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產(chǎn)品描述
本產(chǎn)品是2×實(shí)時(shí)定量PCR擴(kuò)增的預(yù)混合溶液。采用的抗體法熱啟動(dòng)DNA聚合酶(貨號(hào):10113ES),在預(yù)變性溫度(95℃)加熱30sec,UNICON® Taq抗體失活,釋放出Taq DNA Polymerase活性。抗體法熱啟動(dòng)Taq酶可以有效抑制引物非特異性退火導(dǎo)致的擴(kuò)增。同時(shí),配方優(yōu)化了有效抑制非特異性PCR擴(kuò)增的因子和提升PCR反應(yīng)擴(kuò)增效率的因子,適合低濃度模板的擴(kuò)增,使定量PCR可以在寬廣的定量區(qū)域內(nèi)獲得良好的標(biāo)準(zhǔn)曲線。
Mix中含有Hieff® Taq DNA Polymerase、UNICON® Taq抗體、SYBR Green I、dNTPs、Mg2+及High Rox。使用時(shí),僅需在擴(kuò)增體系中加入模板和引物即可進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR,大大簡化操作過程,降低污染幾率。
適用機(jī)型
Applied Biosystems: 5700, 7000, 7300, 7700, 7900HT FAST, StepOne, StepOne Plus.
運(yùn)輸與保存方式
冰袋運(yùn)輸。-20℃避光儲(chǔ)存,有效期18個(gè)月。
本品避免反復(fù)凍融。產(chǎn)品中含有熒光染料SYBR Green I,保存或配制反應(yīng)體系時(shí)需避免強(qiáng)光照射。
注意事項(xiàng)
1. 解凍后Master Mix可能出現(xiàn)絮狀物質(zhì),4℃放置并上下顛倒混勻至溶液澄清,不影響試劑性能。
2. 推薦使用本公司cDNA合成試劑盒(貨號(hào):11123ES),以有效去除RNA樣品中殘留的基因組。
3. 為了您的安全和健康,請(qǐng)穿實(shí)驗(yàn)服并佩戴一次性手套操作。
4. 本產(chǎn)品僅作科研用途!
反應(yīng)體系(推薦冰上配制)
組分 |
體積(μl) |
體積(μl) |
終濃度 |
Hieff UNICON® qPCR SYBR® Green Master Mix (抗體法,High Rox) |
25 |
10 |
1× |
Forward Primer (10 μM) |
1 |
0.4 |
0.2 μM |
Reverse Primer (10 μM) |
1 |
0.4 |
0.2 μM |
模板DNA |
X |
X |
- |
無菌超純水 |
to 50 |
to 20 |
- |
【注】: 使用前務(wù)必充分混勻,避免劇烈震蕩產(chǎn)生過多氣泡。
a) 引物濃度:通常引物終濃度為0.2 μM,也可以根據(jù)情況在0.1-1.0 μM之間進(jìn)行調(diào)整。
b) 模板濃度:如模板類型為未稀釋cDNA原液,使用體積不應(yīng)超過qPCR反應(yīng)總體積的1/10。
c) 模板稀釋:cDNA原液建議5-10倍稀釋,最佳模板加入量以擴(kuò)增得到的CT值在20-30個(gè)循環(huán)為好。
d) 反應(yīng)體系:推薦使用20 μl或50 μl,以保證目的基因擴(kuò)增的有效性和重復(fù)性。
e) 體系配制:請(qǐng)于超凈工作臺(tái)內(nèi)配制,并使用無核酸酶殘留的槍頭、反應(yīng)管;推薦使用帶濾芯的槍頭。避免交叉污染和氣溶膠污染。
擴(kuò)增程序(兩步法) 擴(kuò)增程序(三步法)
循環(huán)步驟 |
溫度 |
時(shí)間 |
循環(huán)數(shù) |
循環(huán)步驟 |
溫度 |
時(shí)間 |
循環(huán)數(shù) |
|
預(yù)變性 |
95℃ |
30 sec |
1 |
預(yù)變性 |
95℃ |
30 sec |
1 |
|
變性 |
95℃ |
10 sec |
40 |
變性 |
95℃ |
10 sec |
40 |
|
退火/延伸 |
60℃ |
30 sec★ |
退火 |
55-60℃ |
20 sec |
|||
延伸 |
72℃ |
20 sec★ |
||||||
熔解曲線階段 |
儀器默認(rèn)設(shè)置 |
1 |
熔解曲線階段 |
儀器默認(rèn)設(shè)置 |
1 |
