面對突發(fā)性、傳染性強(qiáng)、不明病因的疾病,需要可靠、快速手段鎖定病原。毫無疑問,mNGS將病原一網(wǎng)打盡并在24h內(nèi)出具報(bào)告,成為病原檢測的一把利劍。mNGS不需要培養(yǎng),直接對樣本核酸進(jìn)行高通量測序,能夠快速、無偏差的檢測臨床樣本中的全部病原。其檢測流程可以分為5個(gè)步驟:核酸提取、文庫構(gòu)建、上機(jī)測序、生信分析與報(bào)告解讀。
mNGS檢測流程圖
翌圣 mNGS濕實(shí)驗(yàn)完整解決方案
宏基因組建庫性能
主推產(chǎn)品:Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for Illumina®(Cat#13490)
產(chǎn)品特點(diǎn):
1)起始兼容廣:適用500pg-1μg的gDNA、全長cDNA等樣本
2)操作簡單:片段化/末修/加A一步完成,建庫時(shí)間低至3h
3)極低背景:工藝優(yōu)化,嚴(yán)苛質(zhì)檢,背景菌殘留低,特別適合病原建庫
產(chǎn)品性能:
1)建庫性能:不同批次13490試劑盒,酶切 4℃1min;30℃ 20min;72℃ 20min;4℃ Hold,結(jié)果表明,不同類型樣本,不同投入量情況下,均能建庫成功
表1、不同樣本、不同起始量樣本文庫產(chǎn)出
圖1、不同樣本、不同起始量樣本文庫大小
2)背景殘留:兩個(gè)批次13490試劑盒(C、S),小牛胸腺DNA,500 pg、1μg Input 酶切時(shí)間20min,14cycles,illumina,PE150,20M reads/樣,結(jié)果表明,兩個(gè)批次背景菌殘留菌較低,批次間穩(wěn)定建較好
圖2、兩個(gè)批次試劑500 pg、1μg Input背景菌殘留結(jié)果
產(chǎn)品詳情
分類 |
產(chǎn)品名稱 |
產(chǎn)品編號 |
規(guī)格 |
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DNA建庫 |
機(jī)械法建庫 |
12199ES08/ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T |
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13310ES16/ES96 |
16 T/96 T |
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酶切法建庫 |
Hieff NGS® OnePot Ⅱ DNA Library Prep Kit for Illumina® |
13490ES08/ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T |
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Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for MGI® |
13509ES16/ES96 |
16 T/96 T |
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酶切PCR-free建庫 |
Hieff NGS® OnePot Pro PCR-Free DNA Library Prep Kit for Illumina® |
12209ES08//ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T |
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轉(zhuǎn)座酶建庫 |
12206ES08/ES24/ES96; 12207ES08/ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T; 8 T/24 T/96 T |
宏轉(zhuǎn)錄組建庫性能
主推產(chǎn)品:Hieff NGS® Fast RNA Library Prep Kit for Illumina®(Cat#12304)
產(chǎn)品特點(diǎn):
1) 起始兼容廣:10~500 ng RNA建庫
2) 極速建庫:將傳統(tǒng)約3.5h建庫時(shí)間縮短到3 h
3) 極低背景:工藝優(yōu)化,嚴(yán)苛質(zhì)檢,背景菌殘留低,特別適合病原建庫
產(chǎn)品性能:
1)Control為12253+12252(常規(guī)RNA建庫),不同起始量293 RNA 為樣本建庫測序,結(jié)果表明,不同起始量文庫產(chǎn)出、基因表達(dá)數(shù)量檢出均正常
表2、不同起始量RNA文庫產(chǎn)出
圖3、不同起始量RNA建庫基因表達(dá)數(shù)量
2)不同起始量293 RNA ,illumina,PE150,20M reads,結(jié)果表明,大腸殘留均較低
圖4、不同起始量ENA建庫,大腸殘留檢測
產(chǎn)品詳情
分類 |
產(chǎn)品名稱 |
產(chǎn)品編號 |
規(guī)格 |
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RNA建庫 |
rRNA去除/珠蛋白去除 |
Hieff NGS® One-Step rRNA Removal Kit(Human,100-1,000 ng) |
12258ES08//ES24/ES96 12259ES08//ES24/ES96 12260ES08/ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T; 8 T/24 T/96 T; 8 T/24 T/96 T |
常規(guī)RNA建庫 |
Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit for Illumina® |
12252ES08/ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T |
|
13333ES08//ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T |
