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      首頁(yè) / 腫瘤早篩/伴隨診斷 / 產(chǎn)品應(yīng)用詳情

      解決方案 | 腫瘤診治新篇章:翌圣NGS技術(shù)助力精準(zhǔn)醫(yī)療

       
       

      腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療

       
       
       

      中國(guó)的癌癥發(fā)病率和死亡率一直在上升,自2010年以來(lái),癌癥成為主要的死亡原因,也是中國(guó)的一個(gè)主要公共衛(wèi)生問(wèn)題,每年惡性腫瘤所致的醫(yī)療花費(fèi)超過(guò)2200億。隨著越來(lái)越多的腫瘤早篩、伴隨診斷產(chǎn)品被NMPA批準(zhǔn),更多的省份將腫瘤分子診斷技術(shù)納入醫(yī)保,更多的腫瘤患者將得益于分子診斷技術(shù)的輔助治療,未來(lái)腫瘤患者生存率將與發(fā)達(dá)國(guó)家不斷縮小。

       

       

       

      PART1

      腫瘤伴隨診斷NGS解決方案

       

      翌圣DNA文庫(kù)制備產(chǎn)品方案

      機(jī)械法 DNA 建庫(kù)試劑盒

       

      Hieff NGS® DNA Library Prep Kit(Cat#13577)

       

       

      優(yōu)異的捕獲數(shù)據(jù)質(zhì)量

       
       

      不同樣本不同品牌建庫(kù)產(chǎn)量及下機(jī)數(shù)據(jù)對(duì)比測(cè)試

       

      分別利用cfDNA、NA12878人類(lèi)基因組 DNA 標(biāo)準(zhǔn)品、FFPE DNA為模板,其中cfDNA、NA12878樣本投入量為30 ng,F(xiàn)FPE DNA投入量為50 ng,13577與競(jìng)品試劑在3種樣本上建庫(kù),捕獲panel為何因Cancer SLC Panel,結(jié)果顯示:13577產(chǎn)量最優(yōu),下機(jī)數(shù)據(jù)捕獲率、平均捕獲深度和supplier I品牌相當(dāng),且與3家競(jìng)品試劑相比,13577 Dup值最低。

       

       

      機(jī)械法 DNA 建庫(kù)試劑盒搭配 FFPE 修復(fù)試劑

       

      Hieff NGS® FFPE DNA Repair Reagent(Cat#12606)

       

       

      修復(fù)試劑 12606 搭配 13577 建庫(kù)試劑盒文庫(kù)產(chǎn)量測(cè)試數(shù)據(jù)

       
       

      選擇7種不同類(lèi)型的FFPE樣本,每個(gè)樣本實(shí)驗(yàn)分成兩組,分別為末修環(huán)節(jié)不添加FFPE修復(fù)試劑和添加FFPE修復(fù)試劑,模板投入量為50 ng,PCR循環(huán)數(shù)為8,構(gòu)建好文庫(kù)后直接進(jìn)行上機(jī)測(cè)序。

       

       

      加修復(fù)試劑能提高不同質(zhì)量FFPE樣本的建庫(kù)產(chǎn)量

       
       

      加修復(fù)試劑對(duì)文庫(kù)產(chǎn)量的影響

       

      加FFPE修復(fù)試劑的文庫(kù)產(chǎn)量更高,文庫(kù)產(chǎn)量提升大約在10-200%。

       

       

      酶切法建庫(kù)試劑盒

       

      Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3(Cat#12194)

       

       

      極低的假陽(yáng)性率

       
       

      NGS建庫(kù)引入的假陽(yáng)性問(wèn)題主要包括嵌合序列和堿基錯(cuò)摻等因素,在酶切法片段化時(shí)將會(huì)引入一些假的嵌合序列,12194對(duì)片段化酶全面升級(jí),解決了酶切假陽(yáng)性的痛點(diǎn)。

       

      用12194酶法片段化建庫(kù)試劑盒對(duì)3種標(biāo)準(zhǔn)品樣本(FFPE標(biāo)準(zhǔn)品、gDNA標(biāo)準(zhǔn)品、ctDNA標(biāo)準(zhǔn)品)建庫(kù),并和競(jìng)品W進(jìn)行了頭對(duì)頭的比較。數(shù)據(jù)顯示,無(wú)論是FFPE樣本、gDNA、還是ctDNA,12194的Soft Clip、false chimeric都低于或近似于競(jìng)品W。

