Hieff® DNA Library Prep Kit for ONT是針對三代Nanopore測序平臺開發(fā)的DNA建庫試劑盒,該試劑盒對酶和緩沖buffer進行了定向的改造和優(yōu)化,極大的提升了長片段的接頭連接效率,同時末端修復加A尾后無需純化,可直接進行Barcode連接,實驗流程更便捷。
DNA建庫;三代建庫;TGS建庫;Nanopore測序;ONT測序;
組分編號 |
組分名稱 |
13301ES08 |
13301ES24 |
13301ES96 |
|
8 T |
24 T |
96 T |
|||
13301-A |
|
Endprep Buffer |
56 μL |
168 μL |
672 μL |
13301-B |
|
Endprep Enzyme |
24 μL |
72 μL |
288 μL |
13301-C |
|
Rapid Ligase Master Mix |
280 μL |
840 μL |
4×840 μL |
13301-D |
|
Rapid Ligation Reaction Buffer(5×) |
160 μL |
480 μL |
2×960 μL |
13301-E |
|
Rapid T4 DNA Ligase |
40 μL |
120 μL |
480 μL |
13301-F |
|
Elution Buffer |
160 μL |
480 μL |
2×960 μL |
-25~-15℃保存,有效期1年。
1. Native Barcode的連接后的純化和Native Adapter的純化操作步驟使用的漂洗試劑是不一樣的,請務必注意兩個純化步驟使用的試劑。
2. 為保證文庫構建成功,建議對Input DNA的片段長度和完整性進行驗證(驗證方法可選用毛細管電泳或其他等效方法)。DNA質量(完整度、碎片化)、純度(如化學污染、RNA殘留等)、使用量過多或過少均可能影響文庫的產出。
3. 請務必按照自備材料做好實驗前準備,避免無法正常按操作說明書進行實驗,造成樣本和試劑的浪費。
4. 實驗進行多個樣本文庫的制備,請記錄每個樣本對應使用的Native Barcode的編號。
圖1. Hieff® DNA Library Prep Kit for ONT建庫流程
13301ES 多樣本建庫兼容性
模板 |
Input DNA |
文庫回收率 |
下機數據量 |
Reads mean length |
Reads max length |
Reads N50 length |
Human gDNA(4-20 K) |
1μg |
96% |
15 G |
9136.1715 |
113518 |
12633 |
1.7 K |
500 ng |
65% |
0.33G |
1791 |
23493 |
1771 |
3 K |
500 ng |
75% |
0.31G |
2557 |
26165 |
3005 |
1-16 K |
1 μg |
34.5% |
2.89G |
4189 |
41457 |
5893 |
質粒1 |
300 ng |
>60% |
0.96 G |
2413 |
23637 |
2658 |
質粒2 |
300 ng |
>60% |
0.83 G |
2129 |
35855 |
2808 |
Ver. CN20250312