16S (V3V4)細菌擴增子建庫試劑盒利用高通量測序技術(shù)對16S rDNA中V3-V4區(qū)片段進行擴增,結(jié)合生物信息學技術(shù),檢測特定環(huán)境下的微生物(主要是細菌),鑒定所檢細菌種類,提供環(huán)境樣本物種分類、物種豐度、種群結(jié)構(gòu)、系統(tǒng)進化等諸多信息。本試劑盒中包含進行細菌16S rDNA擴增的所有試劑,16S擴增引物F/R用于擴增細菌16S rDNA前500 bp的DNA 片段,組合Hieff NGS® Tagment Index Kit for Illumina(Cat#12416)用于全序列DNA片段的擴增。試劑盒中提供的所有試劑都經(jīng)過嚴格的質(zhì)量控制和功能驗證,最大程度上保證了文庫構(gòu)建的穩(wěn)定性和重復性。
16S rRNA位于原核細胞核糖體小亞基上,包括10個保守區(qū)域(Conserved Regions)和9個高變區(qū)域(Hypervariable Regions),其中保守區(qū)在細菌間差異不大,高變區(qū)具有屬或種的特異性,隨親緣關(guān)系不同而有一定的差異。因此,16S rDNA可以作為揭示生物物種的特征核酸序列,被認為是最適于細菌系統(tǒng)發(fā)育和分類鑒定的指標。16S rDNA擴增子測序(16S rDNA Amplicon Sequencing),通常是選擇某個或某幾個變異區(qū)域,利用保守區(qū)設計通用引物進行PCR擴增,然后對高變區(qū)進行測序分析和菌種鑒定,16S rDNA擴增子測序技術(shù)已成為研究環(huán)境樣本中微生物群落組成結(jié)構(gòu)的重要手段。對于不同環(huán)境樣品的DNA,擴增其中16S rDNA中V3-V4區(qū)片段,可以區(qū)分鑒定絕大多數(shù)細菌,是最常用的細菌分類標準。
?適用100 pg- 10 ng的Meta樣品,如糞便、土壤或Meta DNA樣品等
?多樣本驗證可獲得優(yōu)異的文庫與測序數(shù)據(jù)
?嚴格的批次性能與穩(wěn)定性質(zhì)控
病原tNGS;DNA擴增子建庫
圖1. 微生物標準品16S測序?qū)偎綑z測的微生物占比分析
組分編號 |
|
組分名稱 |
12983ES08 |
12983ES24 |
12983ES96 |
12983-A |
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2×Hieff® Multiplex PCR Master Mix |
100 μL |
300 μL |
1200 μL |
12983-B |
? |
16S Primer Mix |
16 μL |
48 μL |
192 μL |
12983-C |
? |
2×Hieff Canace® Amplification Mix |
100 μL |
300 μL |
1200 μL |
【注】:本試劑盒組分適應于Illumina® 測序平臺,需要組合專屬于Illumina® 平臺的Hieff NGS® Tagment Index Kit for Illumina®(Cat# 12416 )。
12983-A組分 4℃保存,其他組分-25~-15℃保存,有效期1年。
圖1 文庫制備流程圖
Ver.CN20241030