【注】高特異性可選擇兩步法,高效率擴(kuò)增可選擇三步法。
a) 預(yù)變性時(shí)間:本反應(yīng)條件適合大多數(shù)基因擴(kuò)增,如果遇到含有復(fù)雜結(jié)構(gòu)的基因可適當(dāng)增加預(yù)變性時(shí)間至3-5min。
b) 退火溫度和時(shí)間:請(qǐng)根據(jù)引物和目的基因的長度進(jìn)行調(diào)整。
c) 熒光信號(hào)采集(★):請(qǐng)按照儀器使用說明書要求進(jìn)行實(shí)驗(yàn)程序設(shè)置,幾種常見儀器的時(shí)間設(shè)定如下:
30sec以上:Applied Biosystems: StepOne, StepOne Plus, 7500 Fast;Roche Applied Science: LightCycler 480;Bio-Rad: CFX96
31sec以上:Applied Biosystems: 7300
34sec以上:Applied Biosystems: 7500
d) 熔解曲線:通常情況下可以使用儀器默認(rèn)程序。
結(jié)果分析
定量實(shí)驗(yàn)至少需要三個(gè)生物學(xué)重復(fù)。反應(yīng)結(jié)束后需要確認(rèn)擴(kuò)增曲線及熔解曲線。
1) 擴(kuò)增曲線:標(biāo)準(zhǔn)擴(kuò)增曲線為S型。
Ct值落在20-30之間時(shí),定量分析最準(zhǔn)確;
Ct值小于10,需要將稀釋模板后,重新進(jìn)行實(shí)驗(yàn);
Ct值介于30-35之間時(shí),需要提高模板濃度,或者增大反應(yīng)體系的體積,以提高擴(kuò)增效率,保證結(jié)果分析的準(zhǔn)確性;
Ct值大于35時(shí),檢測(cè)結(jié)果無法定量分析基因的表達(dá)量,但可用于定性分析。
2) 熔解曲線:
熔解曲線單峰,表明反應(yīng)特異性好可以進(jìn)行定量結(jié)果分析;若熔解曲線出現(xiàn)雙峰或者多峰,則不能進(jìn)行定量分析。
熔解曲線出現(xiàn)雙峰,需要通過DNA瓊脂糖凝膠電泳判斷非目標(biāo)峰是引物二聚體還是非特異性擴(kuò)增。
如果是引物二聚體,建議降低引物濃度,或者重新設(shè)計(jì)擴(kuò)增效率高的引物。
如果是非特異性擴(kuò)增,請(qǐng)?zhí)岣咄嘶饻囟?,或者重新設(shè)計(jì)更高特異性的引物。
引物設(shè)計(jì)指南
1)推薦引物長度25 bp左右。擴(kuò)增產(chǎn)物長度150 bp為佳,可以在100 bp-300 bp內(nèi)選擇。
2)正向引物和反向引物的Tm值相差不宜超過2℃。引物Tm值60℃-65℃為佳。
3)引物堿基分布要均勻,避免出現(xiàn)連續(xù)的4個(gè)相同堿基,GC含量控制在50%左右。3’端最后一個(gè)堿基最好為G或C。
4)引物內(nèi)部或者正反兩條引物間最好避免出現(xiàn)有3個(gè)堿基以上的互補(bǔ)序列。
5)引物特異性需要用NCBI BLAST程序進(jìn)行核對(duì)。避免引物3’端有2個(gè)堿基以上的非特異性互補(bǔ)。
6)設(shè)計(jì)完成的引物需要進(jìn)行擴(kuò)增效率的檢測(cè),只有具備相同擴(kuò)增效率的引物才可用于定量比較分析。
相關(guān)產(chǎn)品
產(chǎn)品名稱 |
貨號(hào) |
規(guī)格 |
Hifair® II 1st Strand cDNA Synthesis Kit(gDNA digester plus) |
11121ES60 |
100 T |
Hifair® II 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR(gDNA digester plus) |
11123ES60 |
100 T |
11201ES08 |
5 mL |
|
11202ES08 |
5 mL |
|
11203ES08 |
5 mL |
|
11195ES08 |
5 mL |
|
11196ES08 |
5 mL |
|
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix(抗體法,High Rox) |
11197ES08 |
5 mL |
11198ES08 |
5 mL |
|
11199ES08 |
5 mL |
|
11200ES08 |
5 mL |
HB210824