eTET1 增強型DNA雙加氧酶是翌圣生物科技(上海)股份有限公司基于納氏蟲屬DNA雙加氧酶 (NgTET1)進行改造的重組融合突變體蛋白,具有更高的酶活性。eTET1可以將甲基化胞嘧啶 (5mC)經(jīng)過三步連續(xù)氧化反應(yīng)氧化成羧基化胞嘧啶 (5caC)。通過轉(zhuǎn)化劑的作用,5caC進一步被轉(zhuǎn)化成尿嘧啶 (U),并通過PCR將尿嘧啶 (U)轉(zhuǎn)化成胸腺嘧啶 (T),從而達(dá)到單堿基分辨率和高準(zhǔn)確性的DNA甲基化位點鑒定。
一、關(guān)于操作
1. 為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。
2. 請于使用前將試劑盒各組分置于室溫解凍。解凍后上下顛倒數(shù)次充分混勻,短暫離心后置于冰上待用。
3. 推薦在帶熱蓋的PCR儀中進行各步驟反應(yīng),使用前應(yīng)預(yù)熱PCR儀至反應(yīng)溫度附近。
4. PCR產(chǎn)物因操作不當(dāng)極容易產(chǎn)生氣溶膠污染,進而影響實驗結(jié)果準(zhǔn)確性。推薦將PCR反應(yīng)體系配制區(qū)和PCR產(chǎn)物純化檢測區(qū)進行強制性的物理隔離;配備文庫構(gòu)建專用移液器等設(shè)備;定時對各實驗區(qū)域進行清潔(推薦使用ThermoFisher公司的DNAZapTM高效核酸去除噴霧),以保證實驗環(huán)境的潔凈度。
5. 本產(chǎn)品僅用作科研用途!
本試劑盒適用于DNA甲基化 (DNA 5mC)研究,針對的DNA投入量為1-200 ng,也提供了應(yīng)用于RNA甲基化 (RNA 5mC)的可能性。
1. eTET1為二價金屬依賴性DNA雙加氧酶,因此對氧化體系中EDTA較為敏感。請不要用包含EDTA的緩沖液溶解DNA材料。若使用EDTA的緩沖液溶解DNA材料,我們建議進行一輪DNA回收進行純化,或者對eTET1 Enhancer的投入量進行重新滴定,以達(dá)到eTET1最佳的氧化效果。
2. eTET1 Enhancer的容易被氧化,收到后建議分裝保存于-20°C。短時間內(nèi)不用,建議-80°C保存。
一、eTET1氧化甲基化胞嘧啶 (5mC)過程
圖1 eTET1氧化甲基化胞嘧啶 (5mC)過程
1. 將表中試劑解凍后顛倒混勻,置于冰上備用。配制eTET1氧化反應(yīng)體系:
名稱 |
體積 (μL) |
DNA模板(不含EDTA,若含EDTA,見注意事項1) |
24-25 (1-100 ng) |
10× eTET1 Buffer |
3 |
10× eTET1 Enhancer |
1 |
eTET1 Enzyme Mix (5 mg/mL) |
1-2 |
總共 |
30 |
2. 37°C反應(yīng)1.5 h。
3. eTET1活性(使用熒光抗體法對eTET1活性進行測定)
圖2 eTET1活性與其他TET酶活性比較
HB211124