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產(chǎn)品簡(jiǎn)介
Plant Tissue Direct PCR Kit (With Dye)植物組織直接PCR試劑盒是一款可直接對(duì)不同類型植物葉片進(jìn)行PCR擴(kuò)增的試劑盒,適應(yīng)性廣、穩(wěn)定性強(qiáng)。試劑盒采用獨(dú)特的裂解緩沖液體系,可以快速的裂解多種植物樣品并釋放出基因組DNA,不需要除去蛋白、RNA或次生代謝產(chǎn)物等,即可將釋放出的基因組DNA作為模板直接用于PCR反應(yīng)。此外,樣品使用量少,低至1 mm植物葉片即可進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。
本試劑盒中提供的2× Plant Master Mix具有很強(qiáng)的擴(kuò)增兼容性,能直接以待測(cè)樣品裂解液為模板,進(jìn)行高效特異性擴(kuò)增。該試劑為2倍濃縮PCR反應(yīng)混合液,包含了用于PCR擴(kuò)增除模板和引物外的所有組分,大大簡(jiǎn)化操作過(guò)程,降低污染幾率。且含有示蹤染料,PCR產(chǎn)物可直接電泳。
該試劑盒可用于轉(zhuǎn)基因植株鑒定、植物基因分型等。
產(chǎn)品信息
貨號(hào) |
10187ES05 / 10187ES50 / 10187ES70 |
規(guī)格 |
5 T / 50 T / 200 T |
組分編號(hào) |
組分名稱 |
10187ES05 |
10187ES50 |
10187ES70 |
儲(chǔ)存條件 |
10187-A |
Buffer P1 |
250 μL |
1.25 mL × 2 |
5 mL × 2 |
2-8℃ |
10187-B |
Buffer P2 |
50 μL |
500 μL |
1 mL × 2 |
2-8℃ |
10187-C |
2 × Plant Master Mix* |
50 μL |
500 μL |
1 mL × 2 |
-25~-15℃ |
*2× Plant Master Mix:包含熱啟動(dòng)Taq DNA聚合酶、dNTP混合物、MgCl2、反應(yīng)緩沖液、PCR反應(yīng)增強(qiáng)劑、優(yōu)化劑以及穩(wěn)定劑等,同時(shí)包含電泳Loading Buffer,PCR完成之后可直接電泳。
儲(chǔ)存條件
1. 試劑10187-A【Buffer P1】,置于2-8℃保存。有效期1年。
2. 試劑10187-B【Buffer P2】,中和裂解產(chǎn)物,利于更長(zhǎng)時(shí)間保存樣本,置于2-8℃保存。有效期1年。
3. 試劑10187-C【2 × Plant Master Mix】,-25~-15℃保存,避免反復(fù)凍融。有效期1年。
試劑盒有效期1年。
使用說(shuō)明
1.植物葉片
1)研磨裂解法:
a. 研磨儀破碎:將直徑5 mm左右的葉片置于50 μL Buffer P1中,用研磨儀加鋼珠(鋼珠直徑3 mm左右,共2個(gè))破碎葉片(45 Hz,1 min),葉片破碎后溶液呈現(xiàn)綠色,瞬時(shí)離心,上清液請(qǐng)放在4℃?zhèn)溆?,? μL用于PCR擴(kuò)增。
b. 槍頭搗碎:推薦使用幼嫩葉片。將直徑5 mm左右的葉片置于50 μL Buffer P1中,用槍頭將葉片搗碎,搗碎后溶液呈現(xiàn)綠色,瞬時(shí)離心,上清液請(qǐng)放在4℃?zhèn)溆茫? μL用于PCR擴(kuò)增。
2)加熱裂解法:推薦使用幼嫩葉片。將直徑5 mm左右的葉片置于50 μL Buffer P1中,95℃加熱5-10 min(確保裂解液完全浸沒(méi)葉片),較難裂解的葉片(老葉片)可適當(dāng)延長(zhǎng)時(shí)間(10-20 min),加熱裂解后溶液呈現(xiàn)綠色,震蕩混勻,瞬時(shí)離心,上清液請(qǐng)放在4℃?zhèn)溆茫? μL用于PCR擴(kuò)增。
3)直接法:推薦使用幼嫩葉片。使用打孔器或者刀,將直徑1 mm左右的葉片直接加入到PCR反應(yīng)體系中;復(fù)雜樣本或者是長(zhǎng)片段的擴(kuò)增,推薦使用直徑<1 mm的葉片。
2.PCR反應(yīng)體系
組分 |
體積(μL) |
體積(μL) |
終濃度 |
2× Plant Master Mix |
10 |
25 |
1× |
Forward Primer (10 μM) |
0.5 |
1 |
0.2-0.25 μM |
Reverse Primer (10 μM) |
0.5 |
1 |
0.2-0.25 μM |
裂解產(chǎn)物(DNA模板) |
1 |
2 |
- |
ddH2O |
To 20 |
To 50 |
- |
表1 反應(yīng)體系
*各組分使用前應(yīng)充分混勻。
1)模板加入量:小于PCR反應(yīng)體系的5%,過(guò)多會(huì)嚴(yán)重抑制PCR反應(yīng),強(qiáng)烈推薦加入1 μL模板。葉片直擴(kuò)優(yōu)先推薦研磨儀裂解法。
2)引物終濃度:0.2-0.25 μM可以得到較好結(jié)果。反應(yīng)性能較差時(shí),可在0.1-0.5 μM范圍內(nèi)調(diào)整引物濃度。
