分子克隆,一個大家做實驗必經的實驗流程。我們可以通過分子克隆將所需的目的基因連接到載體上,最后導入表達系統(tǒng)中進行表達。分子克隆包含:目的基因擴增、載體線性化、連接以及轉化篩選。說到載體線性化,除了PCR線性化載體,大多數小伙伴會選擇酶切進行載體線性化。對于一些單酶切位點的線性化載體,我們常常需要堿性磷酸酶進行載體去磷酸化。
堿性磷酸酶,可以將DNA、RNA的5’端磷酸基團去除,常用于阻止載體的自連作用,也可用于酶法化學發(fā)光。在分子克隆實驗中,DNA連接酶催化DNA連接時需要有磷酸基團的存在,載體在經酶切后會在切點端保留一個磷酸基團。而載體經堿性磷酸酶去磷酸化后因5’端無磷酸基團,因而不可以和自身3’-端連接。因此連接反應中載體本身會優(yōu)先發(fā)生的連接反應被阻止,提高了目的片段插入率。在我們使用完堿性磷酸酶之后,載體的5’端磷酸基團被去掉,載體自身在普通的連接酶作用下不能進行連接;但載體和片段之間形成3´,5´-磷酸二酯鍵,連接雙鏈其中的一條,另一條鏈則靠大腸桿菌自身的修復系統(tǒng)進行連接。
小牛腸堿性磷酸酶(CIAP)和蝦堿性磷酸酶(SAP)都可以去除載體或片段的5’-末端磷酸基團,但失活方法不同。
小牛腸堿性磷酸酶,在底物濃度高時,CIAP的最適pH約為10;底物濃度低時,最適pH約為8,但特異性比高底物濃度時低。同時,其在保存條件下極其穩(wěn)定,但在螯合劑存在條件下,經65℃、30分鐘加熱處理99%的活性不可逆失活。失活處理時,建議試用苯酚,從而使酶完全失活。
蝦堿性磷酸酶,可以在65℃ 加熱 5 分鐘的條件下不可逆失活。同時,在進行去磷酸化反應之后,不需要純化產物,可直接用于后續(xù)的連接反應。蝦堿性磷酸酶也可以用來降解PCR反應中的游離dNTP,用于制備測序模板和 SNP 分析。同樣無需純化,可直接用于下游實驗。
載體線性化后,去磷酸化檢測:在我們對線性化的載體使用了堿性磷酸酶進行去磷酸化之后,可以直接將酶切后的載體加上T4 DNA連接酶進行酶連,然后進行轉化涂平板并計算菌落數。將酶切后的載體直接進行轉化涂平板并計算菌落數。比較沒有經過酶連以及經過酶連的兩個平板的菌落差異。若兩次實驗的差異不大那么就證明去磷酸化效率高。
除了兩種堿性磷酸酶,翌圣生物還有更多的克隆及克隆篩選相關試劑供您選擇。
名稱 |
貨號 |
應用場景 |
10911ES |
單片段快速克隆、定向克隆 |
|
10922ES |
單/多片段快速克隆、定向克隆 |
|
10907ES |
基因測序、復制與保存 |
|
10102ES |
TA克隆、菌落PCR、基因型鑒定 |
|
10157ES |
各種目的基因快速擴增,同時可用于菌液、酵母簡單裂解后直擴 |
|
10904ES |
轉基因植株鑒定 |
|
10901ES |
β-半乳糖苷酶的原位染色檢測以及藍白斑篩選 |
|
10902ES |
常用于藍白斑篩選及IPTG誘導的細菌內的蛋白表達 |
|
10903ES |
在培養(yǎng)基上直接檢測GAL4系統(tǒng)的酵母雙雜交作用 |
點擊產品名稱查看詳情