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      Hifair? Precision sgRNA Synthesis Kit

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      產(chǎn)品說明書

      FAQ

      COA

      已發(fā)表文獻(xiàn)

      RNA純化方案

       

      CRISPR/Cas9是一種由RNA指導(dǎo)Cas核酸酶對靶向基因進(jìn)行特定DNA修飾的技術(shù),源于細(xì)菌和古細(xì)菌為應(yīng)對噬菌體和外源質(zhì)粒的攻擊而演化來的一種獲得性免疫防御機(jī)制。在現(xiàn)代生物技術(shù)研究中,此系統(tǒng)是通過人工優(yōu)化的具有引導(dǎo)作用的sgRNA(Single Guide RNA)引導(dǎo)核酸酶Cas9蛋白在與sgRNA配對的靶位點(diǎn)處剪切雙鏈DNA,從而引起DNA斷裂。由于生物體內(nèi)非同源末端修復(fù)機(jī)制或同源重組機(jī)制修復(fù)DNA,導(dǎo)致基因移碼突變、替換或刪除,致使基因功能喪失。

      Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit采用T7 RNA聚合酶混合物高效轉(zhuǎn)錄spCas9 sgRNA。本試劑盒含有能被Cas9蛋白識別并起支架作用的特異性序列,該序列的一部分能與使用者設(shè)計(jì)的目標(biāo)特異序列部分重疊。退火形成互補(bǔ)鏈后由DNA聚合酶進(jìn)行填充。最終生成用于轉(zhuǎn)錄的dsDNA模板。本試劑盒利用其提供的試劑和使用者自己設(shè)計(jì)的特異性DNA序列,單管反應(yīng)可在4小時內(nèi)獲得20-100μg具有功能的sgRNA。


      產(chǎn)品組分

       

      編號

      組分

      產(chǎn)品編號/規(guī)格

      11355ES25

      (25 T)

      11355ES50

      (50 T)

      11355ES60

      (100 T)

      11355-A

      10×sgRNA Enzyme Mix

      50 μL

      100 μL

      200 μL

      11355-B

      10×sgRNA Reaction Buffer

      50 μL

      100 μL

      200 μL

      11355-C

      2×Canace Enzyme Mix

      312.5 μL

      625 μL

      1.25 mL

      11355-D

      Scaffold Template

      31.25 μL

      62.5 μL

      125 μL

      11355-E

      NTPs(25mM each)

      200 μL

      400 μL

      800 μL

      11355-F

      Control sgRNA Oligo(10μM)

      10 μL

      20 μL

      40 μL


      運(yùn)輸儲存方法

       

      干冰運(yùn)輸。-20℃保存,有效期兩年。


      注意事項(xiàng)

       

      1. 反應(yīng)體系中須嚴(yán)格注意不要混入RNase。

      2. 實(shí)驗(yàn)器材(如:槍頭、產(chǎn)品管等)注意嚴(yán)格使用 RNase Free用品。

      3. 為了您的安全和健康,請穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。

      4. 本產(chǎn)品僅作科研用途!

       

      合成原理

      1600753268611612.png
       


      操作流程

       

      1. 上游引物(Target-specific sgRNA oligo)設(shè)計(jì)

      A. 引物的5’端:T7啟動子序列加保護(hù)堿基(20nt:TTCTAATACGACTCACTATA)

      B. 轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn):添加0~2個G,添加G的個數(shù)由靶序列的5’端決定,T7啟動子至少需要2個G才能有效轉(zhuǎn)錄。

      (注:若特異靶序列已經(jīng)存在2個G,則不需要額外添加,額外的G會降低剪切效率。)

      C. 特異的sgRNA靶序列(20nt):靶DNA序列PAM(NGG)的5’端20nt堿基序列。

      D. 引物的3’端:Scaffold Template退火序列(14nt:GTTTTAGAGCTAGA)。

      示例: 

      DNA模板:

       圖片.png

      上游引物Target-specific sgRNA oligo):

       

      圖片.png

      2. sgRNA合成

      A.sgRNA模板擴(kuò)增

      ①按下列體系配制反應(yīng)體系:

      組分

      體積(μL)

      終濃度

      RNase free H2O

      Up to 25

      -

      Scaffold Template

      1.25

      -

      sgRNA Oligo(10μM)

      1.25

      0.5μM

      2×Canace Enzyme Mix

      12.5

      注: 1. Scaffold Template已預(yù)先與下游引物混合。

      2. 使用試劑、容器等無RNase污染。

      ②PCR反應(yīng)程序:

      循環(huán)步驟

      溫度

      時間

      循環(huán)數(shù)

      變性

      98℃

      10s

      30

      延伸

      68℃

      10s

      保持

      4℃

       

      ③電泳檢測:

      使用2%瓊脂糖膠,5μL PCR反應(yīng)液電泳檢測條帶大小及亮度,用100bp DNA Ladder(貨號:10507)標(biāo)定,其大小為120bp左右單一條帶。

      B.體外轉(zhuǎn)錄sgRNA

      ①按下列體系室溫配制反應(yīng)體系:

      組分

      體積(μL)

      終濃度

      RNase free H2O

      Up to 20

      -

      10×sgRNA Reaction Buffer

      2

      NTPs (25 mM each)

      8

      10 mM each

      sgRNA模板(上述A獲得)

      5

      -

      10×sgRNA Enzyme Mix

      2

      注: 1. 低溫配置可能引起DNA模板沉淀。

      2. 使用試劑、容器等無RNase污染。

      ②反應(yīng)程序:

      溫度

      時間

      37℃

      4h

      4℃

      注:反應(yīng)于PCR儀中進(jìn)行,熱蓋打開,防止長時間導(dǎo)致反應(yīng)液蒸發(fā)。

      DNA模板消化:

      反應(yīng)完成后,每管加入2μL DNaseⅠ(RNase free),37℃孵育15min以去除模板DNA。

      ④轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物純化:

      體外轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物可選用 RNA Cleaner 磁珠進(jìn)行純化(貨號:12602),也可以采用酚/氯仿純化法(具體操作步驟可聯(lián)系Yeasen索?。?,以去除蛋白、游離的核苷酸等。

      HB200916

      400-6111-883