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      干貨|DNA電泳優(yōu)化寶典,讓條帶清晰可見!

       

      核酸電泳是分子生物學(xué)研究中的一項基本技術(shù),廣泛應(yīng)用于基因克隆、DNA指紋分析、RNA表達(dá)研究等領(lǐng)域。這項技術(shù)的核心在于利用電場驅(qū)動DNA或RNA分子通過凝膠基質(zhì),實(shí)現(xiàn)不同大小分子的分離。盡管核酸電泳的原理相對簡單,但其往往影響最終的成果展示。所以在實(shí)際操作過程中,如何提高電泳效率、獲得更清晰的條帶一直是研究人員追求的目標(biāo)。小翌將分享一些實(shí)用的實(shí)驗(yàn)室小竅門,以幫助各位科研小伙伴們提高電泳效率~

       

      電泳槽

       

       

      小竅門1
       

      選擇合適的凝膠濃度和電泳緩沖液

      凝膠濃度對電泳分離效率有著直接影響。瓊脂糖是最常用的凝膠材料,其濃度通常在0.7%至2%之間選擇。濃度越高,凝膠的分子孔徑越小,DNA遷移速率越慢,但分辨率越高。反之,濃度越低,DNA遷移速率越快,但分辨率較低。電泳緩沖液的組成對DNA的遷移速度和分離效率同樣重要。因此,針對實(shí)驗(yàn)?zāi)康牟煌?,選擇合適的凝膠濃度與適配的電泳緩沖液。

       

      瓊脂糖濃度

      有效分離范圍(bp)

      推薦緩沖液

      0.5%

      2,000-50,000

      1×TAE

      0.8%

      800-10,000

      1×TAE

      1.0%

      400-8,000

      1×TAE

      1.2%

      300-7,000

      1×TAE

      1.5%

      200-3,000

      1×TAE/0.5×TBE

      2.0%

      100-2,000

      1×TAE/0.5×TBE

      3.0%

      25-1,000

      0.5×TBE

       

       

      TAE緩沖液

      TAE緩沖液含有乙酸(Acetic acid)、EDTA和Tris,適合用于快速電泳和大片段DNA的分離。乙酸的存在降低了凝膠的pH值,有助于提高電泳速度。

       
       
       
       

      TBE緩沖液

      TBE緩沖液含有硼酸(Boric acid)、EDTA和Tris,其離子強(qiáng)度較高,適合用于小片段DNA的高分辨率分離。硼酸根離子的存在增強(qiáng)了凝膠的穩(wěn)定性,有助于提高分離效率。因此凝膠濃度越大,需采用TEB緩沖液,便于分離條帶。

       
       
       

       

      小翌有多種瓊脂糖,適合不同的應(yīng)用場景,供大家選擇~

       

       

       

      小竅門2
       

      樣品準(zhǔn)備

       

      DNA純化

      確保DNA樣品的純度,避免蛋白質(zhì)、多糖和其它雜質(zhì)的污染,這可以通過適當(dāng)?shù)募兓襟E實(shí)現(xiàn)。純化的DNA樣品能夠提供清晰的電泳條帶,減少背景干擾。

       
       
       
       

      DNA Marker

      選擇背景干凈、帶型穩(wěn)定、大小精準(zhǔn)的DNA Marker,如翌圣GoldBand系列DNA Marker(Cat#10501ES-10518ES)。

       

       
       
       

       

       

      小竅門3
       

      均勻加樣

       

      加樣技巧

      使用加樣器時保持平穩(wěn),右手執(zhí)移液槍,左手扶在移液槍前方細(xì)柄處,斜角45℃懸空插入點(diǎn)樣孔中2-3 mm處點(diǎn)樣。盡量避免戳破凝膠,避免樣品接觸凝膠表面,減少樣品擴(kuò)散。均勻的加樣能夠確保DNA片段在凝膠中的一致遷移,避免條帶扭曲或模糊。

       
       
       
       

      加樣量

      控制適當(dāng)?shù)募訕恿?,過量的樣品會導(dǎo)致條帶模糊。適量的加樣能夠保證條帶的清晰度和可讀性,其上樣量與核酸電泳制膠時的梳子大小相關(guān)。

