分子診斷是以 DNA、RNA 或蛋白質(zhì)分子為診斷材料,通過檢查人體內(nèi)源基因或外源(病原體)基因的存在、缺陷或表達(dá)異常,對人體狀態(tài)或疾病作出特異性診斷的方法和過程。分子診斷技術(shù)主要是聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction簡稱PCR)、原位雜交FISH、基因芯片和基因測序技術(shù),與雜交、高通量測序技術(shù)相比,PCR技術(shù)主要優(yōu)勢在于靈敏度更高、特異性更強、操作簡單且易于推廣,在檢測基因數(shù)量上有一定的局限性,但從短期來看,PCR技術(shù)仍將是分子診斷的主流技術(shù)。
翌圣生物在酶原料領(lǐng)域深耕多年,長期為IVD企業(yè)、第三方檢驗機構(gòu)、科研機構(gòu)等提供高品質(zhì)、高性價比的分子診斷PCR原料,包括逆轉(zhuǎn)錄酶、RNase 抑制劑、Taq DNA 聚合酶、尿嘧啶糖基化酶(UDG/UNG酶)、taq酶抗體、dNTPs等單組份以及經(jīng)過體系優(yōu)化的qPCR/RT-qPCR預(yù)混液,可為臨床/非臨床診斷試劑盒開發(fā)提供性能優(yōu)越、穩(wěn)定的酶原料。
分子診斷PCR擴增工作流程及原料一覽
一、核心酶原料-Taq DNA聚合酶
隨著應(yīng)用檢測領(lǐng)域的拓展和市場需求的提升,野生型Taq DNA聚合酶已不能完全滿足需求,翌圣ZymeEditorTM酶改造平臺針對不同的應(yīng)用需求,全方位定向改造了Taq DNA 聚合酶,推出一系列適合全預(yù)混、耐抑制、超潔凈等匹配不同應(yīng)用方向的熱啟動Taq DNA 聚合酶。
- 優(yōu)越的穩(wěn)定性:配制成含引物探針的全預(yù)混液,37℃ 7天處理后,低濃度檢出無變化
圖1:以HBV核酸為模板,使用10726ES配制成qPCR全預(yù)混液,除模板外所有體系在37℃下放置7天測試加速穩(wěn)定性。結(jié)果顯示:高、中、低濃度Ct值和熒光值無顯著變化,表明以10726ES配制的預(yù)混液性能穩(wěn)定。
- 宿主gDNA殘留低:E. coli基因組DNA殘留<0.5 copies/ 100 U
圖2:E. coli基因組線性范圍:30 fg/μL-300 pg/μL,相關(guān)性R2=0.9999。(B) 三批次Hieff UCF.ME® Sensitive Taq DNA Polymerase的E. coli基因組DNA殘留<0.5 copies/ 100 U。
二、核心酶原料-逆轉(zhuǎn)錄酶
作為RT-qPCR反應(yīng)的關(guān)鍵原料之一,逆轉(zhuǎn)錄酶需要具備更快的逆轉(zhuǎn)錄速度、更高的合成產(chǎn)量以及更好的耐熱性能。為了獲得更適用于RT-qPCR的逆轉(zhuǎn)錄酶,翌圣生物在M-MLV的基礎(chǔ)上通過基因改造,開發(fā)出RNaseH活性更低,熱穩(wěn)定性更高,持續(xù)合成能力更強的Hifair®系列逆轉(zhuǎn)錄酶。
- 可耐受58℃反應(yīng)溫度,適合復(fù)雜RNA模板的逆轉(zhuǎn)錄
圖3:將Hifair® V Reverse Transcriptase及進(jìn)口品牌T*的逆轉(zhuǎn)錄酶分別在55℃及58℃下孵育30min檢測殘余酶活。結(jié)果顯示Hifair® V Reverse Transcriptase在58℃下孵育30min仍能保持70%活性,遠(yuǎn)超進(jìn)口品牌。
- 應(yīng)用于RT-qPCR檢出率優(yōu)于其他品牌,檢出范圍:1 pg-1 μg
圖4:以1 pg-1 μg(7個梯度)的293T細(xì)胞總RNA為模板,使用Hifair® V one-step RT-gDNA digestion SuperMix for qPCR(Cat#11142)、V*、T*進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,得到的cDNA進(jìn)行qPCR定量分析。結(jié)果顯示,11142ES靈敏度可達(dá)1 pg,檢出率優(yōu)于競品。
三、其他酶及酶抑制劑:RNase抑制劑、UDG酶
