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      Hieff NGS? In-Situ DNA Binding Profiling Library Prep Kit for Illumina? V2

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      產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)

      FAQ

      COA

      已發(fā)表文獻(xiàn)

      Hieff NGS® In-Situ DNA Binding Profiling Library Prep Kit for Illumina® V2
      CUT&Tag試劑盒(pA/G-Tn5版)

      樣本即用型試劑盒:含CUT&Tag實(shí)驗(yàn)中除樣本和一抗和蛋白酶抑制劑以外的所有試劑,無(wú)需額外其他組分

       

      產(chǎn)品應(yīng)用


      蛋白質(zhì)-DNA互作研究:組蛋白修飾調(diào)控、轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控等表觀(guān)作用機(jī)制研究


      產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)

       

      含兩種純化磁珠:針對(duì)小片段純化,回收效果更好。

      實(shí)驗(yàn)操作簡(jiǎn)單、實(shí)驗(yàn)周期短:建庫(kù)一步法,節(jié)省建庫(kù)時(shí)間;ConA使用,無(wú)需離心轉(zhuǎn)管;無(wú)需超聲片段化;樣本投入量低。

      實(shí)驗(yàn)重復(fù)性好


      產(chǎn)品描述

       

      Hieff NGS® In-Situ DNA Binding Profiling Library Prep Kit for Illumina® V2 是針對(duì)Illumina®高通量測(cè)序平臺(tái)研發(fā)的用于CUT&Tag實(shí)驗(yàn)的文庫(kù)構(gòu)建試劑盒,適用于100-100,000個(gè)細(xì)胞起始量的樣本建庫(kù)。CUT&Tag是研究蛋白與DNA互作的技術(shù),相較于傳統(tǒng)的ChIP-seq、CUT&RUN,該技術(shù)具有文庫(kù)構(gòu)建時(shí)長(zhǎng)更短(僅需7小時(shí))、操作更簡(jiǎn)單、對(duì)起始樣本要求更低、抗體投入量更少、文庫(kù)產(chǎn)量更高等優(yōu)點(diǎn)。經(jīng)過(guò)細(xì)胞捕獲、一抗孵育、二抗孵育、轉(zhuǎn)座酶孵育、轉(zhuǎn)座酶激活、摻入DNA標(biāo)準(zhǔn)品、細(xì)胞裂解、磁珠回收gDNA、文庫(kù)擴(kuò)增和磁珠分選等步驟,靶蛋白結(jié)合的DNA片段最終轉(zhuǎn)化為適用于Illumina®平臺(tái)測(cè)序的文庫(kù)。

      本試劑盒包含兩個(gè)獨(dú)立模塊:BOX-I和BOX-II。BOX-I包含結(jié)合細(xì)胞的ConA Beads、提取DNA DNA Extract Beads以及文庫(kù)純化的DNA Selection Beads,BOX-II包含細(xì)胞透化劑、抗體結(jié)合buffer、轉(zhuǎn)座酶結(jié)合buffer、蛋白酶K以及后續(xù)文庫(kù)擴(kuò)增所需的所有試劑。此外,本試劑盒已在不同種類(lèi)細(xì)胞(如293T、K562、CHO、ESC細(xì)胞等)中進(jìn)行了驗(yàn)證,均具有良好的建庫(kù)效率和建庫(kù)產(chǎn)量。本試劑盒提供的所有試劑都經(jīng)過(guò)嚴(yán)格的質(zhì)量控制和功能驗(yàn)證,最大程度上保證了文庫(kù)的穩(wěn)定性和重復(fù)性。


      實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)

       

       Qsep對(duì)不同細(xì)胞投入量文庫(kù)質(zhì)量分析不同樣本投入,CUT&Tag實(shí)驗(yàn)都能得到一致的結(jié)果

       


      圖:spike in 讓數(shù)據(jù)分析結(jié)果更真實(shí):Spike in校正后,不同投入量的樣本,基因富集倍率更真實(shí)、更準(zhǔn)確。
       

      組分信息

       

      組分編號(hào)

      組分名稱(chēng)

      12597ES04

      12597ES12

      12597ES48

      BOX-I

      12597-A

      ConA Beads

      40 μL

      120 μL

      480 μL

      12597-B

      DNA Extract Beads

      280 μL

      840 μL

      3.36 mL

      12597-C

      DNA Selection Beads

      400 μL

      1.2 mL

      4.8 mL

       

       

       

       

       

      BOX-II

      12597-D

      10 × Binding Buffer

      120 μL

      360 μL

      1.44 mL

      12597-E

      10 × Wash Buffer

      600 μL

      1.8 mL

      7.2 mL

      12597-F

      5% Digitonin

      45 μL

      135 μL

      540 μL

      12597-G

      50 × PB Buffer

      6 μL

      18 μL

      72 μL

      12597-H

      10 × Dig-300 Buffer

      400 μL

      1.2 mL

      4.8 mL

      12597-I

      pA/G-Transposome Mix

      8 μL

      24 μL

      96 μL

      12597-J

      33× Activating Buffer

      6 μL

      18 μL

      72 μL

      12597-K

      15 × Terminate Solution

      20 μL

      60 μL

      240 μL

      12597-L

      30 × Proteinase K

      10 μL

      30 μL

      120 μL

      12597-M

      DNA Spike-in Mix (5 ng/μL)

      4 μL

      12 μL

      48 μL

      12597-N

      2×HiFi Amplification Mix

      100 μL

      300 μL

      1.2 mL

      12597-O

      Goat Anti-Rabbit lgG(H+L)*

      2 μL

      6 μL

      24 μL

      12597-P

      N5 (N501)**

      4 μL

      /

      /

      12597-Q

      N7 (N701)**

      4 μL

      /

      /

      注意:*本試劑盒中包含的二抗為山羊抗兔二抗,適用于使用一抗來(lái)源于兔源的研究,若需要一抗來(lái)源于鼠源的研究,需客戶(hù)自行準(zhǔn)備抗鼠二抗(Yeasen cat#34851ES)或其他等效產(chǎn)品。

      **測(cè)序時(shí) Index 序列 填寫(xiě)時(shí),測(cè)序平臺(tái)為NovaSeq 6000 v1.0 reagents, MiSeq, HiSeq 2000/2500,則N501-CTCTCTAT,N701-TAAGGCGA。測(cè)序平臺(tái)為NovaSeq 6000 v1.5 reagents,MiniSeq, NextSeq,HiSeq 3000/4000,則N501-ATAGAGAG,N701-TAAGGCGA。

      ***本試劑盒在實(shí)驗(yàn)前需自備蛋白酶抑制劑Cocktail(Yeasen Cat#20123ES)或其他等效產(chǎn)品。

       

      存儲(chǔ)條件

       

      BOX-I:2-8℃保存,BOX-II:-25~-15℃保存,有效期1年。

       

      400-6111-883