       

      梳子厚度mm

      梳子孔寬mm

      每孔最大上樣量μL)

      推薦上樣量(μL)

      1.0

      ~3

      ~15

      5-10

      1.5

      ~4.2

      ~25

      10-15

      1.5

      ~7

      ~50

      20-40

      2.0

      ~1.5

      ~200

      80-150

       
       
       

       

       

      小竅門4
       

      電泳條件

       

      電壓控制

      根據(jù)凝膠長度和厚度調(diào)整電壓,過高的電壓會導(dǎo)致熱量積累,影響DNA的遷移。適宜的電壓設(shè)置有助于保持恒定的電泳速度,避免條帶扭曲。

       
       
       
       

      恒壓電泳

      優(yōu)先選擇恒壓電泳而非恒流電泳,以保持電場強(qiáng)度的穩(wěn)定。恒壓電泳能夠減少電泳過程中的熱效應(yīng),提高分離效率。但需注意電壓控制在110-130v為佳,過高電壓易造成不穩(wěn)定脈沖,影響電泳效果。

       

      電壓過高造成的條帶模糊

       
       
       

       

       

      小竅門5
       

      預(yù)電泳

      如果是新鮮配制的緩沖液,在加樣前進(jìn)行預(yù)電泳,可以清除凝膠中的雜質(zhì)和氣泡,平衡凝膠孔隙中的離子濃度,減少樣品遷移過程中的阻力,提高電泳效率。預(yù)電泳時間一般建議5-10分鐘。

       

       

      小竅門6
       

      使用新鮮凝膠

       

      避免重復(fù)使用

      重復(fù)使用的凝膠可能會因緩沖液的滲入而改變孔隙大小,影響分離效果。新鮮凝膠能夠提供一致的孔隙率,保證電泳結(jié)果的可重復(fù)性。

       

       

      小竅門7
       

      核酸染料的選擇

       

      安全染料

      使用YeaRed(Cat#10202ES)或YeaGreen(Cat#10204ES)無毒核酸染料,避免使用EB等有毒染料,減少紫外光暴露風(fēng)險。安全染料不僅對操作人員更安全,而且對環(huán)境的影響更小。

       

       
       
       

       

      小翌希望通過上述小竅門的實(shí)施,可以幫助大家顯著提高核酸電泳的分離效率和結(jié)果的清晰度,進(jìn)一步提高實(shí)驗(yàn)的效率和安全性~

       

       

      產(chǎn)品推薦

       

      產(chǎn)品名稱

      產(chǎn)品編號

      規(guī)格

      YeaRed 核酸染料(10,000×水溶液)

      10202ES76

      500 μL

      YeaGreen Nucleic Acid Gel Stain (10,000×in Water) 核酸染料

      10204ES76

      500 μL

      Agarose瓊脂糖

      10208ES60/76

      100 g/500 g

      GoldBand DL2,000 DNA Marker

      10501ES60/80

      100 T/10×100 T

      GoldBand DL600 DNA Marker

      10502ES60/80

      100 T/10×100 T

      GoldBand DL5,000 DNA Marker

      10504ES60/80

      100 T/10×100 T

      GoldBand DL10000 DNA Marker

      10505ES60/80

      100 T/10×100 T

      GoldBand 100 bp DNA ladder

      10507ES60/80

      100 T/10×100 T

      GoldBand 1 kb DNA ladder

      10510ES60/80

      100 T/10×100 T

      GoldBand Full-Scale DNA Ladder

      10511ES80

      1 mL

      GoldBand 15000 DNA Marker

      10512ES60/80

      100 T/10×100 T

      GoldBand 50bp DNA Ladder

      10515ES60/80

      100 T/10×100 T

      GoldBand 100bp plus DNA Ladder

      10516ES60/80

      100 T/10×100 T

      GoldBand 200 bp DNA Ladder

      10517ES60/80

      100 T/10×100 T

      GoldBand 500 bp DNA Ladder

      10518ES60/80

      100 T/10×100 T

       

       

       

      400-6111-883