產(chǎn)品說明書
FAQ
COA
已發(fā)表文獻
核心賣點
可以適配MGI平臺的甲基化建庫試劑盒；可以適配MGI平臺的微量樣本建庫試劑盒；
產(chǎn)品應用
適用于各種常規(guī)樣本和經(jīng)Bisulfite處理的樣本類型，包括gDNA、FFPE DNA、cell free DNA (cfDNA)、ChIP DNA等，可以滿足10 pg~250 ng DNA樣本建庫。該試劑盒可兼容短至40 bp的DNA樣本，滿足常規(guī)微量且短片段樣本的建庫。
產(chǎn)品優(yōu)勢
投入量低：可滿足10 pg~250 ng起始量的樣本建庫
數(shù)據(jù)質(zhì)量佳：不同樣本類型及不同投入量條件下均表現(xiàn)出優(yōu)異的數(shù)據(jù)質(zhì)量
操作簡便：2小時左右可以完成建庫
樣本兼容性好：適用于各種常規(guī)樣本和經(jīng)Bisulfite處理的樣本
產(chǎn)品描述
Hieff NGS® Methyl-seq ssDNA Library Prep Kit for MGI® 是針對MGI® 測序平臺專業(yè)開發(fā)設計的新一代單鏈DNA甲基化建庫試劑盒，該試劑盒改善了接頭連接效率，并采用了更加新型的高保真酶，顯著提高擴增均一性和保真性。適用于各種常規(guī)樣本和經(jīng)Bisulfite處理的樣本類型，包括gDNA、FFPE DNA、cell free DNA (cfDNA)、ChIP DNA等，可以滿足10 pg~250 ng DNA樣本建庫。該試劑盒可兼容短至40 bp的DNA樣本，滿足常規(guī)微量且短片段樣本的建庫。相較于傳統(tǒng)的雙鏈DNA甲基化建庫，我們提供了一種基于DNA單鏈的甲基化建庫方法，經(jīng)過DNA 變性、3’Adapter連接、互補鏈延伸、5’Adapter 連接及文庫擴增，將DNA片段最終轉(zhuǎn)化為適用于MGI®平臺測序的文庫。本產(chǎn)品不僅更加經(jīng)濟，同時也提供了簡便快速的建庫流程，一般在2小時左右可以完成正常建庫。
本試劑盒包含3’接頭連接試劑，互補鏈合成試劑，5’接頭連接試劑以及后續(xù)文庫擴增所需的高保真酶試劑。試劑盒提供的所有試劑都經(jīng)過嚴格的質(zhì)量控制和功能驗證，最大程度上保證了文庫構(gòu)建的穩(wěn)定性和重復性。
實驗數(shù)據(jù)
- 亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化后，采用12221和12226建庫，不同樣本投入量下的文庫產(chǎn)量和下機數(shù)據(jù)基本指標。
MGI平臺甲基化建庫試劑12226和Illumina平臺甲基化建庫試劑12221的性能相當，MGI平臺甲基化建庫試劑12226的dup率更低。
圖1 不同樣本投入量下的文庫產(chǎn)量和下機數(shù)據(jù)基本指標
- 亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化和酶法轉(zhuǎn)化后，采用12226建庫，不同樣本投入量下的文庫產(chǎn)量和下機數(shù)據(jù)基本指標。
相同的樣本投入量，酶法轉(zhuǎn)化搭配MGI平臺甲基化建庫試劑12226的文庫濃度和數(shù)據(jù)質(zhì)量更高，插入片段更長，文庫豐富度更高。
圖2 亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化和酶法轉(zhuǎn)化后的文庫產(chǎn)量和下機數(shù)據(jù)基本指標
組分信息
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組分編號 |
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組分名稱 |
12226ES08 |
12226ES24 |
12226ES96 |
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12226-A |
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Ligation Buffer A 2.0 |
32 μL |
96 μL |
384 μL |
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12226-B |
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T7 Adapter 2.0 |
8 μL |
24 μL |
96 μL |
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12226-C |
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Enzyme Mix 2.0 |
32 μL |
96 μL |
384 μL |
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12226-D |
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Extension Mix 2.0 |
344 μL |
1032 μL |
3×1376 μL |
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12226-E |
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Extension Reagent 2.0 |
24 μL |
72 μL |
288 μL |
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12226-F |
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Ligation Buffer B 2.0 |
160 μL |
480 μL |
2×960 μL |
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12226-G |
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T5 Adapter 2.0 |
24 μL |
72 μL |
288 μL |
|
12226-H |
|
T4 DNA ligase 2.0 |
40 μL |
120 μL |
480 μL |
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12226-I |
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2 × HiFi Uracil PCR Mix 2.0 |
200 μL |
600 μL |
2×1200 μL |
存儲條件
-25~-15℃保存，有效期1年。
Ver. CN20240902
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