2020年,疫情席卷全球,分子診斷技術(shù)站了在世界的舞臺中央。熒光PCR法作為新 冠病毒核酸檢測的金標(biāo)準(zhǔn),為新 冠病毒的檢測提供了有力保障。然而,檢測結(jié)果不準(zhǔn)確、假陽性和假陰性等問題,也一度讓分子診斷技術(shù)備受爭議。深究原因排除人為操作因素外,歸根結(jié)底要考慮試劑盒的質(zhì)量問題。而新 冠檢測過程中的核心成分--擴(kuò)增模塊中的熱啟動酶,無疑是其中關(guān)鍵的一環(huán)。
市面上診斷試劑盒擴(kuò)增模塊中的酶基本上都是抗體法熱啟動酶,但實(shí)際樣本檢測中不同廠家的酶原料差異又很大。那為何選擇抗體法熱啟動酶作為IVD核心酶,其質(zhì)量如何評測,又如何篩選出高質(zhì)量的抗體法熱啟動酶?
為何選擇抗體法熱啟動酶作為IVD核心酶
熱啟動酶在IVD領(lǐng)域應(yīng)用較為廣泛,很好的解決了常規(guī)型PCR技術(shù)因產(chǎn)生引物二聚體或錯配引起的非特異性擴(kuò)增等問題,大大提高了反應(yīng)的特異性,從而實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)檢測。目前市面上常見的熱啟動酶按熱啟動修飾方法主要分為化學(xué)法、配體法和抗體法等。這三種方法在原理上有所區(qū)別,也各有優(yōu)劣勢(見表1)。
表1. 熱啟動酶常見修飾方法優(yōu)劣勢比較
相比較而言,化學(xué)修飾物不能夠批量合成,而且需要較長的激活時間DNA聚合酶才能釋放酶活;配體修飾DNA聚合酶只在20-25°C效果較好,到40°C時,聚合酶的活性就被釋放出來,即酶活封閉效果不穩(wěn)定,特異性不好;而抗體修飾的熱啟動酶可以達(dá)到很好的封閉酶活的效果,即對應(yīng)的封閉效果最佳,且酶活釋放速度快,能大大降低PCR的反應(yīng)時間,因此是目前IVD市場上應(yīng)用最多的DNA聚合酶熱啟動改造方法。
抗體法熱啟動酶的評測指標(biāo)
Taq酶的酶活、擴(kuò)增效率、靈敏度、抗體封閉效果等都是抗體法熱啟動酶的主要評測指標(biāo)。
Taq酶活
Taq酶活測定目前在分子診斷行業(yè)沒有固定的標(biāo)準(zhǔn),不同廠家酶活標(biāo)定的方法不同,導(dǎo)致客戶使用中會出現(xiàn)較大的問題。一般測試方法是同位素的方法進(jìn)行測定。這種方法具有高靈敏性,但只能檢測聚合酶活性,有時候并不能反映出實(shí)際TaqMan探針的擴(kuò)增效果。TaqMan探針法qPCR除了需要Taq酶5'→3'聚合酶活性外,還需要檢測Taq酶的5'→3'外切酶活性。這就是常規(guī)Taq酶活性測定的缺陷。建議大家購買了特定公司的Taq酶之后需要用自己設(shè)計的引物探針進(jìn)行實(shí)際酶活的二次標(biāo)定,以減少應(yīng)用中的不確定性。翌圣生物除了做Taq酶5'→3'聚合酶活性檢測之外,還利用TaqMan的方法進(jìn)行5'→3'外切酶活性的標(biāo)定,減少了客戶實(shí)際應(yīng)用中的問題。
擴(kuò)增效率
PCR反應(yīng)的擴(kuò)增效率與DNA聚合酶的性能密切相關(guān)。通常驗證擴(kuò)增效率是將模板稀釋成一系列濃度梯度進(jìn)行qPCR反應(yīng),用模板初始量(或未知量樣品的稀釋倍數(shù))的log值對每個稀釋樣品的Ct值,做標(biāo)準(zhǔn)曲線圖,得到斜率和R2值,擴(kuò)增效率通過公式E=10-1/斜率-1計算,若介于90~110%,表示擴(kuò)增正常。若<90%,則可能qPCR整個反應(yīng)條件不適宜或引物設(shè)計不當(dāng)。
擴(kuò)增效率與酶的比活性有較大的關(guān)系。酶的純度越高,比活性相對就高,這樣可以減少非活性Taq酶與底物的結(jié)合,提高有效擴(kuò)增幾率。
靈敏度
Taq酶的靈敏度和很多方面都有很大的關(guān)系,除了上面提到的酶純度,還有一個方面是Taq酶和底物的親和性,如果親和性越高,靈敏度自然就會比較高。相比底物親和性較低的Taq酶就需要通過提高酶濃度,即增加單次反應(yīng)中的Taq酶的分子數(shù)來達(dá)到提高靈敏度的目的。這時試劑成本就會提高很多。翌圣生物通過篩選高親和性Taq突變體,保障了個位拷貝數(shù)檢出的靈敏度。
抗體封閉效果
熱啟動Taq酶是提高PCR擴(kuò)增靈敏度和特異性的重要的因素之一。非熱啟動的Taq酶由于在試劑配制過程中,會有一定的活性,容易導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增,最終會導(dǎo)致靈敏度的降低。一個活性有效封閉的Taq酶對于qPCR的有效擴(kuò)增至關(guān)重要。翌圣生物通過高通量篩選抗體,獲得了高親和,易釋放的抗體,并開發(fā)了相關(guān)的檢測方法,保障了熱啟動Taq酶的高品質(zhì)。
1. 熔解曲線測定性法
