的配方,根據(jù)表1所列舉配方準(zhǔn)備好配膠的試劑。
表1.PAGE凝膠配制的參考配方,具體配方各個實(shí)驗(yàn)室根據(jù)其實(shí)驗(yàn)條件和實(shí)驗(yàn)需求會有所不同
組分作用 |
組分名稱 |
危險性 |
10 mL分離膠 |
4 mL濃縮膠 |
||
8% |
10% |
12% |
5% |
|||
定容劑 |
H2O |
無危害 |
5.3 mL |
4.9 mL |
4.4 mL |
2.46 mL |
單體/交聯(lián)劑 |
Acr- Bis(29:1) |
Arc:經(jīng)皮膚和呼吸道傳染,毒性可累積,不易排毒; Bis:影響中樞神經(jīng)系統(tǒng) |
2 mL |
2.5 mL |
3 mL |
0.5 mL |
緩沖溶液 |
1.5 M Tris-HCl/SDS pH 8.8 |
SDS對呼吸道有刺激作用 |
2.5 mL |
2.5 mL |
2.5 mL |
1(pH 6.8) |
催化劑 |
10% AP |
對黏膜、上呼吸道組織、眼睛和皮膚有極大危害性 |
0.1 mL |
0.1 mL |
0.1 mL |
40 uL |
加速劑 |
TEMED |
強(qiáng)神經(jīng)毒性 |
6 uL |
6 uL |
6 uL |
4 uL |
根據(jù)需要檢測的蛋白大小選擇合適濃度的凝膠,按照圖1依次加入各組分,配制好分離膠,振蕩混勻。
(2)灌膠
玻璃膠板和制膠夾的下沿對齊后,夾緊,然后垂直卡在架子上,灌膠。先灌分離膠,灌入后加入1 mL異丙醇/dd H2O,放置15-45 min使其凝固。在分離膠固定好之后,倒掉上層的異丙醇/dd H2O,再按照表1配制濃縮膠,倒入玻璃板中間,再插入梳子,等候30 min,這樣PAGE凝膠就配制好了。
配制好的凝膠,最好立即用于電泳實(shí)驗(yàn);或置于密封袋中, 4℃儲存,時間不要超過1星期。
3.預(yù)制膠與傳統(tǒng)自配膠的優(yōu)劣勢比較
說了這么多PAGE膠的知識,相信大家對PAGE膠都有了一定的了解了,現(xiàn)在的PAGE膠除了實(shí)驗(yàn)室自己配制,也可以購買市面上配制好的PAGE膠,稱之為預(yù)制膠。隨著勞動力的增值,人們越來越傾向于購買品質(zhì)穩(wěn)定的預(yù)制膠進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。相對于傳統(tǒng)自配膠,預(yù)制膠具有以下優(yōu)點(diǎn):
1)節(jié)省實(shí)驗(yàn)人員的寶貴時間:不用再配制N種溶液,還要灌膠、等膠凝固。
2)品質(zhì)穩(wěn)定:大規(guī)模生產(chǎn)的預(yù)制膠質(zhì)量穩(wěn)定,重復(fù)性好,可以有效避免自己配膠時好時壞的情況。
3)避免直接接觸有毒物質(zhì):PAGE膠的成分大多數(shù)都是有毒的
聽到這里是不是有點(diǎn)心動了呢? (更多詳情點(diǎn)擊)
附表:不同濃度的預(yù)制膠適合的蛋白質(zhì)分子量范圍
原則上高分子量用低濃度膠,低分子量蛋白用高濃度膠;如果分離蛋白范圍較廣,選用梯度預(yù)制膠會達(dá)到較好的分離效果。
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產(chǎn)品名稱 |
貨號 |
規(guī)格 |
GoldBand 3-color Regular Range Protein Marker(10-180 kDa)三色預(yù)染蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn) |
20351ES76 |
2X250 μL |
GoldBand 3-color High Range Protein Marker(10-245 kDa)三色預(yù)染蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn) |
20352ES76 |
2X250 μL |