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      精品推薦|雙管齊下,miRNA表達分析變得更加簡單

      MicroRNAs(miRNAs)是一種大小約21-23個堿基的單鏈小分子RNA,是由具有發(fā)夾結構的約70-90個堿基大小的單鏈RNA前體經(jīng)過Dicer酶加工后生成。miRNA主要與靶基因mRNA3‘端非編碼區(qū)域特異性結合,調(diào)控轉(zhuǎn)錄后靶基因mRNA的翻譯過程,從而阻斷mRNA翻譯和促進mRNA降解導致蛋白質(zhì)表達降低。miRNA的作用涉及個體發(fā)育、組織分化、細胞增殖和細胞凋亡等多種心血管疾病的發(fā)生發(fā)展。


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      1.miRNA體內(nèi)合成示意


       成熟的miRNA的長度只有20nt左右,通常正向引物就會覆蓋其全長甚至會有多余部分,反向引物就無處安置了。目前市面上解決方案就是在反轉(zhuǎn)錄時設法增加反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物長度。常見的方法有加尾法和莖環(huán)法。

       

      加尾法利用PolyA 聚合酶為成熟的miRNA加上Poly(A)尾,以帶有通用序列的Oligo-dT作為反轉(zhuǎn)錄引物,合成加長miRNA對應的cDNA第一鏈。莖環(huán)法以折疊為莖環(huán)結構的通用序列作為引物合成加長miRNA對應的cDNA第一鏈,后續(xù)擴增過程中,莖環(huán)結構在適宜的溫度下會被打開,和相關擴增引物結合。

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      2. 加尾法合成miRNA

       

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      3.莖環(huán)法合成miRNA


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      產(chǎn)品推薦

       

       

      翌圣miRNA加尾法反轉(zhuǎn)定量組合(11148ES&11171ES)

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      11148ES-Hifair® miRNA 1st Strand cDNA Synthesis Kit(加 A 法)


      試劑盒采用加尾法來進行miRNA第一鏈cDNA的反轉(zhuǎn)錄,產(chǎn)品中的2×Hifair® miRNA RT buffer包含了miRNA加尾反應和反轉(zhuǎn)錄反應的所有原料和引物,并經(jīng)過精心優(yōu)化,可保證miRNA 3‘末端的Poly(A)修飾過程和反轉(zhuǎn)錄過程同時高效進行。

       

      11171ES-Hieff® miRNA Universal qPCR SYBR Master Mix(加A法)

       

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      專門為miRNA定量檢測而研發(fā)的新一代預混形式的熒光定量PCR檢測試劑,含有特殊的ROX Passive Reference Dye,適用于所有qPCR儀器,無需在不同的儀器上調(diào)整ROX的濃度,只需在配制反應體系時加入引物和模板即可進行擴增。DNA 聚合酶采用化學修飾的熱啟動聚合酶,配合特殊的Buffer體系,使反應特異性更好,靈敏度更高,并能在更廣的范圍內(nèi)進行準確定量。

       

       

       
      產(chǎn)品性能

       

      ? 可兼容全平臺qPCR儀器

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      .以293T細胞的Total RNA為模板,用Hifair® miRNA 1st Strand cDNA Synthesis Kit (Cat# 11148ES)進行反轉(zhuǎn)錄,獲得的cDNA稀釋10倍后,用Hieff® miRNA Universal qPCR SYBR Master Mix (Cat# 11171ES)分別檢測hsa-miR-let-7b-5p、hsa-miR-let-7c-5p、U6內(nèi)參基因。

       

      ? 檢出率高,最高可達10 pg

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      . 以人工合成hsa-miR-let-7e-5p(a)和293T細胞Total RNA(b)為模板,分別稀釋成以下梯度:60拷貝到606拷貝(6個梯度)和10 pg-100 ng(5個梯度),用Hifair®miRNA 1st Strand cDNA Synthesis Kit (Cat# 11148ES)進行反轉(zhuǎn)錄,獲得的cDNA用Hieff® miRNA Universal qPCR SYBR Master Mix (Cat# 11171ES)檢測hsa-miR-let-7e-5p基因表達情況。

       

       

       

      ? 高特異性,能區(qū)分同家族miRNA間單堿基差異

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      . 人類hsa-let-7家族擁有多條miRNA,彼此間相差的堿基很少,甚至只有單堿基的差異。每個Let-7亞型(hsa-miR-let-7a~Let-7i,has-miR-98)的人工合成miRNA使用 Hifair®miRNA 1st Strand cDNA Synthesis Kit (Cat# 11148ES)進行反轉(zhuǎn)錄合成cDNA,以不用的引物,用Hieff®miRNA Universal qPCR SYBR Master Mix (Cat# 11171ES)分別擴增這些miRNA,利用公式2-ΔCTx 100%計算匹配率。結果顯示,可有效區(qū)分密切相關的亞型家族成員。

       

      ? 擴增效率出色

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      . 以人293T細胞和鼠源肝臟Total RNA為模板,擴增miR-let-7b-5p、miR-let-7c-5p、miR-let-7e-5p、miR-let-7f-5p基因。結果顯示,與同類產(chǎn)品相比,Hifair®miRNA 1st Strand cDNA Synthesis Kit (Cat# 11148ES)配套 Hieff® miRNA Universal qPCR SYBR Master Mix (Cat# 11171ES)的反應體系,具有優(yōu)異的表現(xiàn)。

