CRISPR/Cas9是一種由RNA指導(dǎo)Cas核酸酶對靶向基因進(jìn)行特定DNA修飾的技術(shù),源于細(xì)菌和古細(xì)菌為應(yīng)對噬菌體和外源質(zhì)粒的攻擊而演化來的一種獲得性免疫防御機(jī)制。在現(xiàn)代生物技術(shù)研究中,此系統(tǒng)是通過人工優(yōu)化的具有引導(dǎo)作用的sgRNA(Single Guide RNA)引導(dǎo)核酸酶Cas9蛋白在與sgRNA配對的靶位點(diǎn)處剪切雙鏈DNA,從而引起DNA斷裂。由于生物體內(nèi)非同源末端修復(fù)機(jī)制或同源重組機(jī)制修復(fù)DNA,導(dǎo)致基因移碼突變、替換或刪除,致使基因功能喪失。
Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit采用T7 RNA聚合酶混合物高效轉(zhuǎn)錄spCas9 sgRNA。本試劑盒含有能被Cas9蛋白識別并起支架作用的特異性序列,該序列的一部分能與使用者設(shè)計(jì)的目標(biāo)特異序列部分重疊。退火形成互補(bǔ)鏈后由DNA聚合酶進(jìn)行填充。最終生成用于轉(zhuǎn)錄的dsDNA模板。本試劑盒利用其提供的試劑和使用者自己設(shè)計(jì)的特異性DNA序列,單管反應(yīng)可在4小時內(nèi)獲得20-100μg具有功能的sgRNA。
產(chǎn)品組分
編號 |
組分 |
產(chǎn)品編號/規(guī)格 |
||
11355ES25 (25 T) |
11355ES50 (50 T) |
11355ES60 (100 T) |
||
11355-A |
10×sgRNA Enzyme Mix |
50 μL |
100 μL |
200 μL |
11355-B |
10×sgRNA Reaction Buffer |
50 μL |
100 μL |
200 μL |
11355-C |
2×Canace Enzyme Mix |
312.5 μL |
625 μL |
1.25 mL |
11355-D |
Scaffold Template |
31.25 μL |
62.5 μL |
125 μL |
11355-E |
NTPs(25mM each) |
200 μL |
400 μL |
800 μL |
11355-F |
Control sgRNA Oligo(10μM) |
10 μL |
20 μL |
40 μL |
運(yùn)輸儲存方法
干冰運(yùn)輸。-20℃保存,有效期兩年。
注意事項(xiàng)
1. 反應(yīng)體系中須嚴(yán)格注意不要混入RNase。
2. 實(shí)驗(yàn)器材(如:槍頭、產(chǎn)品管等)注意嚴(yán)格使用 RNase Free用品。
3. 為了您的安全和健康,請穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。
4. 本產(chǎn)品僅作科研用途!
合成原理
操作流程
1. 上游引物(Target-specific sgRNA oligo)設(shè)計(jì)
A. 引物的5’端:T7啟動子序列加保護(hù)堿基(20nt:TTCTAATACGACTCACTATA)
B. 轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn):添加0~2個G,添加G的個數(shù)由靶序列的5’端決定,T7啟動子至少需要2個G才能有效轉(zhuǎn)錄。
(注:若特異靶序列已經(jīng)存在2個G,則不需要額外添加,額外的G會降低剪切效率。)
C. 特異的sgRNA靶序列(20nt):靶DNA序列PAM(NGG)的5’端20nt堿基序列。
D. 引物的3’端:Scaffold Template退火序列(14nt:GTTTTAGAGCTAGA)。
示例:
DNA模板:
上游引物(Target-specific sgRNA oligo):
2. sgRNA合成
A.sgRNA模板擴(kuò)增
①按下列體系配制反應(yīng)體系:
組分 |
體積(μL) |
終濃度 |
RNase free H2O |
Up to 25 |
- |
Scaffold Template |
1.25 |
- |
sgRNA Oligo(10μM) |
1.25 |
0.5μM |
2×Canace Enzyme Mix |
12.5 |
1× |
注: 1. Scaffold Template已預(yù)先與下游引物混合。
2. 使用試劑、容器等無RNase污染。
②PCR反應(yīng)程序:
循環(huán)步驟 |
溫度 |
時間 |
循環(huán)數(shù) |
變性 |
98℃ |
10s |
30 |
延伸 |
68℃ |
10s |
|
保持 |
4℃ |
∞ |
③電泳檢測:
使用2%瓊脂糖膠,取5μL PCR反應(yīng)液電泳檢測條帶大小及亮度,用100bp DNA Ladder(貨號:10507)標(biāo)定,其大小為120bp左右單一條帶。
B.體外轉(zhuǎn)錄sgRNA
①按下列體系室溫配制反應(yīng)體系:
組分 |
體積(μL) |
終濃度 |
RNase free H2O |
Up to 20 |
- |
10×sgRNA Reaction Buffer |
2 |
1× |
NTPs (25 mM each) |
8 |
10 mM each |
sgRNA模板(上述A獲得) |
5 |
- |
10×sgRNA Enzyme Mix |
2 |
1× |
注: 1. 低溫配置可能引起DNA模板沉淀。
2. 使用試劑、容器等無RNase污染。
②反應(yīng)程序:
溫度 |
時間 |
37℃ |
4h |
4℃ |
∞ |
注:反應(yīng)于PCR儀中進(jìn)行,熱蓋打開,防止長時間導(dǎo)致反應(yīng)液蒸發(fā)。
③DNA模板消化:
反應(yīng)完成后,每管加入2μL DNaseⅠ(RNase free),37℃孵育15min以去除模板DNA。
④轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物純化:
體外轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物可選用 RNA Cleaner 磁珠進(jìn)行純化(貨號:12602),也可以采用酚/氯仿純化法(具體操作步驟可聯(lián)系Yeasen索?。?,以去除蛋白、游離的核苷酸等。
HB200916