01 PCR產物的純化是獲得高質量模板的核心
Sanger測序是一個高度精確的技術,可以逐個堿基讀出 DNA 序列,對模板的純凈度有著極高的要求。然而,PCR產物中的游離引物和核苷酸往往會干擾測序結果。如何在不損耗珍貴樣本的前提下,獲取干凈、高質量的模板,是一個急需解決的難題。
圖1.Sanger測序原理
在這種情況下,PCR產物的純化成為了眾多科研工作者的首選策略。傳統的PCR純化方法,如乙醇醋酸鈉純化、磁珠純化或柱純化,雖然有效,但往往耗時耗力,且在操作過程中容易損失樣本。對于樣本量有限的研究者來說,這無疑是一個相當棘手的問題。
翌圣生物提供的酶法PCR純化法有著非常簡單直接的工作流程,只有一個移液步驟。只需將核酸外切酶(Exonuclease I)和堿性磷酸酶加入PCR產物中,并在37℃靜置15~30 min,即可完成純化。這種方法不僅操作簡便,而且大大減少了樣本的損失,特別適合樣本量有限的研究。
02 PCR酶法純化是如何降解游離的引物和核苷酸,而不影響dsDNA目的產物
關鍵在于Exonuclease I!
Exonuclease I是一種對變性或單鏈脫氧核糖核酸具有高度選擇性的核酸外切酶,作用時,Exonuclease I從引物(單鏈聚脫氧核糖核苷酸)的3 羥基端開始攻擊,隨后逐步釋放出脫氧核糖核苷5 ' -單磷酸鹽,但末端二核苷酸會保持完整。Exonuclease I對雙鏈DNA或RNA無活性,因此不會降解目標產物dsDNA。接著,堿性磷酸酶將反應體系中的核苷酸去磷酸化,去磷酸化意味著反應體系中dNTP失去活性,從而不會影響測序反應。這是因為測序反應體系中的dNTP:ddNTP需要遵循特定比例,任何比例的偏差都可能引起不可預測的測序結果。(點擊鏈接,獲取更多Exonuclease I產品詳情)
圖2.Exonuclease I反應原理
03 PCR酶法純化會影響后續(xù)的測序嗎?
答案是:不會!
只需將反應混合物加熱至80℃并保持15 min,即可使酶失活,得到干凈的PCR擴增產物,直接用于測序反應。整個過程快速高效,無需額外的純化步驟,也不會造成樣本的損失。
翌圣PCR產物純化解決方案
產品名稱 |
產品貨號 |
規(guī)格 |
Exonuclease I(20 U/μL) |
1000 U/5000 U |
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Shrimp Alkaline Phosphatase (SAP) (1 U/µL) |
250 U |