       

       

      多重?cái)U(kuò)增靶向測(cè)序以超多重PCR為基礎(chǔ),通過(guò)對(duì)目標(biāo)基因組區(qū)域進(jìn)行引物設(shè)計(jì)及PCR擴(kuò)增,富集靶向區(qū)域。

       

       

      多重?cái)U(kuò)增靶向測(cè)序

       

      多重?cái)U(kuò)增靶向測(cè)序以超多重PCR為基礎(chǔ),通過(guò)對(duì)目標(biāo)基因組區(qū)域進(jìn)行引物設(shè)計(jì)及PCR擴(kuò)增,富集靶向區(qū)域。

       

      2×Hieff® C2P4 Blood Direct Multiplex PCR Master Mix(Cat#13606)

       

       

      良好的均一性

       
       

      不同投入量的FFPE樣本進(jìn)行多重PCR建庫(kù),分別用兩個(gè)擴(kuò)增子引物池進(jìn)行一輪擴(kuò)增,202對(duì)引物和530對(duì)引物,插入片段在200-300 bp,在相同的擴(kuò)增循環(huán)數(shù)和測(cè)序數(shù)據(jù)量,13606相較于競(jìng)品A有更好的均一性。

       

       

       

      腫瘤轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

      FFPE 樣本的 rRNA 去除

       

      Hieff NGS® MaxUp Human rRNA Depletion Kit (rRNA & ITS/ETS)(Cat#12257)

       

       

      不同樣本rRNA去除效率高,rRNA殘留率低

       
       

      分別以1μg 人、小鼠、大鼠總RNA為樣本,Hieff NGS® MaxUp Human rRNA Depletion Kit (rRNA & ITS/ETS)(12257ES24/96)去除試劑盒去除rRNA后建庫(kù),測(cè)序獲得rRNA殘留數(shù)據(jù)。

       

       

       

      人珠蛋白去除

       

      Globin mRNA Depletion Probe (Human)(Cat#12806)

       

       

      良好的Globin去除性能

       
       

      人血液RNA樣本為模板,以不同的投入進(jìn)行珠蛋白基因的去除,去除后Globin的占比幾乎為零。

       

       

       

      FFPE 樣本 RNA 建庫(kù)

       

      Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit(Cat#12308)

       

       

      數(shù)據(jù)產(chǎn)出高,文庫(kù)均一性較好

       
       

      不同質(zhì)量FFPE樣本與競(jìng)品公司的相似度(上排)與均一性(下排)對(duì)比

       

      不同質(zhì)量的FFPE樣本的RNA文庫(kù)測(cè)序得到的結(jié)果進(jìn)行文庫(kù)分析,與競(jìng)品公司的文庫(kù)測(cè)序結(jié)果相似性高,數(shù)據(jù)的均一性更好。

       
       

       

      PART2

      腫瘤早篩NGS解決方案

       

      DNA甲基化轉(zhuǎn)化

      甲基化轉(zhuǎn)化

       

      Hieff® Superfast DNA Methylation Bisulfite Kit(Cat#12225)

       

       

      產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)

       
       

      轉(zhuǎn)化率高:DNA樣品中未甲基化胞嘧啶轉(zhuǎn)化為尿嘧啶的轉(zhuǎn)化率高達(dá)99.5%以上;

      完整度好,回收率高:DNA降解程度低,轉(zhuǎn)化后樣本完整度好,DNA樣品的回收率高達(dá)55%以上。

       

       

      human gDNA不同投入量進(jìn)行亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化,樣本中參入1%λDNA和0.5% PUC19DNA,12225ES的轉(zhuǎn)化率>99.5%,DNA的回收率>55%。

       
       

       

      酶法甲基化轉(zhuǎn)化原料

       

      TET/T4-BGT/APOBEC

       

      為解決亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化的痛點(diǎn),翌圣生物基于自主生物專利技術(shù),使用定向進(jìn)化技術(shù)獲得了高活性的TET/T4-BGT/APOBEC,這三種酶可應(yīng)用于EM-seq酶法轉(zhuǎn)化。

