產(chǎn)品描述
Hieff NGS® Tagment Index Kit for Illumina®是Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina®專用配套試劑盒。其中包含8種i5 Index Primer (N5XX) 以及12種i7 Index Primer (N7XX),可互相組合用于96種不同的雙端Index文庫制備。試劑盒中提供的所有試劑都經(jīng)過嚴格的質量控制和功能驗證,最大程度上保證了文庫構建的穩(wěn)定性和重復性。
產(chǎn)品組分
產(chǎn)品貨號 |
名稱 |
規(guī)格 |
12610ES96 |
N501-N508 |
24 μL each |
N701-N712 |
16 μL each |
Index序列
組分 |
Sample Sheet輸入/測序時Index序列 |
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NovaSeq 6000 v1.0 reagents, MiSeq, HiSeq 2000/2500 |
NovaSeq 6000 v1.5 reagents,MiniSeq, NextSeq,HiSeq 3000/4000 |
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N5XX Index 2(i5) |
N501 |
TAGATCGC |
GCGATCTA |
N502 |
CTCTCTAT |
ATAGAGAG |
|
N503 |
TATCCTCT |
AGAGGATA |
|
N504 |
AGAGTAGA |
TCTACTCT |
|
N505 |
GTAAGGAG |
CTCCTTAC |
|
N506 |
ACTGCATA |
TATGCAGT |
|
N507 |
AAGGAGTA |
TACTCCTT |
|
N508 |
CTAAGCCT |
AGGCTTAG |
|
N7XX Index 1(i7) |
N701 |
TAAGGCGA |
TAAGGCGA |
N702 |
CGTACTAG |
CGTACTAG |
|
N703 |
AGGCAGAA |
AGGCAGAA |
|
N704 |
TCCTGAGC |
TCCTGAGC |
|
N705 |
GGACTCCT |
GGACTCCT |
|
N706 |
TAGGCATG |
TAGGCATG |
|
N707 |
CTCTCTAC |
CTCTCTAC |
|
N708 |
CAGAGAGG |
CAGAGAGG |
|
N709 |
GCTACGCT |
GCTACGCT |
|
N710 |
CGAGGCTG |
CGAGGCTG |
|
N711 |
AAGAGGCA |
AAGAGGCA |
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N712 |
GTAGAGGA |
GTAGAGGA |
運輸與保存方法
冰袋運輸。所有組分-20℃貯存,有效期一年。
注意事項
1.為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。
2.本產(chǎn)品僅用作科研用途!
其他必需材料
Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina® (Cat#12206 / Cat#12207)
適用范圍
Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina®專用配套試劑盒,可用于96種不同的雙端Index文庫制備。
Index選擇策略
Illumina使用綠色熒光標記dG/dT,使用紅色熒光標記dC/dA。為了保證測序能順利進行,每個循環(huán)里綠色和紅色兩種熒光信號都必須存在。因此在選擇Index時需要考慮綠色信號和紅色信號的平衡。下面為推薦的一些Index組合:
表1 Index 選擇策略
樣品數(shù)量 |
N7XX選擇[Index 1(i7)] |
N5XX選擇[Index 2(i5)] |
1 |
任意N7XX |
任意N5XX |
2 |
選擇1:N701和N702 |
任意N5XX |
選擇2:N702和N704 |
任意N5XX |
|
3 |
選擇1:N701、N702和N704 |
任意N5XX |
選擇2:N703、N705和N706 |
任意N5XX |
|
4-5 |
選擇1:N701、N702、N704及其他任意N7XX |
任意N5XX |
選擇2:N703、N705、N706及其他任意N7XX |
任意N5XX |
|
6 |
N701、N702、N703、N704、N705和N706 |
任意N5XX |
7-12 |
選擇1:N701-N706及其他任意N7XX |
任意N5XX |
選擇2:N701、N702、N704及其他任意N7XX |
選擇1:N501和N502 |
|
選擇2:N503和N504 |
||
選擇3:N505和N506 |
||
選擇3:N703、N705、N706及其他任意N7XX |
選擇1:N501和N502 |
|
選擇2:N503和N504 |
||
選擇3:N505和N506 |
||
>12 |
N701-N706及其他任意N7XX |
選擇1:N501、N502及其他任意N5XX |
選擇2:N503、N504及其他任意N5XX |
||
選擇3:N505、N506及其他任意N5XX |
上表僅是一些可以進行測序的Index組合實例,在實際使用過程中也可根據(jù)下圖示意自行選擇適合的index組合。
表2 Index選擇實例
正確選擇實例 |
錯誤選擇實例 |
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樣品數(shù)量 |
樣品編號 |
N7XX [Index 1 (i7)] |
N5XX [Index 2 (i5)] |
樣品數(shù)量 |
樣品編號 |
N7XX [Index 1 (i7)] |
N5XX [Index 2 (i5)] |
4 |
1 |
N705 GGACTCCT |
N503 TATCCTCT |
4 |
1 |
N705 GGACTCCT |
N502 CTCTCTAT |
2 |
N706 TAGGCATG |
N503 TATCCTCT |
2 |
N706 TAGGCATG |
N502 CTCTCTAT |
||
3 |
N701 TAAGGCGA |
N504 AGAGTAGA |
3 |
N701 TAAGGCGA |
N503 TATCCTCT |
||
4 |
N702 CGTACTAG |
N504 AGAGTAGA |
4 |
N702 CGTACTAG |
N503 TATCCTCT |
||
√ √ √ √ √ √ √ √ |
√ √ √ √ √ √ √ √ |
√ √ √ √ √ √ √ √ |
√ √ √ √ × × × × |
【注】:√: 測序時綠色通道和紅色通道都有信號 ×: 測序時只有綠色通道有信號或只有紅色通道有信號。
HB211216