Hieff® Novel T4 DNA Ligase是一款可用于NGS建庫過程中DNA片段和接頭連接的單酶產(chǎn)品,該產(chǎn)品已經(jīng)過高通量測
序驗(yàn)證,質(zhì)量優(yōu)異。本酶具有高效的連接能力,兼容各類樣本,對(duì)于復(fù)雜結(jié)構(gòu)核酸片段的連接更顯優(yōu)勢,比如華大平臺(tái)的Bubble接頭,均可得到優(yōu)異的測序質(zhì)量。
產(chǎn)品組分
組分編號(hào) |
組分名稱 |
規(guī)格 |
||
10298ES40 |
10298ES42 |
10298ES08 |
||
10298-A |
Hieff® Novel T4 DNA Ligase (400 U/µL) |
100 µL |
1 mL |
5 mL |
10298-B |
10 × T4 DNA Ligase Buffer |
250 μL |
2×1.25 mL |
10×1.25 mL |
運(yùn)輸和保存方法
冰袋運(yùn)輸。-20℃保存,有效期2年。
單位定義
在20 μL的連接反應(yīng)體系中,6 μg的λDNA-Hind Ⅲ分解物在16℃下反應(yīng)30 min時(shí),催化50%以上的DNA片段發(fā)生連接所需要的酶量定義為1個(gè)活性單位(U)。
注意事項(xiàng)
1)Buffer在融解時(shí),如果出現(xiàn)少量沉淀屬正?,F(xiàn)象,請(qǐng)顛倒混勻后使用。
2)為了您的安全和健康,請(qǐng)穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。
3)本產(chǎn)品僅作科研用途!
使用方法
表1 Adapter Ligation體系
名稱 |
體積(μL) |
dA-tailed DNA |
60 |
10 × T4 DNA Ligase Buffer |
10 |
50% PEG 6000 |
10* |
DNA Adapter |
X** |
Hieff® Novel T4 DNA Ligase |
1-5*** |
ddH2O |
To 100 |
【注】:*試劑盒內(nèi)未提供50% PEG 6000,需自行準(zhǔn)備。
**接頭用量參考表2。
***Hieff® Novel T4 DNA Ligase用量可根據(jù)需要添加1-5 μL。
表2 500 pg-1 μg Input DNA推薦的Adapter使用濃度
Input DNA |
Adapter : Input DNA摩爾比 |
Input DNA |
Adapter : Input DNA摩爾比 |
1 μg |
10:1 |
50 ng |
100:1 |
500 ng |
20:1 |
25 ng |
200:1 |
250 ng |
40:1 |
1 ng |
200:1 |
100 ng |
100:1 |
500 pg |
400:1 |
【注】:Input DNA摩爾數(shù)(pmol)≈ Input DNA質(zhì)量(ng)/ [0.66 × Input DNA平均長度(bp)]。
【接頭添加計(jì)算舉例】:當(dāng)Input DNA為100 ng,Input DNA長度為300 bp時(shí),接頭應(yīng)該添加多少?
第一步,計(jì)算Input DNA摩爾數(shù)。公式:Input DNA摩爾數(shù)(pmol)≈ Input DNA質(zhì)量(ng)/ [0.66 × Input DNA平均長度(bp)];
Input DNA摩爾數(shù)(pmol)=100 ÷(0.66×300)=0.5 pmol;
第二步,計(jì)算接頭添加摩爾數(shù)。根據(jù)表2查詢接頭添加比例;
根據(jù)表2,查得Input DNA 100 ng時(shí)接頭添加比例100:1,則接頭添加摩爾數(shù)=100×0.5 pmol=50 pmol;
第三步,計(jì)算接頭添加體積。接頭濃度=15 μmol/L(如使用其他接頭,濃度需要依據(jù)其他接頭濃度參數(shù));
接頭添加體積=接頭添加摩爾數(shù)(50 pmol)÷接頭濃度(15 μmol/L)=3.34 μL(注:15 μmol/L=15 pmol/μL)
綜上,接頭可添加3.4 μL。(注:接頭最大加入體積不超過5 μL)
HB220621