       

      cfDNA 以10 ng和200 ng的樣本起始量并參入1% λDNA和0.5%pUC19 DNA進(jìn)行甲基化轉(zhuǎn)化和甲基化建庫(kù)(Cat#12221ES),同時(shí)采用亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化作為對(duì)比(Cat#12222ES), 結(jié)果顯示:TET2/T4-BGT酶氧化效率≥99%,APOBEC酶的脫氨效率≥99%,轉(zhuǎn)化率與亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化相當(dāng),均能達(dá)到預(yù)期的效果。

       

       
       

       

      DNA 甲基化建庫(kù)

      甲基化單鏈建庫(kù)

       

      Hieff NGS® Methyl-seq ssDNA Library Prep Kit for Illumina® V2(Cat#12221)

       

       

      產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)

       
       

      投入量低:可滿足10 pg~250 ng起始量的樣本建庫(kù);

      數(shù)據(jù)質(zhì)量佳:不同樣本類(lèi)型及不同投入量條件下均表現(xiàn)出優(yōu)異的數(shù)據(jù)質(zhì)量;
      操作簡(jiǎn)便:2小時(shí)左右可以完成建庫(kù)。

       

       

      以gDNA、cfDNA、FFPE DNA為模板,先進(jìn)行重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化,再進(jìn)行建庫(kù)。轉(zhuǎn)化試劑盒:DNA甲基化亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化試劑盒( Cat # 12222ES);和競(jìng)品對(duì)比,本試劑盒文庫(kù)產(chǎn)率要比競(jìng)品高。在測(cè)序數(shù)據(jù)方面Mapping ratio(%)比競(jìng)品略高,dup ratio(%)和競(jìng)品相當(dāng)。

       
       

       

      甲基化雙鏈建庫(kù)

       

      Hieff NGS® dsDNA Methyl Library Prep Kit for Illumina®(Cat#12214)

       

       

      產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)

       
       

      所有組分均通過(guò)質(zhì)量控制和功能驗(yàn)證,以確保文庫(kù)的穩(wěn)定產(chǎn)出;

      支持多種類(lèi)型DNA樣本,包括gDNA、cfDNA和FFPE等;

      兼容10 ng-1000 ng DNA的樣本投入量,并兼容市面主流的轉(zhuǎn)化方案。

       

      12214ES文庫(kù)產(chǎn)量、數(shù)據(jù)質(zhì)量?jī)?yōu)于競(jìng)品

       
       

      不同樣本不同投入量的文庫(kù)濃度

       
       

       

       

      產(chǎn)品訂購(gòu)

       

      樣本前處理

      產(chǎn)品應(yīng)用

      產(chǎn)品名稱

      產(chǎn)品編號(hào)

      化學(xué)轉(zhuǎn)化

      DNA Methylation Bisulfite Kit

      12222ES

      Hieff® Superfast DNA Methylation Bisulfite Kit

      12225ES

      Hieff® Mag DNA Methylation Bisulfite Kit

      12223ES

      甲基化轉(zhuǎn)化酶原料

      Recombinant Ten-Eleven Translocase 2.0(eTET2.0, with buffer)

      12212ES

      T4 Phage β-glucosyltransferase (T4-BGT) (300 U/μL)

      14552ES

      14553 Recombinant APOBEC3A (A3A) Protein

      14553ES

      Recombinant Ten-Eleven Translocase (TET)

      14554ES

       rRNA去除

      Hieff NGS® MaxUp Human rRNA Depletion Kit (rRNA & ITS/ETS)(Cat#12257)

      12257ES

      珠蛋白R(shí)NA去除

      Globin mRNA Depletion Probe(Human)

      12806ES

       

      文庫(kù)建庫(kù)

      產(chǎn)品應(yīng)用

      產(chǎn)品名稱

      產(chǎn)品編號(hào)

      機(jī)械法建庫(kù)

      Hieff NGS® DNA Library Prep Kit 全能型DNA建庫(kù)試劑盒 

      13577ES

      酶切法建庫(kù)

      Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3一步法DNA建庫(kù)試劑盒V3

      12194ES

      多重?cái)U(kuò)增建庫(kù)

      2×Hieff® C2P4 Blood Direct Multiplex PCR Master Mix

      13606ES

      RNA建庫(kù)

      Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit

      12308ES

      甲基化建庫(kù)

      Hieff NGS® Methyl-seq DNA library Prep kit for Illumina® V2

      12221ES

      Hieff NGS® dsDNA Methyl Library Prep Kit for Illumina®

      12214ES

       

       

      400-6111-883