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Hieff NGS® In-Situ DNA Binding Profiling Library Prep Kit for Illumina® V2
CUT&Tag試劑盒(pA/G-Tn5版)
樣本即用型試劑盒:含CUT&Tag實(shí)驗(yàn)中除樣本和一抗和蛋白酶抑制劑以外的所有試劑,無(wú)需額外其他組分
產(chǎn)品應(yīng)用
蛋白質(zhì)-DNA互作研究:組蛋白修飾調(diào)控、轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控等表觀(guān)作用機(jī)制研究
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
●含兩種純化磁珠:針對(duì)小片段純化,回收效果更好。
●實(shí)驗(yàn)操作簡(jiǎn)單、實(shí)驗(yàn)周期短:建庫(kù)一步法,節(jié)省建庫(kù)時(shí)間;ConA使用,無(wú)需離心轉(zhuǎn)管;無(wú)需超聲片段化;樣本投入量低。
●實(shí)驗(yàn)重復(fù)性好
產(chǎn)品描述
Hieff NGS® In-Situ DNA Binding Profiling Library Prep Kit for Illumina® V2 是針對(duì)Illumina®高通量測(cè)序平臺(tái)研發(fā)的用于CUT&Tag實(shí)驗(yàn)的文庫(kù)構(gòu)建試劑盒,適用于100-100,000個(gè)細(xì)胞起始量的樣本建庫(kù)。CUT&Tag是研究蛋白與DNA互作的技術(shù),相較于傳統(tǒng)的ChIP-seq、CUT&RUN,該技術(shù)具有文庫(kù)構(gòu)建時(shí)長(zhǎng)更短(僅需7小時(shí))、操作更簡(jiǎn)單、對(duì)起始樣本要求更低、抗體投入量更少、文庫(kù)產(chǎn)量更高等優(yōu)點(diǎn)。經(jīng)過(guò)細(xì)胞捕獲、一抗孵育、二抗孵育、轉(zhuǎn)座酶孵育、轉(zhuǎn)座酶激活、摻入DNA標(biāo)準(zhǔn)品、細(xì)胞裂解、磁珠回收gDNA、文庫(kù)擴(kuò)增和磁珠分選等步驟,靶蛋白結(jié)合的DNA片段最終轉(zhuǎn)化為適用于Illumina®平臺(tái)測(cè)序的文庫(kù)。
本試劑盒包含兩個(gè)獨(dú)立模塊:BOX-I和BOX-II。BOX-I包含結(jié)合細(xì)胞的ConA Beads、提取DNA 的DNA Extract Beads以及文庫(kù)純化的DNA Selection Beads,BOX-II包含細(xì)胞透化劑、抗體結(jié)合buffer、轉(zhuǎn)座酶結(jié)合buffer、蛋白酶K以及后續(xù)文庫(kù)擴(kuò)增所需的所有試劑。此外,本試劑盒已在不同種類(lèi)細(xì)胞(如293T、K562、CHO、ESC細(xì)胞等)中進(jìn)行了驗(yàn)證,均具有良好的建庫(kù)效率和建庫(kù)產(chǎn)量。本試劑盒提供的所有試劑都經(jīng)過(guò)嚴(yán)格的質(zhì)量控制和功能驗(yàn)證,最大程度上保證了文庫(kù)的穩(wěn)定性和重復(fù)性。
實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)
圖 Qsep對(duì)不同細(xì)胞投入量文庫(kù)質(zhì)量分析:不同樣本投入,CUT&Tag實(shí)驗(yàn)都能得到一致的結(jié)果
圖:spike in 讓數(shù)據(jù)分析結(jié)果更真實(shí):Spike in校正后,不同投入量的樣本,基因富集倍率更真實(shí)、更準(zhǔn)確。
組分信息
組分編號(hào) |
組分名稱(chēng) |
12597ES04 |
12597ES12 |
12597ES48 |
||
BOX-I |
12597-A |
⇔ |
ConA Beads |
40 μL |
120 μL |
480 μL |
12597-B |
⇔ |
DNA Extract Beads |
280 μL |
840 μL |
3.36 mL |
|
12597-C |
⇔ |
DNA Selection Beads |
400 μL |
1.2 mL |
4.8 mL |
|
BOX-II |
12597-D |
⇔ |
10 × Binding Buffer |
120 μL |
360 μL |
1.44 mL |
12597-E |
⇔ |
10 × Wash Buffer |
600 μL |
1.8 mL |
7.2 mL |
|
12597-F |
⇔ |
5% Digitonin |
45 μL |
135 μL |
540 μL |
|
12597-G |
⇔ |
50 × PB Buffer |
6 μL |
18 μL |
72 μL |
|
12597-H |
⇔ |
10 × Dig-300 Buffer |
400 μL |
1.2 mL |
4.8 mL |
|
12597-I |
⇔ |
pA/G-Transposome Mix |
8 μL |
24 μL |
96 μL |
|
12597-J |
⇔ |
33× Activating Buffer |
6 μL |
18 μL |
72 μL |
|
12597-K |
⇔ |
15 × Terminate Solution |
20 μL |
60 μL |
240 μL |
|
12597-L |
⇔ |
30 × Proteinase K |
10 μL |
30 μL |
120 μL |
|
12597-M |
⇔ |
DNA Spike-in Mix (5 ng/μL) |
4 μL |
12 μL |
48 μL |
|
12597-N |
⇔ |
2×HiFi Amplification Mix |
100 μL |
300 μL |
1.2 mL |
|
12597-O |
⇔ |
Goat Anti-Rabbit lgG(H+L)* |
2 μL |
6 μL |
24 μL |
|
12597-P |
|
N5 (N501)** |
4 μL |
/ |
/ |
|
12597-Q |
⇔ |
N7 (N701)** |
4 μL |
/ |
/ |
注意:*本試劑盒中包含的二抗為山羊抗兔二抗,適用于使用一抗來(lái)源于兔源的研究,若需要一抗來(lái)源于鼠源的研究,需客戶(hù)自行準(zhǔn)備抗鼠二抗(Yeasen cat#34851ES)或其他等效產(chǎn)品。
**測(cè)序時(shí) Index 序列 填寫(xiě)時(shí),測(cè)序平臺(tái)為NovaSeq 6000 v1.0 reagents, MiSeq, HiSeq 2000/2500,則N501-CTCTCTAT,N701-TAAGGCGA。測(cè)序平臺(tái)為NovaSeq 6000 v1.5 reagents,MiniSeq, NextSeq,HiSeq 3000/4000,則N501-ATAGAGAG,N701-TAAGGCGA。
***本試劑盒在實(shí)驗(yàn)前需自備蛋白酶抑制劑Cocktail(Yeasen Cat#20123ES)或其他等效產(chǎn)品。
存儲(chǔ)條件
BOX-I:2-8℃保存,BOX-II:-25~-15℃保存,有效期1年。