Blood Advanced Direct PCR Kit是一款可直接對全血樣本進(jìn)行PCR擴增而無需進(jìn)行DNA純化或樣本預(yù)處理的試劑盒,兼容含EDTA、肝素、檸檬酸鹽等常規(guī)抗凝劑的新鮮血液、冷藏(凍)血液及Whatman903®和FTA®商用干血漬。試劑盒中含有經(jīng)過經(jīng)基因工程改造的DNA Polymerase組合,具有保真性高、對PCR抑制劑耐受性強的特點,2× Hieff® Blood Advanced PCR Buffer中添加強力延伸因子、擴增增強因子以及優(yōu)化的緩沖體系,能夠在快速延伸條件下高效擴增8 kb的基因組片段,對于2 kb以下的片段,設(shè)置3-5 sec/kb延伸時間即可完成擴增,從而大幅縮短血液樣本的鑒定及檢測時間。
Hieff® Advanced High-Fidelity DNA Polymerase Mix的擴增產(chǎn)物的3’端為平末端,適用于一步法快速克隆及TOPO克隆試劑盒(Yeasen CAT# 10907/10908/10909/10910/10911/10912/10922)。
試劑盒中提供的引物預(yù)混液Positive control primer mix (10 μM each)能夠從哺乳動物和大多數(shù)脊椎動物的sox21基因上游保守序列中擴增出長度237 bp的片段,可作為陽性對照使用。
產(chǎn)品組分
編號 |
名稱 |
10188ES20 |
10188ES50 |
10188ES60 |
10188ES76 |
10188-A |
2× Hieff® Blood Advanced PCR Buffer |
500 μL |
1.25 mL |
2.5 mL |
12.5 mL |
10188-B |
Hieff® Advanced High-Fidelity DNA Polymerase Mix |
20 μL |
50 μL |
100 μL |
500 μL |
10188-C |
Positive control primer mix (10 μM each) |
100 μL |
100 μL |
200 μL |
500 μL |
10188-D |
10× DNA loading buffer |
1 mL |
1 mL |
1 mL |
1 mL × 5 |
運輸與保存方式
干冰運輸。-20℃保存,有效期1年。
適用范圍
不同類型的全血樣本直接PCR反應(yīng)。
注意事項
1. 推薦血液模板使用量為反應(yīng)總體積的10%,即50 μL反應(yīng)體系中加入5 μL全血作為模板,注意避免吸取血液凝塊。
2. 延伸時間10 sec/kb可擴增8 kb以下大部分目的片段,3-5 sec/kb即可擴增大部分2 kb以下片段。若擴增效率較低,可適當(dāng)延長時間至30 sec/kb。
3. PCR反應(yīng)結(jié)束后,推薦將反應(yīng)產(chǎn)物于4000 rpm (1000× g) 離心1-3 min以沉淀血細(xì)胞碎片,取上清進(jìn)行下游分析。
4. 本產(chǎn)品不可直接用于醫(yī)療診斷。
5. 為了您的安全和健康,請穿實驗服并佩戴一次性手套操作。
PCR反應(yīng)體系a
組分 |
體積 |
ddH2O |
to 50 μL |
2× Hieff® Blood Advanced PCR Buffer |
25 μL |
Forward Primer (10 μM) b |
2 μL |
Reverse Primer (10 μM) b |
2 μL |
Hieff® Advanced High-Fidelity DNA Polymerase Mix |
1 μL |
血液樣本c |
X |
a 使用前請充分混勻各組分。
b 推薦每條引物的使用終濃度為0.4 μM,過高會導(dǎo)致非特異性擴增。
c 最佳全血模板濃度范圍為0.5%-20%,推薦使用量為10%作為初始嘗試條件,即50 μL反應(yīng)體系中加入5 μL全血作為模板,注意避免吸取血液凝塊。對于貯存在Whatman®濾紙卡上的干血漬,則可取約1 mm2帶血漬的圓紙片,無需進(jìn)行預(yù)處理,直接放入PCR反應(yīng)液中即可進(jìn)行擴增。
PCR反應(yīng)條件
循環(huán)步驟 |
溫度 |
時間 |
循環(huán)數(shù) |
預(yù)變性 |
95℃ |
5 min |
1 |
變性 |
95℃ |
15 sec |
30-35 |
退火a |
60℃ |
15 sec |
|
延伸b |
72℃ |
3-10 sec/kb |
|
終延伸 |
72℃ |
5 min |
1 |
a 退火溫度為通用Tm值或低于引物Tm值1-2℃。如果擴增產(chǎn)物特異性較差,可以建立退火溫度梯度以尋找最佳退火條件。
b 延伸時間10 sec/kb可擴增8 kb以下大部分目的片段,3-5 sec/kb即可擴增大部分2 kb以下片段。若擴增效率較低,可適當(dāng)延長時間至20-30 sec/kb,不應(yīng)超過60 sec/kb。
PCR產(chǎn)物分析
PCR反應(yīng)結(jié)束后,推薦將反應(yīng)產(chǎn)物于4000 rpm (1000× g) 離心1-3 min以沉淀血細(xì)胞碎片,取上清進(jìn)行下游分析。該步驟可消除全血中多種殘留成分對電泳檢測的干擾,對使用高濃度血液作為模板的PCR產(chǎn)物尤為必要。通常,5 μL/50 μL (10%)反應(yīng)產(chǎn)物可取30-35 μL上清,3 μL/50 μL (5%)反應(yīng)產(chǎn)物可取40-45 μL上清。若需對PCR產(chǎn)物進(jìn)行其它分析,例如酶切等,應(yīng)將產(chǎn)物稀釋2-4倍以降低反應(yīng)中的鹽及其它抑制劑對反應(yīng)的干擾。
對照反應(yīng)
試劑盒內(nèi)提供引物預(yù)混液Positive Control Primer Mix (10 μM each) 用于陽性對照反應(yīng)??蓮牟溉閯游锛捌渌S多脊椎動物的基因組sox 21基因上游序列中擴增出237 bp的片段,該擴增區(qū)是一段高度保守的非編碼區(qū)。
Primer F: 5'- AGCCCTTGGGGASTTGAATTGCTG -3'
Primer R: 5'- GCACTCCAGAGGACAGCRGTGTCAATA -3'
常見問題與解決方案
無擴增產(chǎn)物或產(chǎn)量少 |
產(chǎn)物呈現(xiàn)高分子量彌散條帶 |
產(chǎn)物呈現(xiàn)低分子量彌散條帶 |
檢查引物設(shè)計,確認(rèn)引物濃度和純度 |
提高退火溫度或設(shè)置退火梯度 |
電泳前離心取上清 |
重復(fù)實驗,確認(rèn)體系、程序無誤 |
延伸時間不應(yīng)過長 |
提高退火溫度或設(shè)置退火梯度 |
增加循環(huán)數(shù) |
嘗試不同的血液用量 |
嘗試不同的血液用量 |
優(yōu)化退火溫度 |
減少循環(huán)數(shù) |
減少循環(huán)數(shù) |
嘗試不同的血液用量 |
降低引物濃度 |
降低引物濃度 |
重新設(shè)計引物 |
重新設(shè)計引物 |
HB220617
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