翌圣提供多種歷經(jīng)IVD工業(yè)應(yīng)用驗證的酶、RNase 酶抑制劑、Taq酶抗體等原料產(chǎn)品,為廣泛的體外診斷產(chǎn)品的開發(fā)和生產(chǎn)提供豐富的高品質(zhì)原料解決方案,相關(guān)酶類等產(chǎn)品在保護(hù)分子檢測目標(biāo)產(chǎn)物中廣泛應(yīng)用。
RNase 酶抑制劑:翌圣以可溶形式在大腸桿菌中表達(dá)純化的重組鼠源/豬源RNase抑制劑,能夠廣泛抑制各種類型RNase(RNase A, B, C),并且該抑制劑不會抑制聚合酶的活性,已驗證可廣泛應(yīng)用于RT-PCR/qPCR、RNA-seq、cDNA克隆和文庫構(gòu)建等多個應(yīng)用場景。除了常規(guī)RNase抑制劑,還開發(fā)了經(jīng)過UCF.ME®超低殘留工藝處理,宿主殘留更低,適合對背景菌要求更為嚴(yán)格的應(yīng)用場景的RNase抑制劑,助力解決病原檢測中的背景菌干擾,提高檢測準(zhǔn)確度。
UDG酶:尿嘧啶DNA糖基化酶(UDG酶),與dUTP搭配使用,可建立PCR防污染體系,翌圣研發(fā)的熱敏、低殘留UDG酶,可避免常規(guī)UDG酶滅活后可能存在的殘留活性在常溫下對含dU擴增產(chǎn)物的降解作用,同時防止分子酶中存在的背景菌造成PCR結(jié)果假陽性,對于準(zhǔn)確鑒別感染病原體,協(xié)助感染、傳染病的臨床診斷至關(guān)重要。
Taq酶抗體:非特異性擴增是顯著影響PCR性能的主要問題之一,熱啟動技術(shù)可以有效減少非特異擴增。抗體修飾的熱啟動酶封閉效率高,效果佳,室溫下穩(wěn)定,酶活釋放速度快,翌圣生物開發(fā)的熱啟動Taq酶雙封閉抗體不僅可以封閉Taq酶的5'→3'聚合酶活性,還能同時封閉Taq酶的5'→3'外切酶活性,雙管齊下,既能有效防止錯配或引物二聚體引起的非特異性擴增,又能防止探針或引物降解產(chǎn)生非特異信號,雙重提升試劑的穩(wěn)定性。
四、通用高性能全預(yù)混qPCR預(yù)混液
翌圣生物提供高品質(zhì)qPCR試劑,高性能的熱啟動Taq酶搭配優(yōu)化的緩沖體系,可提供包括通用型預(yù)混液,全預(yù)混預(yù)混液,基因分型預(yù)混液,可凍干預(yù)混液等,具有使用簡便、靈敏度高、穩(wěn)定性強的特點,加快您的分子診斷產(chǎn)品開發(fā)。
- 試劑通用性好:適配多類型多重引探(已驗證超40種不同類型靶標(biāo)),具有優(yōu)秀的擴增性能;
- 超強全預(yù)混穩(wěn)定性:37℃可放置14天,4℃可放置28天,反復(fù)凍融50次性能穩(wěn)定;
- 靈敏度高特異性好:靈敏度可檢測到0.25 copy/μL,特異性48孔陰性不起峰;
- 支持快速程序:兼容快速程序,30min即可出結(jié)果;
- dUP/UDG防污染體系:引入了dUTP/UDG防污染系統(tǒng),可有效防止氣溶膠污染;
- 多平臺多體系適用: Bio-Rad CFX96、ABI Q5、7500、Slan、天隆等均適配。
圖5:基于全預(yù)混試劑穩(wěn)定性考察,實驗組與對照組試劑的Ct值偏差(△Ct值)在±0.5以內(nèi),熒光值偏差在15%以內(nèi),翌圣全預(yù)混試劑具有優(yōu)秀的多重擴增穩(wěn)定性能。
對16710ES分別進(jìn)行三種方式處理(4℃、37℃以及凍融)。實驗組于4℃、37℃分別處理7天,凍融50次,與對照組(-20℃保存)在4組多重擴增體系(組1、組2及組4為4重擴增體系,組3為3重擴增體系)下進(jìn)行穩(wěn)定性測評。
五、通用高靈敏RT-qPCR預(yù)混液
一步法RT-qPCR試劑整合逆轉(zhuǎn)錄酶和熱啟動酶的優(yōu)越性能,配合優(yōu)化的緩沖體系,可實現(xiàn)個位數(shù)拷貝模板的快速靈敏檢測,經(jīng)過呼吸道疾病、動物疫病、科研體系等各類客戶市場驗證,可滿足各種應(yīng)用方向的需求。
- 通用性強:適用病原微生物、人源基因組、植物等多物種的核酸進(jìn)行qPCR擴增、檢測;
- 優(yōu)異的擴增靈敏度:精心優(yōu)化的緩沖體系,提高了低濃度模板的檢測靈敏度,可高達(dá)250 copies/mL;
- dUTP/UDG 防污染系統(tǒng):引入 dUTP/ Heat-labile UDG 防污染系統(tǒng),高效降解產(chǎn)物的氣溶膠污染,降低假陽性,確保結(jié)果真實可信;
