Novel T4 DNA Ligase，讓片段連接更高效
——高效，快速，自連低
產(chǎn) 品 原 理
DNA連接酶是一種能夠催化相鄰DNA 的3’-OH 和5’- 磷酸基末段形成磷酸二酯鍵，并且把兩段DNA 拼接起來的核酸酶。T4 Ligase是目前應(yīng)用比較多的病毒基因組編碼的DNA 連接酶，主要從缺失型嗜菌體中提取，噬菌體T4 的30 基因是該酶的合成基因。T4 DNA連接酶在分子生物學(xué)中有廣泛的應(yīng)用。
產(chǎn) 品 簡 介
在普通T4 DNA連接酶的基礎(chǔ)上，利用定向改造技術(shù)，將T4 DNA ligase的有效催化活性結(jié)構(gòu)域通過多輪突變篩選，得到一種連接活性更強(qiáng)的突變體。采用高純度的生產(chǎn)標(biāo)準(zhǔn)和嚴(yán)格的質(zhì)量檢測，有效去除核酸酶、切口酶的殘留，連接時間只需15min，打造一款快速高效的DNA連接酶。
產(chǎn) 品 應(yīng) 用
產(chǎn) 品 特 點
◎ 應(yīng)用更廣泛：可催化粘性末端和平末端形成磷酸二脂鍵
◎ 連接更高效：建庫自連率更低，表現(xiàn)為更好的文庫多樣性
◎ 適用于多種樣本：包括FFPE、cfDNA等在內(nèi)的所有樣本均能高效連接
◎ 適用于多種類型片段連接：兼容illumina平臺Y型接頭以及MGI平臺Bubble接頭片段
◎ 嚴(yán)格質(zhì)控：嚴(yán)格的批次性能與穩(wěn)定性質(zhì)控
連 接 效 率 自 評
將本產(chǎn)品用于NGS建庫接頭連接模塊，樣本為模式樣本cfDNA模擬品，加入Y型建庫接頭，連接之后經(jīng)Agilent 2100檢測，理論上會出現(xiàn)三個峰：
◎ 雙端均未連接接頭片段；
◎ 僅一端連接接頭片段；
◎ 雙端均連接接頭片段
而在二代測序文庫構(gòu)建中，只有雙端都連接接頭的片段才是合格可用的文庫，因而通常可以通過雙端均連接接頭的片段占比反應(yīng)接頭連接效率。即雙端連接接頭片段占比越高，單端連接以及無接頭連接的片段占比越低，連接效率越高。
*樣本制備：使用170 bp多重PCR產(chǎn)物作為cfDNA模擬品，該P(yáng)CR產(chǎn)物經(jīng)過設(shè)計，3’端含有所有堿基的組合（共16種）。
極 低 的 自 連 率
建庫試劑盒中搭配不同的連接酶篩選測試（其他組分一致），測序結(jié)果顯示翌圣Novel DNA Ligase自連率更低。
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樣本 |
品牌 |
Map Ratio% |
Dup% |
Clipped reads% |
Diff chr Reads% |
|
降解嚴(yán)重 |
Yeasen |
99.73 |
19.92 |
14.05 |
1.67 |
|
競品 |
99.74 |
22.01 |
15.78 |
1.73 |
|
|
降解程度地 |
Yeasen |
99.83 |
14.95 |
5.29 |
0.63 |
|
競品 |
99.79 |
14.81 |
6.16 |
1.64 |
產(chǎn) 品 信 息
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名稱 |
貨號 |
規(guī)格 |
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10298ES40/42 |
40/400 KU |
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10301ES40 |
40 KU |
