Hieff NGS® RNA 384 CDI Primer for MGI®是MGI®高通量測序平臺RNA文庫構建專用接頭引物試劑盒,共分為2個Set,每個Set包含二代測序建庫中使用的UDB adapter以及 8種Barcode 2 Index Primer和12種Barcode 1 Index Primer。 2個Set共提供16種Barcode 2 Index Primer和24種Barcode 1 Index Primer,配合 Yeasen出品的RNA建庫試劑盒使用可構建多達384種不同組合的雙端index標記的文庫。試劑盒中提供的所有試劑都經(jīng)過嚴格的質量控制和功能驗證,最大程度上保證了文庫構建的穩(wěn)定性和重復性。
產(chǎn)品組分
編號 |
名稱 |
規(guī)格 |
13365ES02 |
UDB Adapter |
480 μL |
RP 201-208 |
60 μL each |
|
RP 101-112 |
40 μL each |
|
13366ES02 |
UDB Adapter |
480 μL |
RP 209-216 |
60 μL each |
|
RP 113-124 |
40 μL each |
冰袋運輸。
所有組分-20°C保存,有效期1年。
1)本試劑盒中UDB Adapter的濃度為10 μM,單個文庫構建的接頭使用量根據(jù)所用建庫試劑盒進行調整。Index Primer的濃度為10 μM。
2)本試劑盒提供的UDB Adapter為通用型短接頭,需要通過PCR擴增獲得完整的文庫。Index Primer提供Barcode序列標簽,用于高通量測序時區(qū)分樣品。
3)本試劑盒每個Set包含8種Barcode 2 Index Primer (RP 2xx)和12種Barcode 1 Index Primer (RP 1xx),相互組合可以構建96種不同組合的雙端Index標記文庫。2個Set共提供16種Barcode 2 Index Primer和24種Barcode 1 Index Primer。您可以使用Cat#13365中的Barcode 2 Index Primer(或Barcode 1 Index Primer)與Cat#13366中的Barcode 1 Index Primer(或Barcode 2 Index Primer)組合用以構建多達384種不同組合的雙端Index標記文庫。
4)切勿加熱接頭,應在室溫讓其緩慢溶解,實驗室溫度最好設置為20-25℃。接頭避免反復凍融,建議分裝保存,可短暫存放于4℃。
5)使用Hieff NGS® RNA 384 CDI Primer for MGI®試劑盒構建的測序文庫結構如下:
6)為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。
7)本產(chǎn)品僅作科研用途!
1. 接頭的使用:參照所用建庫說明書中對不同投入量的推薦用量稀釋至合適濃度使用。
2. Index Primer的使用:按照建庫說明書中文庫擴增體系配制反應體系(如下表),反應程序按照建庫說明書中程序進行設置。
組分名稱 |
體積(μL) |
2× High Fidelity DNA PCR Mix |
25 |
RP 2xx |
2.5 |
RP 1xx |
2.5 |
Adapter Ligated DNA |
20 |
Total |
50 |
UDB Adapter for MGI:
5´-/5Phos/ AGTCGGAGGCCAAGCGGTCTTAGGAAGACAATCAG -3´
5´-TTGTCTTCCTAAGCAACTCCTTGGCTCACAGAACGACATGGCTACGATCCGACTT -3´
Barcode 2 Index Primer for MGI:
5´-/5Phos/CTCTCAGTACGTCAGCAGTT[Barcode 2 Index]CAACTCCTTGGCTCACAGAAC -3´
Barcode 1 Index Primer for MGI:
5´-GCATGGCGACCTTATCAG[Barcode 1 Index]TTGTCTTCCTAAGACCGCTTGG-3´
[Barcode 2 Index]表示10 bp 的Barcode 2 Index序列,[Barcode 1 Index]表示10 bp 的Barcode 1 Index序列,各引物對應的Index名稱、引物中包含的Index序列以及測序時對應的Index序列信息如下表所示:
Barcode 2 Index Primers |
引物中的序列 |
測序儀拆分用序列(同引物中的序列) |
RP201 |
TAGGTCCGAT |
TAGGTCCGAT |
RP202 |
GGACGGAATC |
GGACGGAATC |
RP203 |
CTTACTGCCG |
CTTACTGCCG |
RP204 |
ACCTAATTGA |
ACCTAATTGA |
RP205 |
TTCGTATCCG |
TTCGTATCCG |
RP206 |
GGTAACGAGC |
GGTAACGAGC |
RP207 |
CAACGTATAA |
CAACGTATAA |
RP208 |
ACGTCGCGTT |
ACGTCGCGTT |
RP209 |
TTCTGCTAGC |
TTCTGCTAGC |
RP210 |
AGGAAGATAG |
AGGAAGATAG |
RP211 |
GCTCTTGCTT |
GCTCTTGCTT |
RP212 |
CAAGCACGCA |
CAAGCACGCA |
RP213 |
CGGCAATCCG |
CGGCAATCCG |
RP214 |
ATCAGGATTC |
ATCAGGATTC |
RP215 |
TCATTCCAGA |
TCATTCCAGA |
RP216 |
GATGCTGGAT |
GATGCTGGAT |
Barcode 1 Index Primers |
引物中的序列 |
測序儀拆分用序列(與引物中的序列反向互補) |
RP101 |
TAGGTCCGAT |
ATCGGACCTA |
RP102 |
GGACGGAATC |
GATTCCGTCC |
RP103 |
CTTACTGCCG |
CGGCAGTAAG |
RP104 |
ACCTAATTGA |
TCAATTAGGT |
RP105 |
TTCGTATCCG |
CGGATACGAA |
RP106 |
GGTAACGAGC |
GCTCGTTACC |
RP107 |
CAACGTATAA |
TTATACGTTG |
RP108 |
ACGTCGCGTT |
AACGCGACGT |
RP109 |
TTCTGCTAGC |
GCTAGCAGAA |
RP110 |
AGGAAGATAG |
CTATCTTCCT |
RP111 |
GCTCTTGCTT |
AAGCAAGAGC |
RP112 |
CAAGCACGCA |
TGCGTGCTTG |
RP113 |
CGGCAATCCG |
CGGATTGCCG |
RP114 |
ATCAGGATTC |
GAATCCTGAT |
RP115 |
TCATTCCAGA |
TCTGGAATGA |
RP116 |
GATGCTGGAT |
ATCCAGCATC |
RP117 |
GTGAGTGATG |
CATCACTCAC |
RP118 |
GAGTCAGCTG |
CAGCTGACTC |
RP119 |
TGTCTGCGAA |
TTCGCAGACA |
RP120 |
ATTGGTACAA |
TTGTACCAAT |
RP121 |
CGATTGTGGT |
ACCACAATCG |
RP122 |
ACAGACTTCC |
GGAAGTCTGT |
RP123 |
TCCACACTCT |
AGAGTGTGGA |
RP124 |
CACCACAAGC |
GCTTGTGGTG |
HB210421