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YeaCellTM 1st Strand Synthesis kit for Single Cell 3? RNA-seq利用Oligo (dT)18及TSO Primer引物對(duì)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄本基因進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,適用于微流控的微量體系。其產(chǎn)物可以經(jīng)過通用引物進(jìn)行PCR反應(yīng)富集cDNA,然后使用翌圣的酶切建庫(kù)試劑盒,構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)。本產(chǎn)品采用了在M-MLV(RNase H-)Reverse Transcriptase基礎(chǔ)上經(jīng)過多點(diǎn)突變的全新逆轉(zhuǎn)錄酶,具有高逆轉(zhuǎn)錄效率,低錯(cuò)配率,高保真度等優(yōu)勢(shì)。
產(chǎn)品組分
組分編號(hào) |
名稱 |
13594ES04 |
13594ES08 |
13594ES95 |
13594-A |
RT buffer |
76 μL |
152 μL |
2×1130 μL |
13594-B |
RT Enzyme mix |
36 μL |
72 μL |
1056 μL |
運(yùn)輸與保存方法
-25~-15℃保存,有效期1年。
適用范圍
1.適用于哺乳動(dòng)物或者沒有細(xì)胞壁的真核生物細(xì)胞的高通量單細(xì)胞全長(zhǎng)cDNA合成。
2.10 pg~1 μg帶有poly(A)的總RNA。
3.本品不適合原核生物總RNA和有降解的RNA,如FFPE RNA。
注意事項(xiàng)
1.請(qǐng)使用無(wú)RNase污染的耗材,并對(duì)實(shí)驗(yàn)區(qū)域定期進(jìn)行清理,推薦使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM 高效核酸去除噴霧去除RNA酶污染。
2. 建庫(kù)需要的其他試劑需自備或另外購(gòu)買。
3.本產(chǎn)品僅用作科研用途!
使用方法
方法1:若實(shí)驗(yàn)方案為高通量單細(xì)胞實(shí)驗(yàn),根據(jù)不同的單細(xì)胞儀器進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整
1)準(zhǔn)備Reaction Buffer,提前將RT buffer,Template Switch Oligo(自備),Reducing Agent B(自備)室溫解凍,顛倒混勻,微離心于管底,置于冰上備用。
表1 Reaction Buffer反應(yīng)體系
組分/樣品 |
體積(μL) |
RT buffer |
18.8 |
Template Switch Oligo |
2.4 |
Reducing Agent B |
2 |
RT Enzyme mix |
8.8 |
Total |
32 |
2)按照上表將各組分混合于8聯(lián)排低吸附離心管中,槍頭緩慢吹打瞬離,置于冰上。
3)后續(xù)使用參照Cat#12520ES(適配10x Genomics單細(xì)胞儀器)說明書進(jìn)行后續(xù)操作。
方法2:若為逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn),參考此步驟
Step 1 RNA變性
1.按照表2配置反應(yīng)液:
表2 RNA預(yù)變性反應(yīng)體系
名稱 |
體積(μL) |
Oligo (dT)18(20~50 mM)(自備) |
1 |
已裂解的cell or RNA |
12 |
Total |
13 |
2.使用移液器輕輕吹打混勻,瞬離將反應(yīng)液離心至管底。于PCR儀上進(jìn)行如下反應(yīng):(熱蓋80℃ on)70℃,5 min;立即置于冰上3 min。
Step 2 第一鏈cDNA的合成(1st Strand Synthesis)
1. 將第一鏈合成試劑從-20°C取出,室溫解凍,顛倒混勻后瞬離。按表3所示,配制第一鏈cDNA合成的反應(yīng)液。
表3 第一鏈cDNA合成反應(yīng)體系
名稱 |
體積(μL) |
上一步 |
13 |
5×RT Buffer |
4 |
TSO Primer(需自行摸索濃度)(自備) |
1 |
RT Enzyme mix |
1 |
ddH2O |
1 |
Total |
20 |
2.使用移液器輕輕吹打混勻,瞬離將反應(yīng)液離心至管底。于PCR儀上進(jìn)行如下反應(yīng):(熱蓋105℃ on)42℃,90 min;70℃,15min;4℃,hold。
3.產(chǎn)物可直接用于二鏈cDNA合成或于-80℃暫存。
Ver. CN20230706