- 支持快速程序:兼容快速程序,40 min內(nèi)完成結(jié)果檢測;
- 優(yōu)異的儲存穩(wěn)定性:37℃放置14天、反復(fù)凍融10次試劑性能穩(wěn)定。
圖6:使用翌圣RT-qPCR預(yù)混合(16630ES)和市面上同類產(chǎn)品Supplier-A,同時檢測4個病原靶標(biāo)(副流感病毒HPIV2、副流感病毒HPIV4、呼吸道合胞病毒HRVA和鼻病毒RSVA),結(jié)果顯示16630ES檢測靈敏度高于supplier-A。
產(chǎn)品推薦
產(chǎn)品類型 |
產(chǎn)品名稱 |
貨號 |
高性能PCR單酶系列 |
10726ES |
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11300ES |
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10303ES |
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10603ES |
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10125ES |
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超潔凈PCR單酶系列,超低宿主殘留 |
Hieff UCF.ME® Hotstart Sensitive Taq DNA Polymerase (5 U/μL) |
14314ES |
14608ES |
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UCF.ME® Uracil DNA Glycosylase(UDG/UNG), heat-labile, 1 U/μL |
14466ES |
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14672ES |
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可凍干PCR單酶系列 |
Hieff UNICON® HotStart E-Taq DNA Polymerase, Glycerol-free (5U/μL) |
14316ES |
11301ES |
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Uracil DNA Glycosylase(UDG),Heat-Labile(1 U/μL,Glycerol-Free) |
10707ES |
|
10703ES |
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RT-qPCR預(yù)混液 |
高靈敏快速Hifair® C203P1 Multiplex One Step RT-qPCR Probe Kit(UDG Plus) |
16630ES |
通用全預(yù)混Hifair® V Multiplex One Step RT-qPCR Probe Kit(UDG Plus) |
11899ES |
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11831ES |
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qPCR預(yù)混液 |
3代通用全預(yù)混Hieff Unicon® Universal TaqMan Pro U+ qPCR Mix(One Tube) |
16710ES |
通用高靈敏Hieff Unicon® Universal TaqMan Multiplex qPCR Master Mix(UDG plus) |
13891ES |
|
2代快速全預(yù)混Hieff Unicon® SuperproⅠTaqMan qPCR Master Mix(UDG plus) |
11827ES |
|
11853ES |
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高靈敏可凍干Hieff Unicon® Universal TaqMan Multiplex qPCR Master Mix(UDG plus) |
11893ES |