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Hieff NGS® Complete Adapter Kit for MGI®是針對(duì)MGI®高通量文庫(kù)構(gòu)建專用配套試劑盒,共分為3個(gè)Set,每個(gè)Set中包含8到96種不同的Barcode接頭,適用于MGI®高通量測(cè)序平臺(tái)多樣品DNA文庫(kù)構(gòu)建。試劑盒中提供的所有試劑都經(jīng)過(guò)嚴(yán)格的質(zhì)量控制和功能驗(yàn)證,最大程度保證了文庫(kù)構(gòu)建的穩(wěn)定性和可重復(fù)性。
Set 1:8 index ,41-48
Set 2:16 index ,57-72
Set 3:96 index
產(chǎn)品組分
編號(hào) |
組分 |
2 T |
4 T |
100 T |
13360 |
8 index |
10 μL each |
20 μL each |
500 μL each |
13361 |
16 index |
10 μL each |
20 μL each |
500 μL each |
13362 |
96 index |
10 μL each |
20 μL each |
500 μL each |
運(yùn)輸和保存方法
冰袋運(yùn)輸,-20℃保存,有效期18個(gè)月。
注意事項(xiàng)
1)切勿加熱接頭,應(yīng)在室溫讓其緩慢溶解,實(shí)驗(yàn)室溫度最好設(shè)置為20-25℃。接頭避免反復(fù)凍融,可短暫存放于4℃。
2)使用Hieff NGS® Complete Adapter Kit for MGI®試劑盒構(gòu)建的DNA文庫(kù)結(jié)構(gòu)如下:
5’ - Bottom Adapter - Insert DNA Sequence - Barcode Adapter- 3’
3) 試劑盒中提供的每種DNA Adapter中都包含Bottom Adapter,且提供一種Barcode序列標(biāo)簽,用于高通量測(cè)序時(shí)區(qū)分樣品。
4)為了您的安全和健康,請(qǐng)穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。
5)MGI接頭最多有96種index,當(dāng)使用96 index規(guī)格的產(chǎn)品進(jìn)行建庫(kù)測(cè)序時(shí),index的選擇需按照MGI推薦的組合進(jìn)行操作,具體規(guī)格見(jiàn)使用方法。
6)本產(chǎn)品index序列請(qǐng)索要excel格式的文件,或在官網(wǎng)上下載。
7)接頭濃度為10μM。
使用方法
DNA Adapter的序列如下:
Barcode Adapter:5’-phos-AGTCGGAGGCCAAGCGGTCTTAGGAAGACAAXXXXXXXXXXCAACTCCTTGGCTCACA-3’
Bottom Adapter:5’-TTGTCTTCCTAAGGAACGACATGGCTACGATCCGACTT-3’
1XXXXXXXXXX表示接頭的Barcode區(qū)域,其在每個(gè)接頭中的序列見(jiàn)下表。測(cè)序前在Sample Sheet中只需輸入這個(gè)Barcode序列(10 bp)即可。
圖1. 96種MGI index成組規(guī)則
Index序列如下:
紅色框中的8種index
Adapter編號(hào) |
Index序列 |
Adapter編號(hào) |
Index序列 |
01 |
TAGGTCCGAT |
13 |
CGGCAATCCG |
02 |
GGACGGAATC |
14 |
ATCAGGATTC |
03 |
CTTACTGCCG |
15 |
TCATTCCAGA |
04 |
ACCTAATTGA |
16 |
GATGCTGGAT |
藍(lán)色框中的64種index
Adapter編號(hào) |
Index序列 |
Adapter編號(hào) |
Index序列 |
41 |
TTAGATGCAT |
57 |
ATTCAACGGA |
42 |
GTCCAGAGCT |
58 |
AACTGTACTG |
43 |
CACGTGATAG |
59 |
GTACCTCAAT |
44 |
CCACTAGTCC |
60 |
GACTTCTAAT |
45 |
TGGACTTGGC |
61 |
TGAAGCGTTG |
46 |
GCTTGACAGG |
62 |
CGTGCGATCC |
47 |
AAGACCTCTA |
63 |
TCGGAAGGCA |
48 |
AGTTGCCATA |
64 |
CCGATGTCGC |
Adapter編號(hào) |
Index序列 |
Adapter編號(hào) |
Index序列 |
65 |
ACTTAGAATG |
73 |
GACAATGCTC |
66 |
TCCAAGCCTG |