設(shè)置非熱啟動組、抗體封閉組、和無聚合酶對照組,將模板和引物對加入SYBR Green染料法qPCR的反應(yīng)體系中,37℃孵育40 min,分別檢測熔解曲線。非熱啟動組顯示出有擴(kuò)增產(chǎn)物生產(chǎn),而另外兩組是引物二聚體,沒有產(chǎn)物形成。這說明抗體封閉效果明顯。
圖1. Taq Antibody封閉效果熔解曲線
2. 熒光值定量法
一般通過對比非熱啟動組、抗體封閉組和無聚合酶對照組的熒光值高低判斷封閉效果。在50℃ 條件下進(jìn)行延伸,反應(yīng)后取產(chǎn)物,加入適量PicoGreen染色液染色混勻后,進(jìn)行熒光信號檢測。根據(jù)熒光值判斷熱啟動酶活封閉效果,進(jìn)一步計算封閉效率,一般認(rèn)為封閉效率大于90%即認(rèn)為封閉效果良好。
表2. 熱啟動酶抗體封閉效率檢測
備注:封閉效率=100% -(樣本熒光值-陰性熒光值)/(陽性熒光值-陰性熒光值)
如何生產(chǎn)高質(zhì)量的抗體法熱啟動酶
生產(chǎn)合格的IVD試劑,一般是在原料控制、生產(chǎn)管理、質(zhì)檢管控和倉儲運(yùn)輸?shù)葞讉€環(huán)節(jié)嚴(yán)格把控,層層把關(guān)。而抗體法熱啟動酶作為IVD試劑的核心原料,生產(chǎn)高質(zhì)量的抗體法熱啟動酶主要考慮其中兩個核心組分:封閉用抗體和DNA聚合酶。因此在原料把控、生產(chǎn)管理、質(zhì)檢管控和倉儲運(yùn)輸?shù)确矫嬉残枰髦稚鳌?/span>
原料管控
嚴(yán)格的原料質(zhì)量管理標(biāo)準(zhǔn),包括采購標(biāo)準(zhǔn)和保存標(biāo)準(zhǔn)。重要原料每批質(zhì)檢并留樣保存??贵w法熱啟動酶的核心原料:封閉用抗體和配套的buffer離子。在原料管控方面主要注意避免引入外源性污染,而封閉抗體的篩選,在確??贵w的純度外還需要進(jìn)一步檢測宿主DNA殘留。
生產(chǎn)管理
嚴(yán)格按照IVD產(chǎn)品生產(chǎn)標(biāo)準(zhǔn)管理生產(chǎn)流程。從小樣研發(fā)配制到規(guī)?;a(chǎn),穩(wěn)定生產(chǎn)工藝,保證批次穩(wěn)定性。同時嚴(yán)格把控包裝流程??贵w法熱啟動酶生產(chǎn)時需要根據(jù)抗體純度和DNA聚合酶的酶活,精準(zhǔn)配比保證產(chǎn)品質(zhì)量。
質(zhì)檢管控
產(chǎn)品質(zhì)量控制嚴(yán)格遵循“三重防護(hù)”:中間原料質(zhì)檢,成品自檢留樣、成品抽檢管控??贵w法熱啟動酶生產(chǎn)后的質(zhì)控環(huán)節(jié),主要在核酸酶殘留檢測、大腸桿菌檢測、DNA擴(kuò)增能力測試和抗體法熱啟動酶酶活封閉效果檢測等方面,同時在不同批次的穩(wěn)定性把控方面堅持質(zhì)量問題“零容忍”。
倉儲運(yùn)輸
遵循模塊化倉儲,冷鏈運(yùn)輸原則。
翌圣提供高品質(zhì)IVD核心酶原料
翌圣生物作為長期專注于分子酶原料及建庫試劑盒等產(chǎn)品研發(fā)和生產(chǎn)的國家高新技術(shù)企業(yè),依托長期儲備的分子酶雙向改造技術(shù)、蛋白發(fā)酵純化技術(shù)和高效抗體篩選技術(shù)平臺,翌圣生物酶原料可應(yīng)用于IVD分子診斷、治療領(lǐng)域。
不僅可提供抗體法熱啟動酶和封閉用Taq酶抗體和Taq酶5'→3'外切酶單克隆抗體,也可提供包括RT-PCR檢測試劑盒組裝用的核心試劑和所需的一系列關(guān)鍵分子酶原料,包括抗體法Taq酶、反轉(zhuǎn)錄酶、RNase抑制劑和UDG酶/dUTP等。
相關(guān)產(chǎn)品
應(yīng)用類型 |
產(chǎn)品名稱 |
貨號 |
抗體法熱啟動酶 |
10717ES |
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Hieff UNICON® HotStart J-Taq DNA Polymerase |
10723ES |
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Taq酶抗體 |
31301ES |
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31302ES |
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31303ES |
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逆轉(zhuǎn)錄酶 |
11300ES |
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RNase抑制劑 |
10603ES/ 10703ES |
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熱敏UDG酶 |
10303ES |
HB210617