酶切點(diǎn)位
5'-AT↓CGAT-3'
3'-TAGC↑TA-5
產(chǎn)品描述
FuniCut™系列內(nèi)切酶是通過基因工程重組技術(shù),可在5~15 min內(nèi)精確完成DNA切割的快速限制性內(nèi)切酶,適用于快速切割質(zhì)粒DNA、PCR產(chǎn)物、基因組DNA等。FuniCut™系列快速內(nèi)切酶共用一種酶切緩沖液,從而簡化了酶切反應(yīng)體系,另外,有良好的酶活冗余度,可輕松處理底物過量或困難模板的酶切。
產(chǎn)品組分
組分編號 |
組分名稱 |
產(chǎn)品規(guī)格 |
15007-A |
FuniCut™ ClaI |
50 μL |
15007-B |
10×FuniCut™ Buffer |
1 mL |
15007-C |
10×FuniCut™ Color Buffer |
1 mL |
運(yùn)輸與保存方法
冰袋運(yùn)輸。-20°C保存,有效期2年。
識別位置
5'-AT↓CGAT-3'
3'-TAGC↑TA-5'
推薦反應(yīng)條件
1× FuniCut™ 緩沖液;
最適37°C孵育。
失活條件
80°C孵育20 min。
注意事項(xiàng)
1)3 h孵育未表現(xiàn)星號活性,延時(shí)酶切可能出現(xiàn)星號活性;
2)受Dam甲基化影響,序列可能重疊,剪切阻斷;
3)受CpG甲基化影響,序列完全重疊,剪切阻斷;
4)受EcoBI甲基化影響,序列可能重疊,剪切可能受影響;
5)為了您的安全和健康,請穿實(shí)驗(yàn)服并佩戴一次性手套操作;
6)本產(chǎn)品僅作科研用途!
質(zhì)量控制
1. 功能活性檢測:最適反應(yīng)溫度下,在20 μL反應(yīng)體系中,1 μL酶能夠在15 min內(nèi)完全消化1 μg λDNA (Dam-)。
2. 超長時(shí)間孵育檢測:最適反應(yīng)溫度下,將1 μL酶與1 μg λDNA (Dam-)共孵育3 h,未檢測到其他核酸酶污染或星號活性引起的底物非特異性降解,但延長孵育時(shí)間可能出現(xiàn)星號活性。
3. 酶切-連接-再酶切檢測:最適反應(yīng)溫度下,使用1 μL酶消化底物,回收酶切產(chǎn)物,在22°C下使用適量T4 DNA連接酶可以將酶切產(chǎn)物重新連接,將連接產(chǎn)物再次回收后,使用相同的內(nèi)切酶可以重新切開連接產(chǎn)物。
4. 非特異性內(nèi)切酶活性檢測:最適反應(yīng)溫度下,將1 μL酶與1 μg超螺旋質(zhì)粒DNA共同孵育4 h后,使用瓊脂糖凝膠電泳檢測,質(zhì)粒DNA仍然處于超螺旋狀態(tài)。
5. 藍(lán)白斑檢測:將含有單一lacZα基因的載體以1 μL酶消化,重新連接后轉(zhuǎn)化入大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞,涂布在含有對應(yīng)抗生素、IPTG和X-gal的LB培養(yǎng)基平板上。連接正確的產(chǎn)物會生長出藍(lán)色菌落,而連接錯誤(即DNA末端切口不完整)的產(chǎn)物將得到白色菌落。對于FuniCut™系列限制酶而言,白色菌落比例應(yīng)小于1%。
使用方法
1. DNA快速酶切流程
1)按如下建議的加樣順序配制體系反應(yīng)液(冰上操作):
組分 |
質(zhì)粒DNA |
PCR產(chǎn)物 |
基因組DNA |
ddH2O |
15 μL |
16 μL |
30 μL |
10×FuniCut™ Buffer或10×FuniCut™ Color Buffer |
2 μL |
3 μL* |
5 μL |
底物DNA |
2 μL(~1 μg) |
10 μL (~0.2 μg) |
10 μL (5 μg) |
FuniCut™ ClaI |
1 μL |
1 μL |
5 μL |
Total |
20 μL |
30 μL |
50 μL |
*本體系指已純化后的PCR產(chǎn)物。未純化的PCR產(chǎn)物具備一定的離子強(qiáng)度,10×FuniCut TM Buffer加入量可適當(dāng)減少至2 μL。若下一步進(jìn)行克隆等實(shí)驗(yàn),酶切前需純化PCR產(chǎn)物。
2)輕柔吸打或輕彈管壁以混勻(切勿渦旋),然后瞬時(shí)離心以收集掛壁液滴。
3)37°C孵育15 min(質(zhì)粒),或15~30 min(PCR 產(chǎn)物),或30~60 min(基因組 DNA)。
4)80°C孵育20 min即可使酶失活,停止反應(yīng)(可選)。
2. 雙酶切或多酶切
1)每種內(nèi)切酶的用量為1 μL,并根據(jù)需要適當(dāng)擴(kuò)大反應(yīng)體系。
2)所有內(nèi)切酶的體積總和不得超過總反應(yīng)體系的1/10。
3)如果選用的幾種內(nèi)切酶的最適反應(yīng)溫度不同,應(yīng)先以最適溫度低的酶開始酶切,再添加最適溫度較高的酶,以較高的溫度進(jìn)行孵育。
3.質(zhì)粒的擴(kuò)大反應(yīng)體系
組分 |
體積(20 μL) |
體積(20 μL) |
體積(50 μL) |
DNA |
1 μg |
2 μg |
5 μg |
FuniCut™ ClaI |
1 μL |
2 μL |
5 μL |
10×FuniCut™ Buffer或10×FuniCut™ Color Buffer |
2 μL |
2 μL |
5 μL |
Total |
20 μL |
20 μL |
50 μL |
【注】:如果總反應(yīng)體系大于20 μL,可使用水浴、金屬浴或沙浴,并增加孵育時(shí)間。
不同DNA中的識別位點(diǎn)數(shù)
λDNA |
ΦX174 |
pBR322 |
pUC57 |
pUC18/19 |
SV40 |
M13mp18/19 |
Adeno2 |
15 |
0 |
1 |
0 |
0 |
0 |
2 |
2 |
甲基化修飾影響
Dam |
Dcm |
CpG |
EcoKI |
EcoBI |
序列可能重疊 剪切阻斷 |
無影響 |
序列完全重疊 剪切阻斷 |
無影響 |
序列可能重疊 剪切可能受影響 |
不同反應(yīng)緩沖液中的活性
反應(yīng)緩沖液 |
FuniCut™ Buffer |
Thermo Scientific FastDigest Buffer |
NEB CutSmart® Buffer |
Takara QuickCut™ Buffer |
活性 |
100% |
100% |
100% |
100% |
【注】:活性數(shù)據(jù)來自翌圣生物限制酶標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系下的檢測。
同裂酶
BspDI,BanIII,Bsa29I,BseCI,BshVI,BsiXI,Bsp106I,BspXI,Bsu15I,BsuTUI,ZhoI
【注】:同裂酶對于不同的甲基化修飾可能具有不同敏感性。
keywords: ClaI、Cla I、Cla i、Cla1、Cla 1、ClaⅠ、Cla Ⅰ、Cla
相關(guān)產(chǎn)品
產(chǎn)品名稱 |
貨號 |
規(guī)格 |
11801ES80 |
10×100 μL |
|
11802ES80 |
10×100 μL |
|
10148ES60 |
100 U |
|
10149ES03 |
1 mL |
|
10912ES10 |
10 T |
|
11003ES10 |
10 T |
HB211123