T4 RNA Ligase 1,即T4 RNA連接酶1,是一種ATP-依賴的可催化單鏈RNA、單鏈DNA或單核苷酸分子間或分子內(nèi)5'-P末端與3'-OH末端之間形成磷酸二酯鍵的酶。T4 RNA Ligase 1可進(jìn)行RNA之間的連接(效率最高),單鏈DNA與單鏈RNA之間的連接(效率不高),也可用于單鏈DNA之間的連接(效率很低)。適用于單鏈RNA分子的連接、NGS中miRNA文庫構(gòu)建的 5'端接頭連接。
產(chǎn)品信息
貨號 |
14651ES80/ 14651ES90 |
規(guī)格 |
1,000 U / 5,000 U |
單位定義 |
在37℃條件下,30分鐘內(nèi)將1 nmol 的5 -[32P] rA16 轉(zhuǎn)化成磷酸鹽不溶物所需要的酶量定義為1 U。 |
來源 |
大腸桿菌表達(dá)的來源為T4嗜菌體的重組蛋白 |
推薦反應(yīng)條件 |
10×T4 RL1 Reaction Buffer:500 mM Tris-HCl (pH 7.5 at 25℃),100 mM MgCl2,20 mM DTT;最適37℃孵育。 |
失活條件 |
65℃加熱15 min或煮沸2 min可使T4 RNA Ligase 1失活/加入終濃度50 mM EDTA pH 8.0可使T4 RNA Ligase 1反應(yīng)終止。 |
組分信息
組分編號 |
組分名稱 |
14651ES80 |
14651ES90 |
14651-A |
T4 RNA Ligase 1 (10 U/μL) |
100 μL |
500 μL |
14651-B |
10×T4 RL1 Reaction Buffer |
200 μL |
1 mL |
儲存條件
-25~-15℃保存,有效期2年。
使用說明
1. 單鏈RNA的環(huán)化連接反應(yīng)參考下表在冰浴中配制如下反應(yīng)體系
組分 |
使用量(μL) |
10×T4 RL1 Reaction Buffer |
2 |
1 mM ATP |
1 |
單鏈RNA (20 μM) |
0.5 |
PEG-8000 (50%) |
8 |
T4 RNA Ligase 1 (10 U/μL) |
1 |
DEPC水 |
Up to 20 |
2. 單鏈RNA或DNA的分子間連接反應(yīng),參考下表在冰浴中配制如下反應(yīng)體系
組分 |
使用量(μL) |
10×T4 RL1 Reaction Buffer |
2 |
10 mM ATP |
2 |
單鏈RNA (10 μM) |
2 |
單鏈DNA (10 μM) |
2 |
PEG-8000 (50%) |
8 |
T4 RNA Ligase 1 |
2 |
DEPC水 |
Up to 20 |
3. 連接反應(yīng):37℃孵育30 min*。
*如果發(fā)現(xiàn)效果欠佳可以適當(dāng)延長連接反應(yīng)時間或嘗試25℃孵育2 h或16℃孵育16 h。
4. 終止反應(yīng):65℃孵育15 min或煮沸2 min,即可終止反應(yīng)。
注意事項
1. 本品連接的底物無論是單鏈RNA還是單鏈DNA,都需要確保5'末端磷酸化或腺苷酰化,同時3'末端是羥基。
2. 可根據(jù)具體應(yīng)用選擇合適的操作方法,需準(zhǔn)備額外的試劑,如RNase inhibitor、DEPC水等。
3. 根據(jù)連接反應(yīng)的類型,推薦在反應(yīng)體系中加入適量的PEG-8000。建議連接單鏈RNA或DNA的分之間連接反應(yīng)體系中PEG-8000的終濃度為15%-25%,這樣可以顯著提高酶活性,同時不影響反應(yīng)特性。
4. 本產(chǎn)品僅用作科研用途。
5. 為了您的安全和健康,請穿實驗服并佩戴一次性手套操作。
Ver.CN20230419