本試劑盒可直接快速地對小鼠組織(如鼠尾、鼠耳、鼠趾等)樣本進(jìn)行PCR擴(kuò)增,具有極強(qiáng)的樣本兼容性。本試劑盒配備了強(qiáng)力的裂解緩沖液,可以快速裂解樣品,釋放基因組DNA。裂解產(chǎn)物可以直接加入到PCR反應(yīng)體系中,無需精提純化,操作方便。此外,本試劑盒對樣品投入量要求低,2-5 mm2鼠耳或肝臟、1-5 mm鼠尾、1-2個腳趾均可進(jìn)行實驗。
本試劑盒提供的2× Hieff® Tissue Direct PCR Mix為2倍濃度的熱啟動PCR反應(yīng)液,包含了用于PCR擴(kuò)增除模板和引物外的所有組分,大大簡化操作過程,降低污染幾率。
該試劑盒可用于轉(zhuǎn)基因鑒定、小鼠基因分型等。
產(chǎn)品組分
編號 |
組分 |
產(chǎn)品編號/規(guī)格 |
|||
10189ES20 (20 T) |
10189ES50 (50 T) |
10189ES70 (200 T) |
10189ES76 (500 T) |
||
10189-A |
Lysis solution a |
5 mL |
12 mL |
4× 12 mL |
10× 12 mL |
10189-B |
Proteinase K (20 mg/ml) |
250 μL |
625 μL |
2× 1.25 mL |
5× 1.25 mL |
10189-C |
2× Hieff® Tissue Direct PCR Mix b |
500 μL |
1.25 mL |
5× 1 mL |
10× 1.25 mL |
a) Lysis solution為裂解液,請戴手套操作。
b) 2× Hieff® Tissue Direct PCR Mix:包含熱啟動Taq DNA聚合酶、dNTP混合物、4 mM Mg2+、PCR反應(yīng)增強(qiáng)劑、穩(wěn)定劑等。
運(yùn)輸方法
干冰運(yùn)輸。
保存方法
1. 組分A:2-8℃保存,有效期1年。若長時間多次使用,請分裝后儲存,避免交叉污染。
2. 組分B/C:-20℃保存,避免反復(fù)凍融。有效期1年。
操作方法
樣品基因組DNA釋放
1. 剪取2-5 mm2鼠耳或肝臟組織,或1-5 mm鼠尾、或1-2個腳趾,置于1.5 mL離心管中;
2. 在上述離心管中加入200 μL Lysis solution和10 μL Proteinase K,輕輕渦旋混勻,使得樣品完全被浸潤,短暫離心;
3. 在恒溫孵育儀中70℃孵育10 min;
4. 孵育完成后,將樣品置于95℃或者沸水浴中加熱5 min滅活Proteinase K;
5. 將裂解產(chǎn)物渦旋振蕩充分混勻后,12000 rpm (13400× g)離心10 min;
6. 將上清轉(zhuǎn)移至新的離心管,-20℃保存不超過48小時或直接取上清用于后續(xù)PCR擴(kuò)增。
【注】:1. 組織應(yīng)盡量剪碎,以便裂解反應(yīng)更順利進(jìn)行。
2. 70℃孵育,一般10 min即可滿足多數(shù)PCR需求。若需要的DNA量較大或樣品較難裂解,可將時間延長至20-30 min。組織塊不需完全裂解,殘余的部分在后續(xù)離心步驟中可被除去。
PCR反應(yīng)體系
組分 |
體積(μL) |
終濃度 |
2× Hieff® Tissue Direct PCR Mix |
25 |
1× |
Forward Primer (10 μM) |
2 |
0.4 μM |
Reverse Primer (10 μM) |
2 |
0.4 μM |
裂解產(chǎn)物 |
1-5 |
- |
ddH2O |
補(bǔ)足至 50 μL |
- |
【注】:各組分使用前應(yīng)充分混勻。
a) 模板使用量:50 μL體系建議初步采用2 μL上清液作為模板起始投入量,若產(chǎn)物量較少,可適當(dāng)增加模板投入量;
b) 引物終濃度:0.2-0.4 μM可以得到較好結(jié)果。反應(yīng)性能較差時,可在0.1-0.5 μM范圍內(nèi)調(diào)整引物濃度;
c) 反應(yīng)體系:推薦使用50 μL,也可根據(jù)使用習(xí)慣調(diào)整體系體積大??;
d) 體系配制:配制好PCR反應(yīng)體系,置于渦旋儀上渦旋混勻,瞬時離心將反應(yīng)液集于管底。
PCR反應(yīng)程序
循環(huán)步驟 |
溫度 |
時間 |
循環(huán)數(shù) |
預(yù)變性 |
95℃ |
