背景介紹
磁珠是高通量測序過程必備產(chǎn)品,通過磁顆?;钚曰鶊F在一定條件下可與核酸結(jié)合和解離的原理,將樣本中目的片段分離。可實現(xiàn)對核酸樣本的高通量自動化操作,廣泛應用于基因測序以及分子診斷領(lǐng)域。
商業(yè)化磁珠產(chǎn)品體系一般包含:磁珠、聚乙二醇(PEG)、鹽離子等。基于SPRI(Solid Phase Reversible Immobilization )技術(shù), DNA在一定濃度的PEG存在條件下,NaCl或MgCl2促進條件下,DNA分子構(gòu)象會發(fā)生急劇變化,會暴露出磷酸骨架上大量的帶負電荷的磷酸基團,與表面帶負電荷的羧基磁珠結(jié)合。帶負電磷酸基團借由解離的鹽離子(如Na+)與羧基形成離子橋,使DNA被特異性吸附到羧基磁珠表面。利用磁珠的磁性,可通過外加磁場進行收集洗脫,不同長度的DNA片段可以被選擇性的沉淀出來。
圖1. 磁珠結(jié)構(gòu)示意圖與磁珠吸附DNA原理示意圖
產(chǎn)品描述
Hieff NGS® DNA Selection Beads基于SPRI (Solid Phase Reverse Immobilization)原理,配合精心優(yōu)化過的緩沖體系,可用于二代測序文庫構(gòu)建過程中的DNA片段分選、純化。本產(chǎn)品可適用于各品牌的DNA、RNA建庫試劑盒,和目前廣泛使用的AMPure XP Beads使用方式相同,片段回收效率和文庫大小分布均與AMPure XP Beads高度吻合。
產(chǎn)品特點
» 品質(zhì)保證:采用進口原材料,品質(zhì)高度穩(wěn)定。
»無縫替換:產(chǎn)品原理,產(chǎn)品操作與實驗結(jié)果與AMPure XP保持高度一致。
»兼容性高:兼容目前市面上所有的DNA/RNA建庫試劑盒。
»批次穩(wěn)定:嚴格的批次性能與穩(wěn)定性質(zhì)控,單次能產(chǎn)20L。
操作流程
圖2. DNA分選操作示意圖
性能展示
» 回收效率與XP高度一致
相同小牛胸腺基因組DNA,分別使用Yeasen磁珠與進口XP磁珠,在不同分選比列條件下, 片段大小與回收產(chǎn)量高度一致。
品牌 |
磁珠比例 |
測試值1 |
測試值2 |
平均值 |
回收效率對比 |
XP |
1.8x |
14.4 |
14.8 |
14.6 |
0.99 |
Yeasen |
14.8 |
14 .8 |
14.8 |
||
XP |
0.8x |
13.2 |
13.1 |
13.15 |
1.04 |
Yeasen |
12.5 |
12.7 |
12.6 |
||
XP |
0.6x |
10.7 |
9.18 |
9.94 |
0.91 |
Yeasen |
11.0 |
10.8 |
10.9 |
||
XP |
0.5x |
9.26 |
9.88 |
9.57 |
1.27 |
Yeasen |
6.58 |
8.46 |
7.52 |
» 分選效果與XP一致
利用模式樣本,用XP磁珠和Yeasen磁珠做平行實驗,Yeasen磁珠分選效果與Beckman磁珠對比,二者回收效率,分選片段大小基本一致。
圖3. 磁珠分選效果與AMPure XP磁珠對比
» 批次間穩(wěn)定性好
Yeasen三個批次磁珠的回收效率高度一致,批間穩(wěn)定性佳。
樣本 |
測試人 |
Input(ng) |
純化(1.8×) |
||
純化后(ng) |
回收率% |
平均回收率 |
|||
B-YS |
測試人1 |
169.5 |
159.75 |
94.25% |
94.5% |
C-YS |
162 |
95.58% |
|||
D-YS |
158.75 |
93.66% |
|||
B-YS |
測試人2 |
169.5 |
155 |
91.45% |
91.94% |
C-YS |
154.25 |
91% |
|||
D-YS |
158.25 |
93.36% |
» 性價比更高
相同規(guī)格產(chǎn)品,Yeasen磁珠價格遠低于AMPure XP價格,性價比更高。
價格對比
圖4. Yeasen磁珠與AMPure XP磁珠價格對比
訂購信息
類型 |
名稱 |
貨號 |
規(guī)格 |
完美替換XP |
12601ES03 |
1 mL |
|
12601ES08 |
5 mL |
||
12601ES56 |
60 mL |
||
12601ES75 |
450 mL |
HB210802