3)反應(yīng)體系:推薦使用20 μL或50 μL,以保證目的基因擴(kuò)增的有效性和重復(fù)性。
4)體系配制:配制好PCR反應(yīng)體系,置于渦旋儀上渦旋混勻,瞬時(shí)離心將反應(yīng)液集于管底。
5)對(duì)照反應(yīng):建議進(jìn)行PCR時(shí),設(shè)置陽(yáng)性和陰性PCR對(duì)照反應(yīng)以便于排除假陽(yáng)性或假陰性的干擾。
6)為了更穩(wěn)定的保存裂解后的模板,將轉(zhuǎn)移出來(lái)的上清液,按照裂解產(chǎn)物(DNA模板):Buffer P2 = 5:1的比例混合,混勻后-20℃保存,穩(wěn)定保存隨時(shí)間和樣本狀態(tài)不同而有所不同。如果處理后的植物葉片上清液一周內(nèi)用于PCR擴(kuò)增,不用加Buffer P2,上清液請(qǐng)保存在-20℃。
3.反應(yīng)條件
循環(huán)步驟 |
溫度(°C) |
時(shí)間 |
循環(huán)數(shù) |
預(yù)變性 |
94 |
5 min |
1 |
變性 |
94 |
10 sec |
35 |
退火* |
50-65 |
20 sec |
|
延伸** |
72 |
1 min/kb |
|
終延伸 |
72 |
5 min |
1 |
表2 反應(yīng)條件 |
*退火溫度:請(qǐng)參考引物的理論 Tm 值,退火溫度可設(shè)置低于引物理論值 2-5℃。
**延伸時(shí)間:需要根據(jù)片段的長(zhǎng)度來(lái)確定,對(duì)于1 kb以內(nèi)的DNA片段,建議延長(zhǎng)時(shí)間為1 min。
注意事項(xiàng)
常見(jiàn)問(wèn)題與解決方法
常見(jiàn)問(wèn)題 |
可能原因 |
解決方法 |
陽(yáng)性對(duì)照、待測(cè)樣本均無(wú)條帶。 |
PCR反應(yīng)體系或反應(yīng)條件不合適。 |
使用梯度PCR摸索PCR最佳反應(yīng)條件。 |
PCR試劑保存不當(dāng)失去活性。 |
2×PCR Mix應(yīng)保存于-25~-15℃,使用時(shí)避免反復(fù)凍融。若使用頻繁,可在2-8℃短時(shí)間存放。 |
|
引物設(shè)計(jì)問(wèn)題。 |
嘗試重新設(shè)計(jì)引物進(jìn)行檢查。 |
|
陽(yáng)性對(duì)照有目的條帶,待測(cè)樣本無(wú)條帶或條帶弱。 |
不當(dāng)儲(chǔ)存或長(zhǎng)期儲(chǔ)存引起試劑活性喪失。 |
使用新鮮的試劑。 |
裂解液、中和液加入比例不當(dāng),裂解混合液影響PCR體系的pH值。 |
正常條件下,中和后的裂解混合液的pH應(yīng)該在7-8左右(裂解產(chǎn)物和Buffer P2嚴(yán)格按照5:1的量進(jìn)行中和)。 |
|
樣本裂解混合液保存不當(dāng)或保存時(shí)間過(guò)久,DNA基因組已經(jīng)降解。 |
裂解混合液可在2-8℃保存5天,盡量使用新制備的裂解液混合液進(jìn)行PCR。 |
|
模板加入量不適合。 |
在反應(yīng)體系<5%范圍內(nèi)優(yōu)化模板加入量。 |
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PCR循環(huán)數(shù)不足。 |
適當(dāng)增加PCR的循環(huán)數(shù),推薦在35-40循環(huán)為佳。因?yàn)槟0鍙?fù)雜,一般PCR反應(yīng)要比用純化的DNA模板多5-10個(gè)循環(huán)為佳。 |
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非特異性擴(kuò)增 |
PCR退火溫度太低,循環(huán)數(shù)、引物濃度或模板濃度太高。 |
提高PCR退火溫度,降低PCR循環(huán)數(shù)、引物濃度或模板濃度。 |
PCR引物錯(cuò)配。 |
重新設(shè)計(jì)PCR引物。 |
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配制PCR反應(yīng)體系時(shí)溫度太高或配制完成后放置時(shí)間太久。 |
PCR反應(yīng)體系的配制在低溫下進(jìn)行,配制完成后盡快進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng)。 |
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陰性對(duì)照出現(xiàn)目的條帶 |
操作工具或試劑污染。 |
實(shí)驗(yàn)所有試劑或器材均應(yīng)高壓滅菌。操作時(shí)應(yīng)小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣槍內(nèi)或?yàn)R出離心管外。 |
樣本間交叉污染。 |
每個(gè)取樣器只對(duì)一個(gè)樣本使用;或取完一個(gè)樣本后,將取樣器刃口浸入2%的次氯酸鈉溶液中,反復(fù)涮洗,然后用干凈的紙巾擦干殘液。 |
Ver.CN20250304