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Hieff NGS® Novel DNA Ligation Module for kit 是針對(duì) Illumina® & MGI® 高通量測(cè)序平臺(tái)文庫(kù)構(gòu)建專業(yè)設(shè)計(jì)的 DNA 連接模塊,其中最大的亮點(diǎn)為本產(chǎn)品采用一款我公司自主研發(fā)的高效連接酶 Novel T4 DNA ligase。本產(chǎn)品可在雙鏈平末端 DNA 片段或雙鏈 3´-dA DNA 片段的兩端連接 Illumina® & MGI® 測(cè)序平臺(tái)適用的 DNA 接頭,具有連接效率高、簡(jiǎn)便、可實(shí)現(xiàn)自動(dòng) 化等優(yōu)勢(shì)。本產(chǎn)品中提供的所有試劑組分,都經(jīng)過(guò)嚴(yán)格的質(zhì)量與功能驗(yàn)證,最高程度保障產(chǎn)品優(yōu)異性能與批間穩(wěn)定性。
產(chǎn)品組分
產(chǎn)品編號(hào) |
組分名稱 |
產(chǎn)品編號(hào)/規(guī)格 |
||
12805ES24 |
12805ES96 |
12805ES98 |
||
12805-A |
Novel T4 DNA Ligase |
120 μL |
480 μL |
5×1 mL |
12805-B |
Ligation Enhancer |
720 μL |
4×720 μL |
30 mL |
運(yùn)輸與保存方法
干冰運(yùn)輸。-25~-15℃保存,有效期18個(gè)月。
注意事項(xiàng)
1.為了您的安全和健康,請(qǐng)穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。
2.本產(chǎn)品僅用作科研用途!
使用方法
1.Adapter 的質(zhì)量和使用濃度直接影響連接效率及文庫(kù)產(chǎn)量。Adapter 用量過(guò)高可能會(huì)產(chǎn)生較多 Adapter Dimer;用量較低可 能會(huì)影響連接效率及文庫(kù)產(chǎn)量。表 1 列舉了使用本試劑盒,不同 Input DNA 量推薦的 Adapter 使用量。
表 1 500 pg-1 μg Input DNA 推薦的 Adapter 使用濃度
Input DNA |
Adapter : Input DNA 摩爾比 |
Input DNA |
Adapter : Input DNA 摩爾比 |
1 μg |
10:1 |
50 ng |
100:1 |
500 ng |
20:1 |
25 ng |
200:1 |
250 ng |
40:1 |
1 ng |
200:1 |
100 ng |
100:1 |
500 pg |
400:1 |
【注】:Input DNA 摩爾數(shù)(pmol)≈ Input DNA 質(zhì)量(ng)/ [0.66 × Input DNA 平均長(zhǎng)度(bp)]。
2.目前主流的合并法 DNA 建庫(kù)試劑盒,其末端修復(fù)和加 A 處理后一般不純化,直接進(jìn)行接頭連接。本試劑盒可與主流的 商業(yè)化末端修復(fù)/加 A 體系兼容,進(jìn)行接頭連接。反應(yīng)體系請(qǐng)參考如下配制,渦旋瞬離后置于 20℃,反應(yīng) 15 分鐘即可。
表 2 Adapter Ligation 體系
名稱 |
體積(μL) |
dA-tailed DNA |
60 |
Ligation Enhancer |
30* |
Novel T4 DNA Ligase |
5 |
DNA Adapter |
5** |
【注】:*對(duì)于 3.3×Fast Ligation Buffer,請(qǐng)上下顛倒、振蕩,充分混勻并瞬時(shí)后離心使用。
**根據(jù)自身需求加入適量的接頭,本公司接頭濃度與常規(guī)商業(yè)化試劑盒一致,皆為 15 μM。
【接頭添加計(jì)算舉例】:
當(dāng) Input DNA 為 100 ng,Input DNA 長(zhǎng)度為 300 bp 時(shí),接頭應(yīng)該添加多少?
第一步,計(jì)算 Input DNA 摩爾數(shù)。公式:Input DNA 摩爾數(shù)(pmol)≈ Input DNA 質(zhì)量(ng)/ [0.66 × Input DNA 平均長(zhǎng)度(bp)];
Input DNA 摩爾數(shù)(pmol)=100÷(0.66×300)=0.5 pmol;
第二步,計(jì)算接頭添加摩爾數(shù)。根據(jù)注意事項(xiàng)三表 2 查詢接頭添加比例;
根據(jù)表 2,查得 Input DNA 100ng 時(shí)接頭添加比例 100:1,則接頭添加摩爾數(shù)=100×0.5 pmol=50 pmol;
第三步,計(jì)算接頭添加體積。接頭濃度=15 μmol/L(如使用其他接頭,濃度需要依據(jù)其他接頭濃度參數(shù));
接頭添加體積=接頭添加摩爾數(shù)(50 pmol)÷接頭濃度(15 μmol/L)=3.34 μL(注:15 μmol/L=15 pmol/μL);
綜上,接頭可添加 3.4 μL,加 1.6 μL 水補(bǔ)齊至 5 μL。(注:接頭最大加入體積不超過(guò) 5 μL。
HB230215