       

       

      ? 穩(wěn)定性優(yōu)秀,在 37℃穩(wěn)定7天或凍融50次或配置體系在25℃保留48 h,效果依舊穩(wěn)定

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      . 以293T細胞Total RNA為模板用Hifair® miRNA 1st Strand cDNA Synthesis Kit (Cat# 11148ES) 進行反轉(zhuǎn)錄,獲得的cDNA稀釋10倍,用Hieff® miRNA Universal qPCR SYBR Master Mix (Cat# 11171ES) 檢測hsa-miR-let-7b-5p、hsa-miR-let-7c-5p、hsa-miR-let-7e-5p的表達情況?!鰿t<0.5。

       

       

      翌圣miRNA莖環(huán)法反轉(zhuǎn)定量組合(11139ES&11170ES)

       

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      11139ES-Hifair® III 1st Strand cDNA Synthesis Kit(gDNA digester plus)

       

      該試劑盒基于Hifair® III Reverse Transcriptase而開發(fā)。該酶cDNA合成速度快,且熱穩(wěn)定性大幅度提高,可耐受高達60℃的反應溫度,適合具有復雜二級結構的RNA模板的反轉(zhuǎn)錄。同時,該酶增強了與模板的親和力,適合少量模板以及低拷貝基因的反轉(zhuǎn)錄。Hifair® III Reverse Transcriptase合成全長cDNA的能力也有了提升,可合成長達19.8 kb的cDNA。 

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      11170ES-Hieff® miRNA Universal qPCR SYBR Master Mix(莖環(huán)法)

      本產(chǎn)品是使用SYBR Green I嵌合熒光法進行miRNA定量反應的專用預混液。由于miRNA序列短,且同一家族的miRNA序列往往高度相近,故在定量時對特異性要求極高。本品基于熱啟動的 DNA 聚合酶,配以優(yōu)化的Buffer,能夠極大地減少非特異性擴增;同時,特殊的ROX Reference Dye,使得預混液適應于所有qPCR儀器,無需在不同的儀器上調(diào)整ROX濃度,只需在配制反應體系時加入引物和模板即可進行擴增。

       

       

      產(chǎn)品性能

       

      ?可兼容全平臺qPCR儀器

       

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      .以小鼠肝臟細胞的Total RNA為模板,用Hifair® III 1st Strand cDNA Synthesis Kit (gDNA digester plus)(Cat# 11139ES)進行反轉(zhuǎn)錄,獲得的cDNA稀釋40倍后,用Hieff®miRNA Universal  qPCR SYBR Master Mix(Cat# 11170ES)分別擴增人源的mmu-miR-125a基因。

       

       

      ?靈敏度高,可達10 pg

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      .以小鼠肝臟細胞的Total RNA為模板,用Hifair® III 1st Strand cDNA Synthesis Kit (gDNA digester plus)(Cat# 11139ES)進行反轉(zhuǎn)錄,獲得的cDNA 以10倍梯度稀釋(范圍10pg /μL-0.1μg /μL),擴增鼠源的mmu-miR-125a、mmu-miR-132、mmu-miR-351基因。

       

       

      ?高特異性,能區(qū)分同家族miRNA間單堿基差異

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      . 人類hsa-let-7家族擁有多條miRNA,彼此間相差的堿基很少,甚至只有單堿基的差異。以不同的引物,使用 Hieff® miRNA Universal  qPCR SYBR Master Mix(Cat# 11170ES)分別擴增這些miRNA,利用公式2^-△ct x 100%計算匹配率。

      重復性好

       

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      .以人293T細胞的Total RNA為模板反轉(zhuǎn)錄,用Hifair® III 1st Strand cDNA Synthesis Kit (gDNA digester plus)(Cat# 11139ES)進行反轉(zhuǎn)錄,獲得的cDNA稀釋50倍,使用Hieff® miRNA Universal  qPCR SYBR Master Mix(Cat# 11170ES)進行90孔平行重復實驗擴增人源的hsa-let-7a基因。

       


      ?穩(wěn)定性好,37℃穩(wěn)定14天或凍融穩(wěn)定50次或配置體系在25℃保留24h后,效果依舊穩(wěn)定

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      .以小鼠肝臟細胞的Total RNA為模板用Hifair® III 1st Strand cDNA Synthesis Kit (gDNA digester plus)(Cat# 11139ES)進行反轉(zhuǎn)錄,獲得的cDNA稀釋100倍,擴增鼠源的mmu-miR-132基因。

       

      相關產(chǎn)品列表

       

       

      方法類型

      實驗步驟

      產(chǎn)品名稱

      產(chǎn)品貨號

      加尾法

      反轉(zhuǎn)錄

      Hifair® miRNA 1st Strand cDNA Synthesis Kit

      11148ES

      定量PCR

      Hieff® miRNA Universal qPCR SYBR Master Mix

      11171ES

      莖環(huán)法

      反轉(zhuǎn)錄

      Hifair® III 1st Strand cDNA Synthesis Kit(gDNA digester plus)

      11139ES

      定量PCR

      Hieff® miRNA Universal qPCR SYBR Master Mix

      11170ES

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      400-6111-883