74 |
GCTAATCACA |
67 |
AGACGATGAT |
75 |
AGTCCATAGG |
68 |
CTCACAAGAC |
76 |
CTATCGCCTA |
69 |
CGTTCCTACT |
77 |
ATCGTGGTCT |
70 |
GTGGTTGTGA |
78 |
TGGCTAATAC |
71 |
GAAGGCCTGC |
79 |
CAGTGCAGAG |
72 |
TAGCTTGCCA |
80 |
TCAGGCTGGT |
Adapter編號(hào) |
Index序列 |
Adapter編號(hào) |
Index序列 |
81 |
ATACTCACGC |
89 |
CACCATGTCT |
82 |
ATGCTCCGCG |
90 |
ATATGTCTGG |
83 |
TGTGAACTTG |
91 |
AAGGAAGCGT |
84 |
GAGAGGTGCT |
92 |
TCAAGACGTC |
85 |
TGCACTGTAA |
93 |
CCGCTCAGTA |
86 |
GCCTAGGCAA |
94 |
GGTGTGTACA |
87 |
CCATCATAGC |
95 |
TTCACGTAAG |
88 |
CATGGTAATT |
96 |
GGTTCCACAC |
Adapter編號(hào) |
Index序列 |
Adapter編號(hào) |
Index序列 |
97 |
AGGTATTCTT |
121 |
CCTTGATCAA |
98 |
CGAATGCAAC |
122 |
GGAAGTGGCA |
99 |
TTCAACGGCG |
123 |
AACATTCTAC |
100 |
CTCGGCGGAA |
124 |
GACGCGAGTC |
101 |
ACGGTAATGG |
125 |
CTATAACACT |
102 |
GATCCGACGT |
126 |
AGTCTCGTGT |
103 |
TCACGATACA |
127 |
TCGGCCTATG |
104 |
GATTCTCTTC |
128 |
TTGCAGACGG |
紫色框中的24種index
Adapter編號(hào) |
Index序列 |
Adapter編號(hào) |
Index序列 |
Adapter編號(hào) |
Index序列 |
25 |
TAGAGGACAA |
33 |
GCAACGATGG |
49 |
ATGTACGCAG |
26 |
CCTAGCGAAT |
34 |
TAATCGTTCA |
50 |
TTAATGAGAT |
117 |
ATGTCTATCC |
35 |
GTTCGCTCTA |
51 |
TGCGCCACTT |
28 |
GCTGAGCTGT |
36 |
TCTCACACAT |
52 |
CATTAAGGCC |
29 |
AACCTAGATA |
37 |
CTGTTAGGAT |
53 |
CCGCCTCAGA |
30 |
TTGCCATCTC |
38 |
CGCAGACGCG |
116 |
GCTCCATGAC |
114 |
CCAGAGTCAG |
39 |
AAGGATCATC |
55 |
GCCGGTTATC |
32 |
CGCTATCGGC |
115 |
AACAGGCAGT |
56 |
GGAATATTGA |
說(shuō)明:
4 個(gè) Adapter 成組:第 1 列(01-04,13-16),共計(jì) 2 組(圖 1 紅色框);
8 個(gè) Adapter 成組:第 2-9 列(41-48、57-64、65-72、73-80、81-88、89-96、97-104 和 121-128),共計(jì) 8 組(圖 1 藍(lán)色框);
24 個(gè) Adapter 成組:第 10-12 列,共計(jì) 1 組(圖 1 紫色框)。
成組規(guī)則:
1)樣本數(shù)1-4:選擇紅色框中index;也可以選擇藍(lán)色框中的index,盡量選擇一列上的index,不要跨列選擇。
2)樣本數(shù)5-24:選擇藍(lán)色框中的index進(jìn)行操作,盡量先選擇同一列上的index,然后再選擇第二列
3)樣本數(shù)25-64:按照規(guī)格2進(jìn)行操作;也可以選擇紫色框中的所有index,然后加上藍(lán)色框中的index。但不可以一部分index選擇紫色框,一部分選擇其他組別。
4)樣本數(shù):65-72:選擇藍(lán)色框中的所有index,然后再加上紅色框中的index。
5)樣本數(shù):73-96:可以選擇紫色框中全部index,再加紅色框或藍(lán)色框中的index.
【注】請(qǐng)按照以上說(shuō)明,選擇合適的接頭進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建,否則影響后期下機(jī)數(shù)據(jù)的拆分(不按照要求使用,會(huì)造成下機(jī)數(shù)據(jù)拆分均一性較差)
HB220530