|||
極速RNA建庫 |
12304ES08/ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T |
RNA&DNA共建庫性能
主推產(chǎn)品:Hieff NGS® ds-cDNA Synthesis Kit(Cat#13488)
Hieff NGS® OnePot cDNA&gDNA Library Prep Kit(Cat#13502)
產(chǎn)品特點(diǎn):
1) 起始兼容廣:500pg-1μg RNA、DNA均能建庫成功
2) 模塊自由組合:Cat#13502可進(jìn)行DNA建庫,搭配Cat#13488可進(jìn)行DNA&RNA共建庫,模塊靈活搭配,經(jīng)濟(jì)便捷
3) 極速建庫:3h內(nèi)完成共建庫
產(chǎn)品性能:
1)建庫性能
不同起始量標(biāo)準(zhǔn)品RNA、小牛gDNA進(jìn)行建庫測序,500pg-1μg RNA、DNA均能建庫成功
表3、不同gDNA投入文庫產(chǎn)出
表4、不同RNA投入文庫產(chǎn)出
2)背景殘留
表5、不同gDNA投入背景殘留
表6、不同RNA投入背景殘留
產(chǎn)品詳情
分類 |
產(chǎn)品名稱 |
產(chǎn)品編號 |
規(guī)格 |
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DNA&RNA共建庫 |
RNA一、二鏈合成 |
13488ES08/ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T |
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Illumina&MGI DNA建庫 |
13502ES08/ES24/ES96 |
8 T/24 T/96 T |
tNGS多重?cái)U(kuò)增試劑
主推產(chǎn)品:Hieff® HG Multiplex PCR Master Mix Library Prep Kit (Cat#13283)
產(chǎn)品特點(diǎn):
1) 性能優(yōu):高均一性、高特異性和高靈敏度
2) GC兼容廣:兼容GC含量在25%-70%
3) 性能優(yōu):高均一性、高特異性和高靈敏度
4) 操作簡潔:預(yù)混液包含除引物和DNA模板之外所有組分
產(chǎn)品性能:
YS自設(shè)panel 35對GC 70-80;95對GC 27-72.5; 130對GC 27-80,和競品A、B測序比較,結(jié)果顯示,GC含量在25%-70%左右基因區(qū)域均得到穩(wěn)定擴(kuò)增、均一性優(yōu)于競品
表7、不同GCpanel擴(kuò)增測序結(jié)果
圖5、不同GC覆蓋結(jié)果
產(chǎn)品詳情
分類 |
產(chǎn)品名稱 |
產(chǎn)品編號 |
規(guī)格 |
|
tNGS(多重PCR)建庫 |
擴(kuò)增Mix |
13283ES03/ES08/ES50/ES60/ES76 |
1 mL/5×1 mL/50 mL/250 mL/500 mL |
建庫必備
分類 |
產(chǎn)品名稱 |
產(chǎn)品編號 |
規(guī)格 |
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Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina® |
48×4 T/48×16T; 48×4 T/48×16T |
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Hieff NGS® Complete Adapter Kit for MGI® |
8×2 T/8×4 T/8×100 T; 16×2 T/16×4 T/16×100 T; 96×2 T/96×4 T/96×100 T |
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Hieff NGS® 384 CDI Primer for Illumina® |
12413ES02 |
96×2 T; 96×2 T |
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Hieff NGS® Unique Dual Index Primer Kit for MGI® |
13451ES02/ES04; 13452ES02/ES04; 13453ES02/ES04; 13454ES02/ES04; |
48×2 T/48×4 T; 48×2 T/48×4 T; 48×2 T/48×4 T; 48×2 T/48×4 T |
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文庫定量 |
Qubit定量 |
1×dsDNA HS Assay Kit for Qubit® |
12642ES60/ES76 |
100 T/500 T |
dsDNA HS Assay Kit for Qubit® |
12640ES60/ES76 |
100 T/500 T |
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qPCR定量 |
Hieff NGS® Library Quantification Kit for Illumina®, |
12302ES05 |
500 T |
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Hieff NGS® Library Quantification Kit for Illumina®, |
12307ES09 |
6×96 μL |
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磁珠 |
DNA純化 |
Hieff NGS® DNA Selection Beads |
12601ES03/ES08/ES56/ES75 |
1 mL/5 mL/60 mL/450 mL |
RNA純化 |
Hieff NGS® RNA Cleaner |
12602ES03/ES08/ES56/ES75 |
1 mL/5 mL/60 mL/450 mL |