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      Multi-CUT&Tag技術(shù)最全原理解析

      2022年,翌圣生物首次推出CUT&Tag實(shí)驗(yàn)中添加Spike in(CUT&Tag實(shí)驗(yàn)spike in的優(yōu)勢早知道),解析了CUT&Tag實(shí)驗(yàn)中的pA/G-Tn5的原理(CUT&Tag實(shí)驗(yàn)中,Protein A/G的巧妙選擇),并推出了CUT&Tag進(jìn)階手冊(跟著寶典走,三天成高手,《CUT&Tag進(jìn)階手冊》限量贈(zèng)送),全流程解析CUT&Tag實(shí)驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)技巧及實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng)和分析流程。
      2023年,翌圣生物全球首發(fā)Multi-CUT&Tag試劑盒(CUT&Tag2for1照進(jìn)現(xiàn)實(shí),Multi-CUT&Tag試劑盒全球首發(fā)),產(chǎn)學(xué)研合作,使得同一份細(xì)胞實(shí)現(xiàn)雙靶標(biāo)的研究。
      隨著Multi-CUT&Tag試劑盒的推出,越來越多科研工作者咨詢Multi-CUT&Tag的一些相關(guān)問題,今天,我們來對Multi-CUT&Tag技術(shù)原理進(jìn)行最全解析。

       

      Multi-CUT&Tag實(shí)驗(yàn)流程及原理
       
       
      實(shí)驗(yàn)原理:利用ConA磁珠捕獲細(xì)胞并利用5% Digitonin對細(xì)胞膜進(jìn)行穿孔,選擇鼠源一抗和兔源一抗實(shí)現(xiàn)同一細(xì)胞雙靶標(biāo)研究,之后,鼠源一抗結(jié)合Anti-mouse Tn5、兔源一抗結(jié)合Anti-rabbit Tn5從而定向切割不同靶標(biāo)靶向的目標(biāo)蛋白結(jié)合DNA序列,再經(jīng)過PCR完成二代測序文庫的構(gòu)建。對文庫進(jìn)行測序后的數(shù)據(jù)進(jìn)行barcode拆分,即可獲得雙靶標(biāo)的高分辨率靶蛋白結(jié)合的染色質(zhì)圖譜。

      圖:Multi-CUT&Tag實(shí)驗(yàn)流程

      Multi-CUT&Tag試劑盒組分原理
       
      Multi-CUT&Tag試劑盒為即用型試劑盒,試劑盒中含有Box I和Box II,存放溫度不一致。試劑盒中,包含Digitonin和純化磁珠,客戶準(zhǔn)備好樣品、磁力架、PCR儀、渦旋儀以及所需實(shí)驗(yàn)的鼠抗和兔抗,搭配固定貨號接頭,即可完成實(shí)驗(yàn)。

      Multi-CUT&Tag技術(shù)高分文章應(yīng)用
       

      Multi-CUT&Tag技術(shù)在鼠腦中的研究應(yīng)用

      2022年12月,Gonçalo Castelo-Branco課題組在Nature Biotechnology上發(fā)表的Multimodal chromatin profiling using nanobody-based single-cell CUT&Tag上推出了使用納米抗體-Tn5融合蛋白的nano-CUT&Tag(nano-CT),通過Anti-mouse Tn5和Anti-Rabbit Tn5,在鼠腦中實(shí)現(xiàn)特異性針對鼠抗和兔抗的Multi-CUT&Tag技術(shù)應(yīng)用,非常詳細(xì)地解剖大腦中的祖細(xì)胞如何特化成少突膠質(zhì)細(xì)胞,這些新的機(jī)制見解可以為我們在疾病背景下如何刺激少突膠質(zhì)細(xì)胞群的恢復(fù)提供線索。

      圖:nano-CUT&Tag (nano-CT)在單細(xì)胞技術(shù)中的應(yīng)用
      nano-CUT&Tag能減少實(shí)驗(yàn)流程,并且在單細(xì)胞水平背景更低,同時(shí)分群結(jié)果更明顯。

       

      Multi-CUT&Tag技術(shù)在不同免疫細(xì)胞中的研究應(yīng)用

      2022年12月,美國紐約基因組中心Ivan Raimondi團(tuán)隊(duì)Nature Biotechnology上發(fā)表的Nanobody-tethered transposition enables multifactorial chromatin profiling at single-cell resolution上推出NTT-seq,在不同細(xì)胞中使用納米抗體偶聯(lián)的Tn5酶實(shí)現(xiàn)了同一份細(xì)胞多個(gè)靶標(biāo)的研究,同時(shí)該研究在PBMCs和BMMCs中進(jìn)行單細(xì)胞多靶標(biāo)CUT&Tag研究時(shí),也能獲得非常優(yōu)秀的高分辨率的多模態(tài)圖。同時(shí),研究人員還擴(kuò)展了NTT-seq,使細(xì)胞表面蛋白表達(dá)和多模態(tài)染色質(zhì)狀態(tài)的分析同時(shí)進(jìn)行,可用于研究免疫系統(tǒng)的細(xì)胞。

      圖:NTT-seq在不同細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)bulk多靶標(biāo)的染色質(zhì)圖譜

       

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      Hieff NGS® Multi-CUT&Tag Library Prep Kit for Illumina®

      12592ES12/48

      12T/48T

      Hieff NGS® DNA Spike in Mix for CUT&Tag

      12596ES48

      48T

      Hieff NGS® G-Type In-Situ DNA Binding Profiling Library Prep Kit for Illumina® CUT&Tag建庫試劑盒

      12598ES12/48

      12T/48T

       

      新品嘗鮮

      參考文獻(xiàn):

      [1] B. M, CB G. Multimodal chromatin profiling using nanobody-based single-cell CUT&Tag [published online ahead of print, 2022 Dec 19]. Nat Biotechnol. 2022;10.1038/s41587-022-01535-4. doi:10.1038/s41587-022-01535-4[IF:68.164]

      [2] Stuart T, Hao S, Zhang B, et al. Nanobody-tethered transposition enables multifactorial chromatin profiling at single-cell resolution [published online ahead of print, 2022 Dec 19]. Nat Biotechnol.

      400-6111-883