5 min |
1 |
變性 |
95℃ |
15 sec |
35 |
退火 |
60℃ |
15 sec |
|
延伸 |
72℃ |
3-10 sec/kb |
|
終延伸 |
72℃ |
5 min |
1 |
【注】:a) 退火溫度:請參考引物的理論Tm值,退火溫度可設(shè)置低于引物理論值 2-5℃。
b) 延伸時間:1-4 kb用3-10 s/kb,4 kb以上用20 s/kb。
c) 擴(kuò)增循環(huán)數(shù):35個循環(huán)已可以擴(kuò)增足量產(chǎn)物。
d) 電泳上樣:取5-7 μL擴(kuò)增產(chǎn)物上樣即可。
對照反應(yīng)
在PCR結(jié)果分析時,不管是陽性結(jié)果或陰性結(jié)果,如果沒有對照反應(yīng),都不能確定結(jié)果是否可靠。為了便于后續(xù)實驗結(jié)果的分析,建議在進(jìn)行PCR時,設(shè)置陽性(小鼠基因組DNA)和陰性(通常為生理鹽水)PCR對照反應(yīng)以便于排除假陽性或假陰性的干擾。
注意事項
1. 為了避免樣本間交叉污染,每次取樣后都需要將取樣器材的刃口或與樣本直接接觸的部位浸入2%次氯酸鈉溶液或75%酒精中,反復(fù)洗刷數(shù)次進(jìn)行清洗,然后用干凈的紙巾擦干殘余液體后再進(jìn)行使用。為了試驗方便,也可準(zhǔn)備多個取樣器材,在使用完后進(jìn)行統(tǒng)一清洗,確保每一單獨樣本均使用的是無污染的取樣器材。
2. 建議使用新鮮采取的動物組織,若為長期冷凍組織,應(yīng)盡量避免反復(fù)凍融,否則會導(dǎo)致模板的降解,影響PCR效率。
3. 建議擴(kuò)增片段長度6 kb以內(nèi),以便擴(kuò)增效率最佳。
4. 為了您的安全和健康,請穿實驗服并佩戴一次性手套操作。
5. 本產(chǎn)品僅作科研用途!
常見問題與解決方法
常見問題 |
可能原因 |
解決方法 |
陽性對照、待測樣本均無條帶。 |
PCR反應(yīng)體系或反應(yīng)條件不合適。 |
使用梯度PCR摸索PCR最佳反應(yīng)條件。 |
PCR試劑保存不當(dāng)失去活性。 |
2× Mouse Direct PCR Mix應(yīng)保存于-20℃,使用時避免反復(fù)凍融。若使用頻繁,可在4℃短時間存放。 |
|
引物設(shè)計問題。 |
嘗試重新設(shè)計引物進(jìn)行檢查。 |
|
陽性對照有目的條帶,待測樣本無條帶或條帶弱。 |
不當(dāng)儲存或長期儲存引起試劑活性喪失。 |
使用新鮮的試劑。 |
加入組織裂解液過量。 |
增大反應(yīng)體系,或減少裂解液的用量。 |
|
樣本裂解混合液保存不當(dāng)或保存時間過久,DNA基因組已經(jīng)降解。 |
裂解混合液液可在4℃保存2-3天,盡量使用新制備的裂解液混合液進(jìn)行PCR。 |
|
模板加入量不適合。 |
在反應(yīng)體系1-10%范圍內(nèi)優(yōu)化模板加入量。 |
|
PCR循環(huán)數(shù)不足。 |
增加PCR的循環(huán)數(shù),推薦在35-40循環(huán)為佳。因為模板復(fù)雜,PCR反應(yīng)要比用純化的DNA模板多5-10個循環(huán)為佳。 |
|
非特異性擴(kuò)增 |
PCR退火溫度太低,循環(huán)數(shù)、引物濃度或模板濃度太高。 |
增加PCR退火溫度,降低PCR循環(huán)數(shù)、引物濃度或模板濃度。 |
PCR引物錯配。 |
重新設(shè)計PCR引物。 |
|
配制PCR反應(yīng)體系時溫度太高或配制完成后放置時間太久。 |
PCR反應(yīng)體系的配制在低溫下進(jìn)行,配制完成后盡快進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng)。 |
|
陰性對照出現(xiàn)目的條帶 |
操作工具或試劑污染。 |
實驗所有試劑或器材均應(yīng)高壓滅菌。操作時應(yīng)小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣槍內(nèi)或濺出離心管外。 |
樣本間交叉污染。 |
每個取樣器只對一個樣本使用;或取完一個樣本后,將取樣器刃口浸入2%的次氯酸鈉溶液中,反復(fù)涮洗,然后用干凈的紙巾擦干殘液。 |
HB220926
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