——Protein A /G 瓊脂糖或磁珠
Protein A、Protein G是最常應(yīng)用于抗體親和純化和免疫沉淀的蛋白。 Protein A/G瓊脂糖或磁珠將Protein A、G共價(jià)偶聯(lián)到介質(zhì)表面,具有結(jié)合能力更強(qiáng)、結(jié)合范圍更廣、實(shí)用性更高的特點(diǎn)。
Protein A/G 4FF Agarose |
Protein A/G MagBeads |
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基質(zhì) |
高度交聯(lián)4%瓊脂糖微球 |
聚合物磁性微球 |
填料粒徑 |
45-165 µm |
1 µm |
載量 |
>20 mg 人IgG/mL |
>50 µg 人IgG/mg |
優(yōu)勢(shì) |
簡(jiǎn)單易用,無(wú)需輔助設(shè)備 |
操作簡(jiǎn)單 |
孔徑大,結(jié)合力強(qiáng) |
直徑小,動(dòng)力學(xué)好 |
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靶蛋白獲取量高 |
表面光滑,beads吸附很少,背景低,抗體消耗少 |
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缺點(diǎn) |
多孔易吸附(需要做pre-clear) |
配套磁力架使用方便 |
1、純化抗體:一步純化即可從血清或腹水樣品中分離出高純度的抗體。
2、免疫沉淀(immunoprecipitation,IP):通過(guò)對(duì)某蛋白質(zhì)的富集,研究該蛋白的特性(如翻譯后修飾等)。
3、免疫共沉淀Co-IP(co-Immunoprecipitation):通過(guò)對(duì)某蛋白質(zhì)的富集,研究與其結(jié)合的其他蛋白(即蛋白-蛋白相互作用、蛋白復(fù)合物等)。
1、Protein A/G 4FF Agarose純化兔血清中的抗體。
圖1 Protein A/G 4FF Agarose純化抗體結(jié)果電泳圖
2、Protein A/G 4FF Agarose用于COIP: 針對(duì)p65和細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶9(CDK9)的特異性抗體對(duì)提取的總細(xì)胞蛋白進(jìn)行免疫沉淀分析。
Fig 2. Immunoprecipitants were then subjected to western blot analysis using specific antibodies against CDK9 and p65.
1、Co-IP背景較深或有雜帶?
① 固相基質(zhì)的非特異性結(jié)合,對(duì)瓊脂糖微球做pre clear或者更換磁珠。
② 抗體結(jié)合非特異的蛋白,可設(shè)置對(duì)照排除非特異性條帶。
③ 洗滌不當(dāng)造成雜帶,可優(yōu)化緩沖液。
2、靶蛋白為什么沒(méi)有條帶?
① 沒(méi)有添加抑制劑或裂解液不合適,導(dǎo)致蛋白構(gòu)象改變不能結(jié)合或者降解。
② 餌蛋白較難洗脫,換成高強(qiáng)度的洗脫緩沖液。
③ 選用的抗體不合適,建議IP驗(yàn)證過(guò)的抗體,并優(yōu)化下抗體用量。
④ 蛋白間為弱相互作用,或者相互作用依賴翻譯后修飾。
3、Input條帶清晰,Co-IP條帶很弱?
① 餌蛋白X和靶蛋白Y的相互作用本身比較弱。
② 餌蛋白X并不是靶蛋白Y的唯一,只部分Y與X互作;可以嘗試反向拉,比如用Y去拉X,可能效果比較好。
4、我的蛋白和抗體重鏈分子量很接近,怎樣減少抗體干擾?
① IP/WB一抗使用不同種屬來(lái)源,選擇與IP抗體種屬無(wú)交叉反應(yīng)的二抗。
② 特殊二抗:比如僅識(shí)別重鏈或者輕鏈的二抗,或者僅識(shí)別天然抗體的二抗。
③ 直接源頭遏制:將抗體交聯(lián)到固相基質(zhì)或protein A/G上,避免洗脫干擾。
5、瓊脂糖難離心,容易吸上來(lái)一點(diǎn),怎么辦?
① 使用帶濾膜的離心柱,下部有接樣管,瓊脂糖完全截留在濾膜上
② 換成磁珠
6、我的目的蛋白因?yàn)闆](méi)有對(duì)應(yīng)的特異性抗體而無(wú)法進(jìn)行免疫沉淀,怎么辦?
① 若此蛋白帶標(biāo)簽,可選擇針對(duì)此蛋白的標(biāo)簽抗體來(lái)進(jìn)行免疫沉淀。
產(chǎn)品名稱 |
貨號(hào) |
規(guī)格(mL) |
價(jià)格(元) |
36403ES03/05/08/25/60 |
1/2/5/25/100 |
278/538/878/2886/7426 |
|
36404ES08/25/60 |
5 /25 /100 |
978/3186/8726 |
|
36417ES03/08 |
1/5 |
787/2937 |
產(chǎn)品名稱 |
貨號(hào) |
規(guī)格(mL) |
價(jià)格(元) |
36401ES08/25/60 |
5 /25 /100 |
546/2186/7426 |
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36402ES08/25/60 |
5 /25 /100 |
866/2656/8856 |
|
36405ES08/25/60 |
5 /25 /100 |
546/2186/7426 |
|
36406ES08/25/60 |
5 /25 /100 |
978/3186/8726 |
|
36407ES08/25/60 |
5 /25 /100 |
2488/9988/16488 |
|
36408ES08/25/60 |
5 /25 /100 |
2868/13288/27688 |
|
36409ES03/08 |
1 mL/5×1 mL |
528/2218 |
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36410ES08/25 |
5 mL/5×5 mL |
1848/6838 |
|
36413ES03/08 |
1 mL/5×1 mL |
528/2218 |
|
36414ES08/25 |
5 mL/5×5 mL |
1848/6838 |
|
36415ES03/08 |
1 mL/5×1 mL |
938/3748 |
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36416ES08/25 |
5 mL/5×5 mL |
3528/14088 |
文獻(xiàn)引用
[1] Wang X , Yu C , Wang C , et al. Novel cyclin-dependent kinase 9 (CDK9) inhibitor with suppression of cancer stemness activity against non-small-cell lung cancer[J]. European Journal of Medicinal Chemistry, 2019, 181. IF: 5.201
[2] Zheng L, Xiang C, Li X, et al. STARD13-correlated ceRNA network-directed inhibition on YAP/TAZ activity suppresses stemness of breast cancer via co-regulating Hippo and Rho-GTPase/F-actin signaling[J]. Journal of hematology & oncology, 2018, 11(1): 72. IF:7.33
[3] Gao L, Guo Q, Li X, et al. MiR-873/PD-L1 axis regulates the stemness of breast cancer cells[J]. EBioMedicine, 2019, 41: 395-407. IF:6.68